RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534219.5

PTPRJ-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRJ, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-206ENST00000534219 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.53■■■■■ 7.44
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PTPRJ-206ENST00000534219 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.77■■■■■ 5.72
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PTPRJ-206ENST00000534219 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.12■■■■■ 5.45
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PTPRJ-206ENST00000534219 SMARCA2P51531 1590 aa47.71■■■■■ 5.23
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PTPRJ-206ENST00000534219 ERCC6Q03468 1493 aa47.15■■■■■ 5.14
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PTPRJ-206ENST00000534219 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.7■■■■■ 5.07
PTPRJ-206ENST00000534219 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.65■■■■■ 5.06
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PTPRJ-206ENST00000534219 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.98■■■■■ 4.95
PTPRJ-206ENST00000534219 WDR62O43379 1518 aa45.87■■■■■ 4.93
PTPRJ-206ENST00000534219 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.82■■■■■ 4.93
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PTPRJ-206ENST00000534219 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.99■■■■■ 4.79
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PTPRJ-206ENST00000534219 OSCARQ8IYS5 282 aa44.87■■■■■ 4.77
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PTPRJ-206ENST00000534219 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.51■■■■■ 4.72
PTPRJ-206ENST00000534219 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.45■■■■■ 4.71
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PTPRJ-206ENST00000534219 WDR97A6NE52 1622 aa44.21■■■■■ 4.67
PTPRJ-206ENST00000534219 CHD1O14646 1710 aa44.16■■■■■ 4.66
PTPRJ-206ENST00000534219 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.15■■■■■ 4.66
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PTPRJ-206ENST00000534219 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.09■■■■■ 4.65
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PTPRJ-206ENST00000534219 SYNJ2O15056 1496 aa43.89■■■■■ 4.62
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PTPRJ-206ENST00000534219 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.71■■■■■ 4.59
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PTPRJ-206ENST00000534219 NUP160Q12769 1436 aa43.33■■■■■ 4.53
PTPRJ-206ENST00000534219 CEP170Q5SW79 1584 aa43.3■■■■■ 4.52
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PTPRJ-206ENST00000534219 SHROOM2Q13796 1616 aa43■■■■■ 4.47
PTPRJ-206ENST00000534219 JPH4Q96JJ6 628 aa43■■■■■ 4.47
PTPRJ-206ENST00000534219 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.95■■■■■ 4.47
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