RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.67■■■■□ 3.46
PTPRJ-208ENST00000615445 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.3■■■■□ 3.4
PTPRJ-208ENST00000615445 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.91■■■■□ 3.18
PTPRJ-208ENST00000615445 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.55■■■■□ 3.12
PTPRJ-208ENST00000615445 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.46■■■□□ 2.95
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.84■■■□□ 2.85
PTPRJ-208ENST00000615445 APLP2Q06481 763 aa32.58■■■□□ 2.81
PTPRJ-208ENST00000615445 TRIM41Q8WV44 630 aa32.34■■■□□ 2.77
PTPRJ-208ENST00000615445 PCGF6Q9BYE7 350 aa32.3■■■□□ 2.76
PTPRJ-208ENST00000615445 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.28■■■□□ 2.76
PTPRJ-208ENST00000615445 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.06■■■□□ 2.72
PTPRJ-208ENST00000615445 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.81■■■□□ 2.68
PTPRJ-208ENST00000615445 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
PTPRJ-208ENST00000615445 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP31.56■■■□□ 2.64
PTPRJ-208ENST00000615445 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
PTPRJ-208ENST00000615445 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP31.47■■■□□ 2.63
PTPRJ-208ENST00000615445 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
PTPRJ-208ENST00000615445 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.34■■■□□ 2.61
PTPRJ-208ENST00000615445 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.2■■■□□ 2.58
PTPRJ-208ENST00000615445 ABCC9O60706 1549 aa31.11■■■□□ 2.57
PTPRJ-208ENST00000615445 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
PTPRJ-208ENST00000615445 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
PTPRJ-208ENST00000615445 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.87■■■□□ 2.53
PTPRJ-208ENST00000615445 ITGAEP38570 1179 aa30.69■■■□□ 2.5
PTPRJ-208ENST00000615445 HRCP23327 699 aa30.65■■■□□ 2.5
PTPRJ-208ENST00000615445 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
PTPRJ-208ENST00000615445 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
PTPRJ-208ENST00000615445 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
PTPRJ-208ENST00000615445 NEFLP07196 543 aa30.27■■■□□ 2.44
PTPRJ-208ENST00000615445 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.21■■■□□ 2.43
PTPRJ-208ENST00000615445 ERICH6Q7L0X2 663 aa30.11■■■□□ 2.41
PTPRJ-208ENST00000615445 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
PTPRJ-208ENST00000615445 POLR3GLQ9BT43 218 aa30.05■■■□□ 2.4
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PTPRJ-208ENST00000615445 SCRIBQ14160 1630 aa29.87■■■□□ 2.37
PTPRJ-208ENST00000615445 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.84■■■□□ 2.37
PTPRJ-208ENST00000615445 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
PTPRJ-208ENST00000615445 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.68■■■□□ 2.34
PTPRJ-208ENST00000615445 TRIM52Q96A61 297 aa29.68■■■□□ 2.34
PTPRJ-208ENST00000615445 FBLN2P98095 1184 aa29.67■■■□□ 2.34
PTPRJ-208ENST00000615445 NEUROD1Q13562 356 aa29.62■■■□□ 2.33
PTPRJ-208ENST00000615445 P3H3Q8IVL6 736 aa29.6■■■□□ 2.33
PTPRJ-208ENST00000615445 ARID3CA6NKF2 412 aa29.41■■■□□ 2.3
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.27
PTPRJ-208ENST00000615445 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
PTPRJ-208ENST00000615445 ANP32CO43423 234 aa29.1■■■□□ 2.25
PTPRJ-208ENST00000615445 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
PTPRJ-208ENST00000615445 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.09■■■□□ 2.25
PTPRJ-208ENST00000615445 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.08■■■□□ 2.25
PTPRJ-208ENST00000615445 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
PTPRJ-208ENST00000615445 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa28.92■■■□□ 2.22
PTPRJ-208ENST00000615445 NACADO15069 1562 aa28.9■■■□□ 2.22
PTPRJ-208ENST00000615445 MYT1Q01538 1121 aa28.86■■■□□ 2.21
PTPRJ-208ENST00000615445 BCANQ96GW7 911 aa28.85■■■□□ 2.21
PTPRJ-208ENST00000615445 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.8■■■□□ 2.2
PTPRJ-208ENST00000615445 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.79■■■□□ 2.2
PTPRJ-208ENST00000615445 CLIP1P30622 1438 aa28.76■■■□□ 2.19
PTPRJ-208ENST00000615445 TONSLQ96HA7 1378 aa28.71■■■□□ 2.19
PTPRJ-208ENST00000615445 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.7■■■□□ 2.19
PTPRJ-208ENST00000615445 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.66■■■□□ 2.18
PTPRJ-208ENST00000615445 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
PTPRJ-208ENST00000615445 EEA1Q15075 1411 aa28.64■■■□□ 2.18
PTPRJ-208ENST00000615445 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.62■■■□□ 2.17
PTPRJ-208ENST00000615445 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
PTPRJ-208ENST00000615445 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
PTPRJ-208ENST00000615445 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.59■■■□□ 2.17
PTPRJ-208ENST00000615445 CEP162Q5TB80 1403 aa28.57■■■□□ 2.16
PTPRJ-208ENST00000615445 GOLGA3Q08378 1498 aa28.55■■■□□ 2.16
PTPRJ-208ENST00000615445 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
PTPRJ-208ENST00000615445 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.52■■■□□ 2.16
PTPRJ-208ENST00000615445 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
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PTPRJ-208ENST00000615445 TSPY4P0CV99 314 aa28.46■■■□□ 2.15
PTPRJ-208ENST00000615445 TSPY10P0CW01 314 aa28.46■■■□□ 2.15
PTPRJ-208ENST00000615445 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.43■■■□□ 2.14
PTPRJ-208ENST00000615445 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
PTPRJ-208ENST00000615445 KIF27Q86VH2 1401 aa28.4■■■□□ 2.14
PTPRJ-208ENST00000615445 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.38■■■□□ 2.13
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PTPRJ-208ENST00000615445 CANXP27824 592 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
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PTPRJ-208ENST00000615445 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.32■■■□□ 2.12
PTPRJ-208ENST00000615445 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.31■■■□□ 2.12
PTPRJ-208ENST00000615445 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP28.29■■■□□ 2.12
PTPRJ-208ENST00000615445 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.28■■■□□ 2.12
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM9BQ8IZU0 186 aa28.26■■■□□ 2.11
PTPRJ-208ENST00000615445 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.26■■■□□ 2.11
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC24A1O60721 1099 aa28.25■■■□□ 2.11
PTPRJ-208ENST00000615445 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
PTPRJ-208ENST00000615445 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
PTPRJ-208ENST00000615445 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.2■■■□□ 2.11
PTPRJ-208ENST00000615445 BCL11AQ9H165 835 aa28.18■■■□□ 2.1
PTPRJ-208ENST00000615445 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.18■■■□□ 2.1
PTPRJ-208ENST00000615445 FKBP8Q14318 412 aa28.18■■■□□ 2.1
PTPRJ-208ENST00000615445 KCNH8Q96L42 1107 aa28.18■■■□□ 2.1
PTPRJ-208ENST00000615445 MIER1Q8N108 512 aa28.14■■■□□ 2.1
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