RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.26■■■■■ 7.24
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PTPRJ-205ENST00000527952 NACADO15069 1562 aa51.07■■■■■ 5.77
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PTPRJ-205ENST00000527952 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.94■■■■■ 5.43
PTPRJ-205ENST00000527952 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.8■■■■■ 5.4
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PTPRJ-205ENST00000527952 SMARCA4P51532 1647 aa47.03■■■■■ 5.12
PTPRJ-205ENST00000527952 SMARCA2P51531 1590 aa46.88■■■■■ 5.1
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PTPRJ-205ENST00000527952 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.98■■■■■ 4.95
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PTPRJ-205ENST00000527952 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.77■■■■■ 4.92
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PTPRJ-205ENST00000527952 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.49■■■■■ 4.87
PTPRJ-205ENST00000527952 WDR62O43379 1518 aa45.36■■■■■ 4.85
PTPRJ-205ENST00000527952 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.31■■■■■ 4.84
PTPRJ-205ENST00000527952 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.29■■■■■ 4.84
PTPRJ-205ENST00000527952 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.29■■■■■ 4.84
PTPRJ-205ENST00000527952 CFTRP13569 1480 aa45.22■■■■■ 4.83
PTPRJ-205ENST00000527952 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.95■■■■■ 4.79
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PTPRJ-205ENST00000527952 TRIM41Q8WV44 630 aa44.81■■■■■ 4.76
PTPRJ-205ENST00000527952 PRDM2Q13029 1718 aa44.79■■■■■ 4.76
PTPRJ-205ENST00000527952 OSCARQ8IYS5 282 aa44.55■■■■■ 4.72
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.44■■■■■ 4.7
PTPRJ-205ENST00000527952 TOPBP1Q92547 1522 aa44.43■■■■■ 4.7
PTPRJ-205ENST00000527952 IFT140Q96RY7 1462 aa44.39■■■■■ 4.7
PTPRJ-205ENST00000527952 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.23■■■■■ 4.67
PTPRJ-205ENST00000527952 ABCC8Q09428 1581 aa44.21■■■■■ 4.67
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PTPRJ-205ENST00000527952 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.02■■■■■ 4.64
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PTPRJ-205ENST00000527952 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.02■■■■■ 4.64
PTPRJ-205ENST00000527952 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.02■■■■■ 4.64
PTPRJ-205ENST00000527952 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.96■■■■■ 4.63
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PTPRJ-205ENST00000527952 CHD1O14646 1710 aa43.87■■■■■ 4.61
PTPRJ-205ENST00000527952 ARHGEF11O15085 1522 aa43.84■■■■■ 4.61
PTPRJ-205ENST00000527952 FBLN2P98095 1184 aa43.81■■■■■ 4.6
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PTPRJ-205ENST00000527952 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.77■■■■■ 4.6
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PTPRJ-205ENST00000527952 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.55■■■■■ 4.56
PTPRJ-205ENST00000527952 WDR97A6NE52 1622 aa43.43■■■■■ 4.54
PTPRJ-205ENST00000527952 ARAP1Q96P48 1450 aa43.43■■■■■ 4.54
PTPRJ-205ENST00000527952 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.4■■■■■ 4.54
PTPRJ-205ENST00000527952 GRIN2BQ13224 1484 aa43.36■■■■■ 4.53
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PTPRJ-205ENST00000527952 PBRM1Q86U86 1689 aa43.26■■■■■ 4.52
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PTPRJ-205ENST00000527952 SYNJ1O43426 1573 aa43.24■■■■■ 4.51
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PTPRJ-205ENST00000527952 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.97■■■■■ 4.47
PTPRJ-205ENST00000527952 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.92■■■■■ 4.46
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PTPRJ-205ENST00000527952 ADAMTS12P58397 1594 aa42.8■■■■■ 4.44
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PTPRJ-205ENST00000527952 CEP170Q5SW79 1584 aa42.72■■■■■ 4.43
PTPRJ-205ENST00000527952 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.65■■■■■ 4.42
PTPRJ-205ENST00000527952 NUP160Q12769 1436 aa42.64■■■■■ 4.42
PTPRJ-205ENST00000527952 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.58■■■■■ 4.41
PTPRJ-205ENST00000527952 SHROOM2Q13796 1616 aa42.46■■■■■ 4.39
PTPRJ-205ENST00000527952 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.32■■■■■ 4.37
PTPRJ-205ENST00000527952 JPH4Q96JJ6 628 aa42.29■■■■■ 4.36
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PTPRJ-205ENST00000527952 IGF1RP08069 1367 aa42.11■■■■■ 4.33
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