RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.56■■■■□ 3.6
PTPRJ-201ENST00000418331 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.64■■■■□ 3.46
PTPRJ-201ENST00000418331 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.75■■■■□ 3.31
PTPRJ-201ENST00000418331 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.25■■■■□ 3.23
PTPRJ-201ENST00000418331 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.37■■■■□ 3.09
PTPRJ-201ENST00000418331 APLP2Q06481 763 aa33.7■■■□□ 2.99
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.66■■■□□ 2.98
PTPRJ-201ENST00000418331 PCGF6Q9BYE7 350 aa33.21■■■□□ 2.91
PTPRJ-201ENST00000418331 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.19■■■□□ 2.9
PTPRJ-201ENST00000418331 TRIM41Q8WV44 630 aa33.15■■■□□ 2.9
PTPRJ-201ENST00000418331 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP33.03■■■□□ 2.88
PTPRJ-201ENST00000418331 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.93■■■□□ 2.86
PTPRJ-201ENST00000418331 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.67■■■□□ 2.82
PTPRJ-201ENST00000418331 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP32.59■■■□□ 2.81
PTPRJ-201ENST00000418331 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.58■■■□□ 2.81
PTPRJ-201ENST00000418331 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP32.58■■■□□ 2.81
PTPRJ-201ENST00000418331 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP32.25■■■□□ 2.75
PTPRJ-201ENST00000418331 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP32.1■■■□□ 2.73
PTPRJ-201ENST00000418331 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.92■■■□□ 2.7
PTPRJ-201ENST00000418331 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.91■■■□□ 2.7
PTPRJ-201ENST00000418331 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.8■■■□□ 2.68
PTPRJ-201ENST00000418331 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
PTPRJ-201ENST00000418331 ERICH6Q7L0X2 663 aa31.59■■■□□ 2.65
PTPRJ-201ENST00000418331 ITGAEP38570 1179 aa31.56■■■□□ 2.64
PTPRJ-201ENST00000418331 NEFLP07196 543 aa31.54■■■□□ 2.64
PTPRJ-201ENST00000418331 HRCP23327 699 aa31.49■■■□□ 2.63
PTPRJ-201ENST00000418331 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP31.48■■■□□ 2.63
PTPRJ-201ENST00000418331 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
PTPRJ-201ENST00000418331 ABCC9O60706 1549 aa31.47■■■□□ 2.63
PTPRJ-201ENST00000418331 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.31■■■□□ 2.6
PTPRJ-201ENST00000418331 MYT1LQ9UL68 1186 aa31.23■■■□□ 2.59
PTPRJ-201ENST00000418331 POLR3GLQ9BT43 218 aa31.08■■■□□ 2.57
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
PTPRJ-201ENST00000418331 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
PTPRJ-201ENST00000418331 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
PTPRJ-201ENST00000418331 TRIM52Q96A61 297 aa30.58■■■□□ 2.49
PTPRJ-201ENST00000418331 NEUROD1Q13562 356 aa30.48■■■□□ 2.47
PTPRJ-201ENST00000418331 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
PTPRJ-201ENST00000418331 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.44■■■□□ 2.46
PTPRJ-201ENST00000418331 MYT1Q01538 1121 aa30.41■■■□□ 2.46
PTPRJ-201ENST00000418331 FBLN2P98095 1184 aa30.38■■■□□ 2.45
PTPRJ-201ENST00000418331 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
PTPRJ-201ENST00000418331 SCRIBQ14160 1630 aa30.28■■■□□ 2.44
PTPRJ-201ENST00000418331 P3H3Q8IVL6 736 aa30.25■■■□□ 2.43
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
PTPRJ-201ENST00000418331 ARID3CA6NKF2 412 aa30.08■■■□□ 2.41
PTPRJ-201ENST00000418331 ANP32CO43423 234 aa30.08■■■□□ 2.41
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
PTPRJ-201ENST00000418331 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.98■■■□□ 2.39
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.92■■■□□ 2.38
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
PTPRJ-201ENST00000418331 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
PTPRJ-201ENST00000418331 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa29.86■■■□□ 2.37
PTPRJ-201ENST00000418331 BCANQ96GW7 911 aa29.84■■■□□ 2.37
PTPRJ-201ENST00000418331 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
PTPRJ-201ENST00000418331 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.71■■■□□ 2.35
PTPRJ-201ENST00000418331 TONSLQ96HA7 1378 aa29.55■■■□□ 2.32
PTPRJ-201ENST00000418331 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.32
PTPRJ-201ENST00000418331 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.46■■■□□ 2.31
PTPRJ-201ENST00000418331 CANXP27824 592 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
PTPRJ-201ENST00000418331 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
PTPRJ-201ENST00000418331 NEFMP07197 916 aa29.43■■■□□ 2.3
PTPRJ-201ENST00000418331 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
PTPRJ-201ENST00000418331 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.39■■■□□ 2.3
PTPRJ-201ENST00000418331 CLIP1P30622 1438 aa29.35■■■□□ 2.29
PTPRJ-201ENST00000418331 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.32■■■□□ 2.28
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC24A1O60721 1099 aa29.31■■■□□ 2.28
PTPRJ-201ENST00000418331 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
PTPRJ-201ENST00000418331 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
PTPRJ-201ENST00000418331 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.3■■■□□ 2.28
PTPRJ-201ENST00000418331 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
PTPRJ-201ENST00000418331 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
PTPRJ-201ENST00000418331 EEA1Q15075 1411 aa29.22■■■□□ 2.27
PTPRJ-201ENST00000418331 NACADO15069 1562 aa29.21■■■□□ 2.27
PTPRJ-201ENST00000418331 BCL11AQ9H165 835 aa29.21■■■□□ 2.27
PTPRJ-201ENST00000418331 TSPY4P0CV99 314 aa29.2■■■□□ 2.27
PTPRJ-201ENST00000418331 TSPY10P0CW01 314 aa29.2■■■□□ 2.27
PTPRJ-201ENST00000418331 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.19■■■□□ 2.26
PTPRJ-201ENST00000418331 STAG3Q9UJ98 1225 aa29.18■■■□□ 2.26
PTPRJ-201ENST00000418331 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP29.17■■■□□ 2.26
PTPRJ-201ENST00000418331 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.16■■■□□ 2.26
PTPRJ-201ENST00000418331 GOLGA3Q08378 1498 aa29.14■■■□□ 2.26
PTPRJ-201ENST00000418331 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.13■■■□□ 2.25
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM9BQ8IZU0 186 aa29.12■■■□□ 2.25
PTPRJ-201ENST00000418331 CEP162Q5TB80 1403 aa29.11■■■□□ 2.25
PTPRJ-201ENST00000418331 FKBP8Q14318 412 aa29.1■■■□□ 2.25
PTPRJ-201ENST00000418331 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
PTPRJ-201ENST00000418331 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
PTPRJ-201ENST00000418331 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.02■■■□□ 2.24
PTPRJ-201ENST00000418331 TMC1Q8TDI8 760 aa28.99■■■□□ 2.23
PTPRJ-201ENST00000418331 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.98■■■□□ 2.23
PTPRJ-201ENST00000418331 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
PTPRJ-201ENST00000418331 KIF27Q86VH2 1401 aa28.94■■■□□ 2.22
PTPRJ-201ENST00000418331 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.93■■■□□ 2.22
PTPRJ-201ENST00000418331 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
PTPRJ-201ENST00000418331 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.91■■■□□ 2.22
PTPRJ-201ENST00000418331 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
PTPRJ-201ENST00000418331 MRS2Q9HD23 443 aa28.89■■■□□ 2.22
PTPRJ-201ENST00000418331 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms