RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397411.6

TSPAN4-207, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene TSPAN4, Length 1,025 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-207ENST00000397411 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.99■■■■■ 7.35
TSPAN4-207ENST00000397411 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.13■■■■■ 6.26
TSPAN4-207ENST00000397411 ABCC9O60706 1549 aa52.99■■■■■ 6.07
TSPAN4-207ENST00000397411 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.27■■■■■ 5.8
TSPAN4-207ENST00000397411 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.98■■■■■ 5.75
TSPAN4-207ENST00000397411 NACADO15069 1562 aa50.92■■■■■ 5.74
TSPAN4-207ENST00000397411 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.77■■■■■ 5.72
TSPAN4-207ENST00000397411 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.55■■■■■ 5.68
TSPAN4-207ENST00000397411 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.39■■■■■ 5.66
TSPAN4-207ENST00000397411 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.77■■■■■ 5.56
TSPAN4-207ENST00000397411 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.62■■■■■ 5.535e-10■■■□□ 17.3
TSPAN4-207ENST00000397411 SCRIBQ14160 1630 aa49.49■■■■■ 5.51
TSPAN4-207ENST00000397411 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.32■■■■■ 5.49
TSPAN4-207ENST00000397411 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.8■■■■■ 5.4
TSPAN4-207ENST00000397411 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.5■■■■■ 5.35
TSPAN4-207ENST00000397411 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.07■■■■■ 5.29
TSPAN4-207ENST00000397411 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.88■■■■■ 5.25
TSPAN4-207ENST00000397411 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.59■■■■■ 5.21
TSPAN4-207ENST00000397411 SMARCA4P51532 1647 aa47.3■■■■■ 5.16
TSPAN4-207ENST00000397411 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.28■■■■■ 5.16
TSPAN4-207ENST00000397411 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.02■■■■■ 5.12
TSPAN4-207ENST00000397411 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.01■■■■■ 5.12
TSPAN4-207ENST00000397411 SMARCA2P51531 1590 aa46.99■■■■■ 5.11
TSPAN4-207ENST00000397411 NCAPD3P42695 1498 aa46.96■■■■■ 5.11
TSPAN4-207ENST00000397411 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.74■■■■■ 5.07
TSPAN4-207ENST00000397411 HMGXB3Q12766 1538 aa46.7■■■■■ 5.07
TSPAN4-207ENST00000397411 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.7■■■■■ 5.07
TSPAN4-207ENST00000397411 WIZO95785 1651 aa46.54■■■■■ 5.04
TSPAN4-207ENST00000397411 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.53■■■■■ 5.04
TSPAN4-207ENST00000397411 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.02■■■■■ 4.96
TSPAN4-207ENST00000397411 NESP48681 1621 aa45.85■■■■■ 4.93
TSPAN4-207ENST00000397411 ERCC6Q03468 1493 aa45.73■■■■■ 4.91
TSPAN4-207ENST00000397411 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.72■■■■■ 4.91
TSPAN4-207ENST00000397411 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.69■■■■■ 4.9
TSPAN4-207ENST00000397411 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.66■■■■■ 4.9
TSPAN4-207ENST00000397411 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.52■■■■■ 4.88
TSPAN4-207ENST00000397411 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.5■■■■■ 4.87
TSPAN4-207ENST00000397411 CFTRP13569 1480 aa45.36■■■■■ 4.85
TSPAN4-207ENST00000397411 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.3■■■■■ 4.84
TSPAN4-207ENST00000397411 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.13■■■■■ 4.82
TSPAN4-207ENST00000397411 CUX2O14529 1486 aa45.08■■■■■ 4.81
TSPAN4-207ENST00000397411 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.08■■■■■ 4.81
TSPAN4-207ENST00000397411 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.03■■■■■ 4.8
TSPAN4-207ENST00000397411 PRDM2Q13029 1718 aa45.03■■■■■ 4.8
TSPAN4-207ENST00000397411 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.97■■■■■ 4.79
TSPAN4-207ENST00000397411 WDR62O43379 1518 aa44.75■■■■■ 4.75
TSPAN4-207ENST00000397411 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.63■■■■■ 4.73
TSPAN4-207ENST00000397411 ABCC8Q09428 1581 aa44.47■■■■■ 4.71
TSPAN4-207ENST00000397411 TOPBP1Q92547 1522 aa44.4■■■■■ 4.7
TSPAN4-207ENST00000397411 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.35■■■■■ 4.69
TSPAN4-207ENST00000397411 IFT140Q96RY7 1462 aa44.12■■■■■ 4.65
TSPAN4-207ENST00000397411 CUX1P39880 1505 aa44.09■■■■■ 4.65
TSPAN4-207ENST00000397411 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.02■■■■■ 4.64
TSPAN4-207ENST00000397411 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.96■■■■■ 4.63
TSPAN4-207ENST00000397411 SOGA1O94964 1423 aa43.94■■■■■ 4.62
TSPAN4-207ENST00000397411 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.91■■■■■ 4.62
TSPAN4-207ENST00000397411 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.89■■■■■ 4.62
TSPAN4-207ENST00000397411 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.88■■■■■ 4.61
TSPAN4-207ENST00000397411 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.86■■■■■ 4.61
TSPAN4-207ENST00000397411 TOP2BQ02880 1626 aa43.74■■■■■ 4.59
TSPAN4-207ENST00000397411 SYNJ1O43426 1573 aa43.72■■■■■ 4.59
TSPAN4-207ENST00000397411 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.72■■■■■ 4.59
TSPAN4-207ENST00000397411 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.71■■■■■ 4.594e-8■■■■■ 31.9
TSPAN4-207ENST00000397411 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.69■■■■■ 4.58
TSPAN4-207ENST00000397411 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.68■■■■■ 4.58
TSPAN4-207ENST00000397411 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.66■■■■■ 4.58
TSPAN4-207ENST00000397411 WDR97A6NE52 1622 aa43.51■■■■■ 4.56
TSPAN4-207ENST00000397411 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.5■■■■■ 4.55
TSPAN4-207ENST00000397411 OSCARQ8IYS5 282 aa43.41■■■■■ 4.54
TSPAN4-207ENST00000397411 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.4■■■■■ 4.54
TSPAN4-207ENST00000397411 GRIN2BQ13224 1484 aa43.37■■■■■ 4.53
TSPAN4-207ENST00000397411 FBLN2P98095 1184 aa43.36■■■■■ 4.53
TSPAN4-207ENST00000397411 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.28■■■■■ 4.52
TSPAN4-207ENST00000397411 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.28■■■■■ 4.52
TSPAN4-207ENST00000397411 PBRM1Q86U86 1689 aa43.26■■■■■ 4.52
TSPAN4-207ENST00000397411 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.2■■■■■ 4.51
TSPAN4-207ENST00000397411 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.2■■■■■ 4.51
TSPAN4-207ENST00000397411 CHD1O14646 1710 aa43.17■■■■■ 4.5
TSPAN4-207ENST00000397411 TRIM41Q8WV44 630 aa43.13■■■■■ 4.49
TSPAN4-207ENST00000397411 SYNJ2O15056 1496 aa43.05■■■■■ 4.48
TSPAN4-207ENST00000397411 KIF27Q86VH2 1401 aa43.03■■■■■ 4.48
TSPAN4-207ENST00000397411 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43■■■■■ 4.47
TSPAN4-207ENST00000397411 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.89■■■■■ 4.46
TSPAN4-207ENST00000397411 ADAMTS12P58397 1594 aa42.87■■■■■ 4.45
TSPAN4-207ENST00000397411 IGF1RP08069 1367 aa42.79■■■■■ 4.44
TSPAN4-207ENST00000397411 GRIN2AQ12879 1464 aa42.77■■■■■ 4.44
TSPAN4-207ENST00000397411 CUL7Q14999 1698 aa42.64■■■■■ 4.42
TSPAN4-207ENST00000397411 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.61■■■■■ 4.41
TSPAN4-207ENST00000397411 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.61■■■■■ 4.41
TSPAN4-207ENST00000397411 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.6■■■■■ 4.41
TSPAN4-207ENST00000397411 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.59■■■■■ 4.41
TSPAN4-207ENST00000397411 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.55■■■■■ 4.4
TSPAN4-207ENST00000397411 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.55■■■■■ 4.4
TSPAN4-207ENST00000397411 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.55■■■■■ 4.4
TSPAN4-207ENST00000397411 ARHGEF11O15085 1522 aa42.54■■■■■ 4.4
TSPAN4-207ENST00000397411 NUP160Q12769 1436 aa42.54■■■■■ 4.4
TSPAN4-207ENST00000397411 CEP170Q5SW79 1584 aa42.52■■■■■ 4.4
TSPAN4-207ENST00000397411 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.33■■■■■ 4.37
TSPAN4-207ENST00000397411 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.32■■■■■ 4.37
TSPAN4-207ENST00000397411 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.29■■■■■ 4.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms