Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0L4

CSTF2T, Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2TQ9H0L4 SMG7-206ENST00000444547 580 ntTSL 417.15■□□□□ 0.342e-7■■■■■ 29.2
CSTF2TQ9H0L4 SMG7-213ENST00000507691 760 ntTSL 516.29■□□□□ 0.22e-7■■■■■ 29.2
CSTF2TQ9H0L4 SMG7-204ENST00000419169 2483 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.17■□□□□ 0.182e-7■■■■■ 29.2
CSTF2TQ9H0L4 SMG7-214ENST00000508461 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 29.2
CSTF2TQ9H0L4 SMG7-212ENST00000507469 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.672e-7■■■■■ 29.2
CSTF2TQ9H0L4 SMG7-201ENST00000347615 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.832e-7■■■■■ 29.2
CSTF2TQ9H0L4 SMG7-215ENST00000515829 5629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.882e-7■■■■■ 29.2
CSTF2TQ9H0L4 SMG7-216ENST00000638826 219 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.132e-7■■■■■ 29.2
CSTF2TQ9H0L4 SMG7-202ENST00000367537 5970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.142e-7■■■■■ 29.2
CSTF2TQ9H0L4 BCAT1-201ENST00000261192 9674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.662e-8■■■■■ 29.2
CSTF2TQ9H0L4 BCAT1-206ENST00000539780 1360 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.112e-8■■■■■ 29.2
CSTF2TQ9H0L4 BCAT1-202ENST00000342945 4319 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.22e-8■■■■■ 29.2
CSTF2TQ9H0L4 BCAT1-209ENST00000546285 549 ntTSL 45.68□□□□□ -1.52e-8■■■■■ 29.2
CSTF2TQ9H0L4 PTPRJ-206ENST00000534219 546 ntTSL 323.55■■□□□ 1.364e-6■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 PTPRJ-205ENST00000527952 626 ntTSL 522.82■■□□□ 1.244e-6■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.844e-6■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.724e-6■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.494e-6■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.294e-6■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 ENOX2-206ENST00000492263 819 ntTSL 319.88■□□□□ 0.771e-8■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 ENOX2-205ENST00000432489 1515 ntTSL 1 (best)19.6■□□□□ 0.731e-8■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.461e-8■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 ENOX2-201ENST00000338144 4263 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.511e-8■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 ENOX2-203ENST00000370935 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.621e-8■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.443e-7■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 MXI1-207ENST00000453116 803 ntTSL 523.03■■□□□ 1.283e-7■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 MXI1-208ENST00000460667 782 ntTSL 322.3■■□□□ 1.163e-7■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.053e-7■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.073e-7■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 MXI1-203ENST00000361248 2188 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.263e-7■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 CMIP-204ENST00000561605 407 ntTSL 59.66□□□□□ -0.866e-7■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 TSPAN4-219ENST00000530404 818 ntTSL 519.68■□□□□ 0.742e-7■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.527e-9■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 MBP-219ENST00000487778 913 ntTSL 318.11■□□□□ 0.497e-9■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.017e-9■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 PARD6G-AS1-203ENST00000587254 584 ntTSL 413.85□□□□□ -0.197e-9■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 PARD6G-AS1-201ENST00000585422 525 ntTSL 413.85□□□□□ -0.197e-9■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.37e-9■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.347e-9■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 MBP-225ENST00000497479 889 ntTSL 311.76□□□□□ -0.537e-9■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 PARD6G-AS1-202ENST00000586421 3333 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.767e-9■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 CLHC1-202ENST00000403506 430 ntTSL 510.15□□□□□ -0.787e-9■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 MBP-221ENST00000490754 531 ntTSL 48.21□□□□□ -1.17e-9■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 MBP-206ENST00000397863 4800 ntTSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.17e-9■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 CLHC1-206ENST00000425841 499 ntTSL 48.13□□□□□ -1.117e-9■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 CLHC1-210ENST00000464243 509 ntTSL 47.86□□□□□ -1.157e-9■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 CLHC1-209ENST00000463300 572 ntTSL 47.56□□□□□ -1.27e-9■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 CLHC1-207ENST00000428621 2052 ntTSL 27.45□□□□□ -1.227e-9■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 MBP-241ENST00000581878 563 ntTSL 47.3□□□□□ -1.247e-9■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.397e-9■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 CLHC1-212ENST00000487320 594 ntTSL 46.25□□□□□ -1.417e-9■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 MBP-246ENST00000583798 573 ntTSL 45.64□□□□□ -1.517e-9■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 CLHC1-213ENST00000494539 596 ntTSL 45.39□□□□□ -1.557e-9■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.567e-9■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 CLHC1-208ENST00000451916 616 ntTSL 35.3□□□□□ -1.567e-9■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.787e-9■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 CLHC1-211ENST00000466020 153 ntTSL 52.61□□□□□ -1.997e-9■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 STIP1-208ENST00000540501 880 ntTSL 323.6■■□□□ 1.373e-9■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.133e-9■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.173e-9■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.253e-9■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 STIP1-204ENST00000536973 738 ntTSL 511.61□□□□□ -0.553e-9■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 STIP1-211ENST00000543847 772 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.893e-9■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 STIP1-209ENST00000540736 399 ntTSL 25.12□□□□□ -1.593e-9■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.27e-7■■■■■ 29.1
CSTF2TQ9H0L4 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC13.67□□□□□ -0.221e-10■■■■■ 29
CSTF2TQ9H0L4 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.382e-7■■■■■ 29
CSTF2TQ9H0L4 MTHFD1L-207ENST00000441122 1134 ntTSL 517.01■□□□□ 0.312e-7■■■■■ 29
CSTF2TQ9H0L4 EGLN2-215ENST00000598654 590 ntTSL 321.28■■□□□ 16e-10■■■■■ 29
CSTF2TQ9H0L4 RAB4B-EGLN2-203ENST00000601949 482 ntTSL 417.37■□□□□ 0.376e-10■■■■■ 29
CSTF2TQ9H0L4 RAB4B-EGLN2-202ENST00000596216 624 ntTSL 312.45□□□□□ -0.426e-10■■■■■ 29
CSTF2TQ9H0L4 BAIAP2L1-202ENST00000462558 1250 ntTSL 1 (best)16.19■□□□□ 0.186e-8■■■■■ 29
CSTF2TQ9H0L4 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.476e-8■■■■■ 29
CSTF2TQ9H0L4 HPRT1-202ENST00000462974 724 ntTSL 314.79□□□□□ -0.049e-8■■■■■ 29
CSTF2TQ9H0L4 HPRT1-201ENST00000298556 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.819e-8■■■■■ 29
CSTF2TQ9H0L4 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.275e-10■■■■■ 29
CSTF2TQ9H0L4 TSPAN4-215ENST00000525334 860 ntTSL 317.32■□□□□ 0.362e-7■■■■■ 29
CSTF2TQ9H0L4 PKNOX1-202ENST00000418336 459 ntTSL 219.2■□□□□ 0.662e-10■■■■■ 29
CSTF2TQ9H0L4 PKNOX1-206ENST00000480179 1725 ntTSL 212.87□□□□□ -0.352e-10■■■■■ 29
CSTF2TQ9H0L4 PKNOX1-201ENST00000291547 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.762e-10■■■■■ 29
CSTF2TQ9H0L4 PKNOX1-203ENST00000432907 5180 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.792e-10■■■■■ 29
CSTF2TQ9H0L4 ARHGAP19-SLIT1-202ENST00000479633 1876 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.854e-7■■■■■ 28.9
CSTF2TQ9H0L4 ARHGAP19-201ENST00000358308 5390 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.854e-7■■■■■ 28.9
CSTF2TQ9H0L4 ARHGAP19-202ENST00000358531 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -14e-7■■■■■ 28.9
CSTF2TQ9H0L4 ARHGAP19-203ENST00000371027 2301 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.014e-7■■■■■ 28.9
CSTF2TQ9H0L4 ARHGAP19-206ENST00000492211 5525 ntTSL 27.92□□□□□ -1.144e-7■■■■■ 28.9
CSTF2TQ9H0L4 ARHGAP19-205ENST00000487035 4553 ntTSL 26.47□□□□□ -1.374e-7■■■■■ 28.9
CSTF2TQ9H0L4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.542e-7■■■■■ 28.9
CSTF2TQ9H0L4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.052e-7■■■■■ 28.9
CSTF2TQ9H0L4 MROH1-204ENST00000527071 680 ntTSL 312.02□□□□□ -0.494e-7■■■■■ 28.9
CSTF2TQ9H0L4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.382e-7■■■■■ 28.9
CSTF2TQ9H0L4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.062e-7■■■■■ 28.9
CSTF2TQ9H0L4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.032e-7■■■■■ 28.9
CSTF2TQ9H0L4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.742e-7■■■■■ 28.9
CSTF2TQ9H0L4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.624e-7■■■■■ 28.9
CSTF2TQ9H0L4 EIPR1-204ENST00000435721 672 ntTSL 317.72■□□□□ 0.434e-7■■■■■ 28.9
CSTF2TQ9H0L4 EIPR1-203ENST00000406835 738 ntTSL 517.72■□□□□ 0.434e-7■■■■■ 28.9
CSTF2TQ9H0L4 EIPR1-207ENST00000444776 594 ntTSL 416.45■□□□□ 0.224e-7■■■■■ 28.9
CSTF2TQ9H0L4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.185e-7■■■■■ 28.9
CSTF2TQ9H0L4 EIPR1-205ENST00000441271 647 ntTSL 516.05■□□□□ 0.164e-7■■■■■ 28.9
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