Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0L4

CSTF2T, Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2TQ9H0L4 FOXRED1-216ENST00000533839 559 ntTSL 49.09□□□□□ -0.958e-13■■■■■ 132.1
CSTF2TQ9H0L4 RANBP1-211ENST00000448394 688 ntTSL 213.51□□□□□ -0.258e-18■■■■■ 107.1
CSTF2TQ9H0L4 RANBP1-207ENST00000423859 832 ntTSL 317.15■□□□□ 0.341e-11■■■■■ 105.5
CSTF2TQ9H0L4 RANBP1-205ENST00000418705 932 ntTSL 315.62■□□□□ 0.091e-11■■■■■ 105.5
CSTF2TQ9H0L4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.448e-11■■■■■ 103.1
CSTF2TQ9H0L4 RANBP1-210ENST00000435265 1879 ntTSL 217.68■□□□□ 0.428e-11■■■■■ 103.1
CSTF2TQ9H0L4 RANBP1-203ENST00000411892 584 ntTSL 213.77□□□□□ -0.218e-11■■■■■ 103.1
CSTF2TQ9H0L4 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.258e-11■■■■■ 103.1
CSTF2TQ9H0L4 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.298e-11■■■■■ 103.1
CSTF2TQ9H0L4 FOXRED1-203ENST00000525083 1228 ntTSL 216.32■□□□□ 0.23e-8■■■■■ 94.4
CSTF2TQ9H0L4 FOXRED1-207ENST00000527004 1760 ntTSL 514.25□□□□□ -0.133e-8■■■■■ 94.4
CSTF2TQ9H0L4 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.183e-8■■■■■ 94.4
CSTF2TQ9H0L4 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.23e-8■■■■■ 94.4
CSTF2TQ9H0L4 FOXRED1-204ENST00000525770 1427 ntTSL 213.71□□□□□ -0.223e-8■■■■■ 94.4
CSTF2TQ9H0L4 FOXRED1-217ENST00000534011 1955 ntTSL 213.01□□□□□ -0.333e-8■■■■■ 94.4
CSTF2TQ9H0L4 FOXRED1-218ENST00000534315 2210 ntTSL 1 (best)12.29□□□□□ -0.443e-8■■■■■ 94.4
CSTF2TQ9H0L4 FOXRED1-210ENST00000530642 3045 ntTSL 28.39□□□□□ -1.073e-8■■■■■ 94.4
CSTF2TQ9H0L4 FAM178B-205ENST00000494172 592 ntTSL 316.74■□□□□ 0.279e-9■■■■■ 80.2
CSTF2TQ9H0L4 FAM178B-202ENST00000470789 722 ntTSL 1 (best)10.52□□□□□ -0.738e-9■■■■■ 78.3
CSTF2TQ9H0L4 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.196e-10■■■■■ 76.7
CSTF2TQ9H0L4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.125e-8■■■■■ 76.6
CSTF2TQ9H0L4 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.485e-8■■■■■ 76.6
CSTF2TQ9H0L4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.43e-16■■■■■ 74.3
CSTF2TQ9H0L4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.091e-16■■■■■ 73.7
CSTF2TQ9H0L4 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.411e-7■■■■■ 73.7
CSTF2TQ9H0L4 SSTR5-AS1-202ENST00000566499 479 ntTSL 411.72□□□□□ -0.531e-7■■■■■ 73.7
CSTF2TQ9H0L4 RPL38-206ENST00000533498 532 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.644e-21■■■■■ 71.5
CSTF2TQ9H0L4 RANBP1-214ENST00000488484 699 ntTSL 214.16□□□□□ -0.145e-10■■■■■ 70.7
CSTF2TQ9H0L4 NME4-209ENST00000460297 1652 ntTSL 521.99■■□□□ 1.118e-17■■■■■ 69.3
CSTF2TQ9H0L4 NME4-204ENST00000433358 966 ntTSL 321.94■■□□□ 1.18e-17■■■■■ 69.3
CSTF2TQ9H0L4 NME4-206ENST00000448828 1167 ntTSL 221.44■■□□□ 1.028e-17■■■■■ 69.3
CSTF2TQ9H0L4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.878e-17■■■■■ 69.3
CSTF2TQ9H0L4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.878e-17■■■■■ 69.3
CSTF2TQ9H0L4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.878e-17■■■■■ 69.3
CSTF2TQ9H0L4 NME4-205ENST00000444498 1111 ntTSL 317.55■□□□□ 0.48e-17■■■■■ 69.3
CSTF2TQ9H0L4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.218e-17■■■■■ 69.3
CSTF2TQ9H0L4 NME4-208ENST00000454619 719 ntTSL 513.62□□□□□ -0.237e-17■■■■■ 69.3
CSTF2TQ9H0L4 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.377e-17■■■■■ 69.3
CSTF2TQ9H0L4 F7-203ENST00000444337 564 ntTSL 518.71■□□□□ 0.595e-8■■■■■ 68.7
CSTF2TQ9H0L4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.055e-8■■■■■ 68.4
CSTF2TQ9H0L4 F7-206ENST00000541084 2873 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.645e-8■■■■■ 68.4
CSTF2TQ9H0L4 F7-202ENST00000375581 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.675e-8■■■■■ 68.4
CSTF2TQ9H0L4 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.059e-19■■■■■ 68.3
CSTF2TQ9H0L4 ULK1-207ENST00000544718 1678 ntTSL 222.6■■□□□ 1.212e-17■■■■■ 64.9
CSTF2TQ9H0L4 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.084e-19■■■■■ 64.6
CSTF2TQ9H0L4 ARHGAP5-204ENST00000432921 5003 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.944e-19■■■■■ 64.6
CSTF2TQ9H0L4 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.994e-19■■■■■ 64.6
CSTF2TQ9H0L4 F7-205ENST00000479674 767 ntTSL 521.86■■□□□ 1.093e-7■■■■■ 64.4
CSTF2TQ9H0L4 ULK1-204ENST00000540647 1211 ntTSL 218.64■□□□□ 0.572e-18■■■■■ 63.8
CSTF2TQ9H0L4 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.288e-12■■■■■ 63.7
CSTF2TQ9H0L4 FAM98B-204ENST00000559431 305 ntTSL 510.01□□□□□ -0.818e-12■■■■■ 63.7
CSTF2TQ9H0L4 ZNF638-219ENST00000487638 4233 ntTSL 1 (best)2.28□□□□□ -2.041e-18■■■■■ 62.9
CSTF2TQ9H0L4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.554e-18■■■■■ 62.6
CSTF2TQ9H0L4 SUN1-209ENST00000424128 633 ntTSL 516.58■□□□□ 0.244e-18■■■■■ 62.6
CSTF2TQ9H0L4 SUN1-216ENST00000440380 537 ntTSL 516.33■□□□□ 0.24e-18■■■■■ 62.6
CSTF2TQ9H0L4 SUN1-226ENST00000467483 992 ntTSL 215.03■□□□□ -04e-18■■■■■ 62.6
CSTF2TQ9H0L4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.134e-18■■■■■ 62.6
CSTF2TQ9H0L4 SUN1-208ENST00000421580 540 ntTSL 413.67□□□□□ -0.224e-18■■■■■ 62.6
CSTF2TQ9H0L4 SUN1-232ENST00000483996 478 ntTSL 213.62□□□□□ -0.234e-18■■■■■ 62.6
CSTF2TQ9H0L4 SUN1-211ENST00000427969 520 ntTSL 413.61□□□□□ -0.234e-18■■■■■ 62.6
CSTF2TQ9H0L4 SUN1-221ENST00000457598 563 ntTSL 413.61□□□□□ -0.234e-18■■■■■ 62.6
CSTF2TQ9H0L4 SUN1-217ENST00000450538 570 ntTSL 413.16□□□□□ -0.34e-18■■■■■ 62.6
CSTF2TQ9H0L4 SUN1-215ENST00000439679 626 ntTSL 512.89□□□□□ -0.354e-18■■■■■ 62.6
CSTF2TQ9H0L4 SUN1-214ENST00000435699 676 ntTSL 311.24□□□□□ -0.614e-18■■■■■ 62.6
CSTF2TQ9H0L4 ANKRD20A19P-201ENST00000420143 641 ntTSL 322.05■■□□□ 1.125e-16■■■■■ 59.4
CSTF2TQ9H0L4 ULK1-205ENST00000541761 1262 ntTSL 214.39□□□□□ -0.114e-14■■■■■ 58.7
CSTF2TQ9H0L4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.165e-15■■■■■ 57.1
CSTF2TQ9H0L4 ANKRD20A11P-206ENST00000451663 3717 ntBASIC8.95□□□□□ -0.985e-15■■■■■ 57.1
CSTF2TQ9H0L4 CLIC4-204ENST00000497755 672 ntTSL 320.7■□□□□ 0.97e-14■■■■■ 55.8
CSTF2TQ9H0L4 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.447e-14■■■■■ 55.8
CSTF2TQ9H0L4 CLIC4-202ENST00000488683 2723 ntTSL 211.53□□□□□ -0.567e-14■■■■■ 55.8
CSTF2TQ9H0L4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.223e-9■■■■■ 55.8
CSTF2TQ9H0L4 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.453e-9■■■■■ 55.8
CSTF2TQ9H0L4 ARHGAP35-202ENST00000595822 2977 ntTSL 211.59□□□□□ -0.553e-9■■■■■ 55.8
CSTF2TQ9H0L4 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.062e-16■■■■■ 55.4
CSTF2TQ9H0L4 NEBL-212ENST00000493005 1870 ntTSL 1 (best)8.93□□□□□ -0.982e-16■■■■■ 55.4
CSTF2TQ9H0L4 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.962e-16■■■■■ 55.4
CSTF2TQ9H0L4 NUCB1-203ENST00000411700 673 ntTSL 419.18■□□□□ 0.663e-7■■■■■ 53.8
CSTF2TQ9H0L4 NUCB1-204ENST00000424608 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 518.68■□□□□ 0.583e-7■■■■■ 53.8
CSTF2TQ9H0L4 NUCB1-207ENST00000452087 864 ntTSL 317.71■□□□□ 0.433e-7■■■■■ 53.8
CSTF2TQ9H0L4 NUCB1-206ENST00000451312 563 ntTSL 216.95■□□□□ 0.33e-7■■■■■ 53.8
CSTF2TQ9H0L4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.023e-7■■■■■ 53.8
CSTF2TQ9H0L4 NUCB1-205ENST00000443560 551 ntTSL 414.43□□□□□ -0.13e-7■■■■■ 53.8
CSTF2TQ9H0L4 NUCB1-211ENST00000485798 938 ntTSL 314.1□□□□□ -0.153e-7■■■■■ 53.8
CSTF2TQ9H0L4 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.253e-7■■■■■ 53.8
CSTF2TQ9H0L4 TBKBP1-203ENST00000578982 733 ntTSL 318.01■□□□□ 0.472e-9■■■■■ 53.4
CSTF2TQ9H0L4 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.225e-15■■■■■ 53.4
CSTF2TQ9H0L4 COPA-205ENST00000541366 616 ntTSL 211.3□□□□□ -0.62e-15■■■■■ 52.9
CSTF2TQ9H0L4 COPA-202ENST00000368069 4664 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.662e-15■■■■■ 52.9
CSTF2TQ9H0L4 COPA-201ENST00000241704 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.742e-15■■■■■ 52.9
CSTF2TQ9H0L4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.326e-7■■■■■ 52.6
CSTF2TQ9H0L4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.086e-11■■■■■ 52
CSTF2TQ9H0L4 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.812e-13■■■■■ 52
CSTF2TQ9H0L4 MIR4435-2HG-205ENST00000431385 843 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.032e-13■■■■■ 52
CSTF2TQ9H0L4 MIR4435-2HG-219ENST00000609220 883 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.162e-13■■■■■ 52
CSTF2TQ9H0L4 MIR4435-2HG-211ENST00000443467 826 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.242e-13■■■■■ 52
CSTF2TQ9H0L4 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.282e-13■■■■■ 52
CSTF2TQ9H0L4 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.722e-13■■■■■ 52
CSTF2TQ9H0L4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.172e-15■■■■■ 51.5
CSTF2TQ9H0L4 CNST-204ENST00000483271 2767 ntTSL 215.18■□□□□ 0.022e-15■■■■■ 51.5
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