RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460667.5

MXI1-208, Transcript of MAX interactor 1, dimerization protein, human

TSL 3

Gene MXI1, Length 782 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MXI1-208	ENST00000460667	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		58.99	■■■■■ 7.03
MXI1-208	ENST00000460667	ABCC9	O60706	1549 aa		52.95	■■■■■ 6.07
MXI1-208	ENST00000460667	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		52.93	■■■■■ 6.06
MXI1-208	ENST00000460667	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		50.33	■■■■■ 5.65
MXI1-208	ENST00000460667	NACAD	O15069	1562 aa		49.95	■■■■■ 5.59
MXI1-208	ENST00000460667	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		49.86	■■■■■ 5.57
MXI1-208	ENST00000460667	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		49.59	■■■■■ 5.53
MXI1-208	ENST00000460667	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		49.43	■■■■■ 5.5
MXI1-208	ENST00000460667	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	49.3	■■■■■ 5.48
MXI1-208	ENST00000460667	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		49.18	■■■■■ 5.46
MXI1-208	ENST00000460667	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		48.94	■■■■■ 5.43
MXI1-208	ENST00000460667	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	48.91	■■■■■ 5.42
MXI1-208	ENST00000460667	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		48.63	■■■■■ 5.37
MXI1-208	ENST00000460667	SCRIB	Q14160	1630 aa		48.36	■■■■■ 5.33
MXI1-208	ENST00000460667	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		48.04	■■■■■ 5.28
MXI1-208	ENST00000460667	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		47.82	■■■■■ 5.25
MXI1-208	ENST00000460667	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	47.7	■■■■■ 5.23
MXI1-208	ENST00000460667	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		47.6	■■■■■ 5.21
MXI1-208	ENST00000460667	NCAPD3	P42695	1498 aa		46.08	■■■■■ 4.97
MXI1-208	ENST00000460667	SMARCA4	P51532	1647 aa		46.07	■■■■■ 4.97
MXI1-208	ENST00000460667	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		46.02	■■■■■ 4.96
MXI1-208	ENST00000460667	SMARCA2	P51531	1590 aa		45.88	■■■■■ 4.93
MXI1-208	ENST00000460667	HMGXB3	Q12766	1538 aa		45.79	■■■■■ 4.92
MXI1-208	ENST00000460667	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	45.77	■■■■■ 4.92
MXI1-208	ENST00000460667	ERCC6	Q03468	1493 aa		45.64	■■■■■ 4.9
MXI1-208	ENST00000460667	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	45.61	■■■■■ 4.89
MXI1-208	ENST00000460667	NES	P48681	1621 aa		45.54	■■■■■ 4.88
MXI1-208	ENST00000460667	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		45.54	■■■■■ 4.88
MXI1-208	ENST00000460667	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		45.52	■■■■■ 4.88
MXI1-208	ENST00000460667	CUX2	O14529	1486 aa		45.44	■■■■■ 4.87
MXI1-208	ENST00000460667	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		45.35	■■■■■ 4.85
MXI1-208	ENST00000460667	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		45.1	■■■■■ 4.81
MXI1-208	ENST00000460667	WIZ	O95785	1651 aa		45.07	■■■■■ 4.81
MXI1-208	ENST00000460667	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	45.03	■■■■■ 4.8
MXI1-208	ENST00000460667	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		45.02	■■■■■ 4.8
MXI1-208	ENST00000460667	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		44.77	■■■■■ 4.76
MXI1-208	ENST00000460667	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		44.7	■■■■■ 4.75
MXI1-208	ENST00000460667	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	44.55	■■■■■ 4.72
MXI1-208	ENST00000460667	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		44.46	■■■■■ 4.71
MXI1-208	ENST00000460667	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	44.38	■■■■■ 4.69
MXI1-208	ENST00000460667	WDR62	O43379	1518 aa		44.35	■■■■■ 4.69
MXI1-208	ENST00000460667	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		44.3	■■■■■ 4.68
MXI1-208	ENST00000460667	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		44.27	■■■■■ 4.68
MXI1-208	ENST00000460667	CFTR	P13569	1480 aa		44.22	■■■■■ 4.67
MXI1-208	ENST00000460667	PRDM2	Q13029	1718 aa		43.98	■■■■■ 4.63
MXI1-208	ENST00000460667	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	43.94	■■■■■ 4.63
MXI1-208	ENST00000460667	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		43.89	■■■■■ 4.62
MXI1-208	ENST00000460667	TRIM41	Q8WV44	630 aa		43.55	■■■■■ 4.56
MXI1-208	ENST00000460667	TOPBP1	Q92547	1522 aa		43.45	■■■■■ 4.55
MXI1-208	ENST00000460667	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	43.42	■■■■■ 4.54
MXI1-208	ENST00000460667	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		43.38	■■■■■ 4.53
MXI1-208	ENST00000460667	IFT140	Q96RY7	1462 aa		43.37	■■■■■ 4.53
MXI1-208	ENST00000460667	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		43.3	■■■■■ 4.52
MXI1-208	ENST00000460667	ABCC8	Q09428	1581 aa		43.23	■■■■■ 4.51
MXI1-208	ENST00000460667	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	43.2	■■■■■ 4.51
MXI1-208	ENST00000460667	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	43.11	■■■■■ 4.49
MXI1-208	ENST00000460667	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	43.01	■■■■■ 4.48
MXI1-208	ENST00000460667	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	43	■■■■■ 4.47
MXI1-208	ENST00000460667	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		42.99	■■■■■ 4.47
MXI1-208	ENST00000460667	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		42.99	■■■■■ 4.47
MXI1-208	ENST00000460667	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		42.99	■■■■■ 4.47
MXI1-208	ENST00000460667	CHD1	O14646	1710 aa		42.95	■■■■■ 4.47
MXI1-208	ENST00000460667	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		42.92	■■■■■ 4.46
MXI1-208	ENST00000460667	ARHGEF11	O15085	1522 aa		42.79	■■■■■ 4.44
MXI1-208	ENST00000460667	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		42.78	■■■■■ 4.44
MXI1-208	ENST00000460667	SOGA1	O94964	1423 aa		42.78	■■■■■ 4.44
MXI1-208	ENST00000460667	CUX1	P39880	1505 aa		42.77	■■■■■ 4.44
MXI1-208	ENST00000460667	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	42.75	■■■■■ 4.43
MXI1-208	ENST00000460667	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	42.73	■■■■■ 4.43
MXI1-208	ENST00000460667	FBLN2	P98095	1184 aa		42.71	■■■■■ 4.43
MXI1-208	ENST00000460667	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		42.57	■■■■■ 4.41
MXI1-208	ENST00000460667	WDR97	A6NE52	1622 aa		42.53	■■■■■ 4.4
MXI1-208	ENST00000460667	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		42.46	■■■■■ 4.39
MXI1-208	ENST00000460667	PBRM1	Q86U86	1689 aa		42.41	■■■■■ 4.38
MXI1-208	ENST00000460667	GRIN2B	Q13224	1484 aa		42.39	■■■■■ 4.38
MXI1-208	ENST00000460667	ARAP1	Q96P48	1450 aa		42.39	■■■■■ 4.38
MXI1-208	ENST00000460667	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	42.36	■■■■■ 4.37
MXI1-208	ENST00000460667	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	42.33	■■■■■ 4.37
MXI1-208	ENST00000460667	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		42.31	■■■■■ 4.36
MXI1-208	ENST00000460667	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		42.28	■■■■■ 4.36
MXI1-208	ENST00000460667	SYNJ1	O43426	1573 aa		42.27	■■■■■ 4.36
MXI1-208	ENST00000460667	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		42.24	■■■■■ 4.35
MXI1-208	ENST00000460667	SYNJ2	O15056	1496 aa		42.24	■■■■■ 4.35
MXI1-208	ENST00000460667	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		42.22	■■■■■ 4.35
MXI1-208	ENST00000460667	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		42.11	■■■■■ 4.33
MXI1-208	ENST00000460667	TOP2B	Q02880	1626 aa		42.07	■■■■■ 4.33
MXI1-208	ENST00000460667	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	42.03	■■■■■ 4.32
MXI1-208	ENST00000460667	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	41.98	■■■■■ 4.31
MXI1-208	ENST00000460667	ADAMTS12	P58397	1594 aa		41.93	■■■■■ 4.3
MXI1-208	ENST00000460667	GRIN2A	Q12879	1464 aa		41.88	■■■■■ 4.29
MXI1-208	ENST00000460667	CEP170	Q5SW79	1584 aa		41.8	■■■■■ 4.28
MXI1-208	ENST00000460667	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		41.78	■■■■■ 4.28
MXI1-208	ENST00000460667	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		41.7	■■■■■ 4.27
MXI1-208	ENST00000460667	NUP160	Q12769	1436 aa		41.69	■■■■■ 4.27
MXI1-208	ENST00000460667	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		41.69	■■■■■ 4.26
MXI1-208	ENST00000460667	SHROOM2	Q13796	1616 aa		41.58	■■■■■ 4.25
MXI1-208	ENST00000460667	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		41.34	■■■■■ 4.21
MXI1-208	ENST00000460667	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	41.33	■■■■■ 4.21
MXI1-208	ENST00000460667	JPH4	Q96JJ6	628 aa		41.26	■■■■■ 4.2
MXI1-208	ENST00000460667	KIF27	Q86VH2	1401 aa		41.18	■■■■■ 4.18

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