RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.15■■■■□ 3.38
PTPRJ-202ENST00000440289 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.15■■■□□ 2.74
PTPRJ-202ENST00000440289 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
PTPRJ-202ENST00000440289 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.32■■■□□ 2.6
PTPRJ-202ENST00000440289 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.57■■■□□ 2.48
PTPRJ-202ENST00000440289 PCGF6Q9BYE7 350 aa30.5■■■□□ 2.47
PTPRJ-202ENST00000440289 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
PTPRJ-202ENST00000440289 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.36■■■□□ 2.45
PTPRJ-202ENST00000440289 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.21■■■□□ 2.43
PTPRJ-202ENST00000440289 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
PTPRJ-202ENST00000440289 HRCP23327 699 aa30.14■■■□□ 2.42
PTPRJ-202ENST00000440289 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.07■■■□□ 2.4
PTPRJ-202ENST00000440289 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.95■■■□□ 2.38
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
PTPRJ-202ENST00000440289 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.35■■■□□ 2.29
PTPRJ-202ENST00000440289 ABCC9O60706 1549 aa29.27■■■□□ 2.28
PTPRJ-202ENST00000440289 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
PTPRJ-202ENST00000440289 TRIM41Q8WV44 630 aa29.16■■■□□ 2.26
PTPRJ-202ENST00000440289 SCRIBQ14160 1630 aa29.08■■■□□ 2.25
PTPRJ-202ENST00000440289 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
PTPRJ-202ENST00000440289 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
PTPRJ-202ENST00000440289 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.54■■■□□ 2.16
PTPRJ-202ENST00000440289 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
PTPRJ-202ENST00000440289 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.49■■■□□ 2.15
PTPRJ-202ENST00000440289 NACADO15069 1562 aa28.49■■■□□ 2.15
PTPRJ-202ENST00000440289 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
PTPRJ-202ENST00000440289 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
PTPRJ-202ENST00000440289 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
PTPRJ-202ENST00000440289 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.24■■■□□ 2.11
PTPRJ-202ENST00000440289 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.15■■■□□ 2.1
PTPRJ-202ENST00000440289 WIZO95785 1651 aa28.08■■■□□ 2.09
PTPRJ-202ENST00000440289 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
PTPRJ-202ENST00000440289 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
PTPRJ-202ENST00000440289 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
PTPRJ-202ENST00000440289 NEUROD1Q13562 356 aa27.9■■■□□ 2.06
PTPRJ-202ENST00000440289 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
PTPRJ-202ENST00000440289 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa27.78■■■□□ 2.04
PTPRJ-202ENST00000440289 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
PTPRJ-202ENST00000440289 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
PTPRJ-202ENST00000440289 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.74■■■□□ 2.03
PTPRJ-202ENST00000440289 ABCC8Q09428 1581 aa27.73■■■□□ 2.03
PTPRJ-202ENST00000440289 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
PTPRJ-202ENST00000440289 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
PTPRJ-202ENST00000440289 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
PTPRJ-202ENST00000440289 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.58■■■□□ 2.01
PTPRJ-202ENST00000440289 SMARCA4P51532 1647 aa27.56■■■□□ 2
PTPRJ-202ENST00000440289 SOGA1O94964 1423 aa27.52■■■□□ 2
PTPRJ-202ENST00000440289 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.49■■□□□ 1.99
PTPRJ-202ENST00000440289 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.46■■□□□ 1.99
PTPRJ-202ENST00000440289 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.45■■□□□ 1.99
PTPRJ-202ENST00000440289 CEP162Q5TB80 1403 aa27.44■■□□□ 1.98
PTPRJ-202ENST00000440289 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
PTPRJ-202ENST00000440289 APLP2Q06481 763 aa27.36■■□□□ 1.97
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
PTPRJ-202ENST00000440289 SMARCA2P51531 1590 aa27.32■■□□□ 1.96
PTPRJ-202ENST00000440289 MIER1Q8N108 512 aa27.27■■□□□ 1.96
PTPRJ-202ENST00000440289 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
PTPRJ-202ENST00000440289 ITGAEP38570 1179 aa27.14■■□□□ 1.94
PTPRJ-202ENST00000440289 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRJ-202ENST00000440289 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRJ-202ENST00000440289 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
PTPRJ-202ENST00000440289 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.96■■□□□ 1.91
PTPRJ-202ENST00000440289 GOLGA3Q08378 1498 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRJ-202ENST00000440289 CLIP1P30622 1438 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRJ-202ENST00000440289 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRJ-202ENST00000440289 SYNJ1O43426 1573 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRJ-202ENST00000440289 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
PTPRJ-202ENST00000440289 EEA1Q15075 1411 aa26.71■■□□□ 1.87
PTPRJ-202ENST00000440289 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.7■■□□□ 1.86
PTPRJ-202ENST00000440289 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
PTPRJ-202ENST00000440289 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.65■■□□□ 1.86
PTPRJ-202ENST00000440289 BCANQ96GW7 911 aa26.63■■□□□ 1.85
PTPRJ-202ENST00000440289 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRJ-202ENST00000440289 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
PTPRJ-202ENST00000440289 P3H3Q8IVL6 736 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRJ-202ENST00000440289 KCNH8Q96L42 1107 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRJ-202ENST00000440289 NCAPD3P42695 1498 aa26.48■■□□□ 1.83
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
PTPRJ-202ENST00000440289 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
PTPRJ-202ENST00000440289 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
PTPRJ-202ENST00000440289 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
PTPRJ-202ENST00000440289 KIF21BO75037 1637 aa26.33■■□□□ 1.81
PTPRJ-202ENST00000440289 HMGXB3Q12766 1538 aa26.31■■□□□ 1.8
PTPRJ-202ENST00000440289 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.31■■□□□ 1.8
PTPRJ-202ENST00000440289 TOP2BQ02880 1626 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRJ-202ENST00000440289 CUX1P39880 1505 aa26.25■■□□□ 1.79
PTPRJ-202ENST00000440289 CFTRP13569 1480 aa26.21■■□□□ 1.79
PTPRJ-202ENST00000440289 TRIM52Q96A61 297 aa26.2■■□□□ 1.78
PTPRJ-202ENST00000440289 MYT1Q01538 1121 aa26.17■■□□□ 1.78
PTPRJ-202ENST00000440289 FKBP8Q14318 412 aa26.17■■□□□ 1.78
PTPRJ-202ENST00000440289 ARAP1Q96P48 1450 aa26.16■■□□□ 1.78
PTPRJ-202ENST00000440289 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRJ-202ENST00000440289 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRJ-202ENST00000440289 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.1■■□□□ 1.77
PTPRJ-202ENST00000440289 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.09■■□□□ 1.77
PTPRJ-202ENST00000440289 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.09■■□□□ 1.77
PTPRJ-202ENST00000440289 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.07■■□□□ 1.76
PTPRJ-202ENST00000440289 KIF27Q86VH2 1401 aa26.06■■□□□ 1.76
PTPRJ-202ENST00000440289 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.04■■□□□ 1.76
PTPRJ-202ENST00000440289 PRXQ9BXM0 1461 aa26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms