Protein–RNA interactions for Protein: P07858

CTSB, Cathepsin B, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSBP07858 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSBP07858 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSBP07858 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTSBP07858 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTSBP07858 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSBP07858 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSBP07858 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSBP07858 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSBP07858 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSBP07858 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSBP07858 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSBP07858 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSBP07858 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSBP07858 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSBP07858 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSBP07858 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSBP07858 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSBP07858 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSBP07858 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSBP07858 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSBP07858 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSBP07858 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSBP07858 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSBP07858 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSBP07858 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSBP07858 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSBP07858 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSBP07858 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSBP07858 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSBP07858 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSBP07858 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSBP07858 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSBP07858 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSBP07858 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSBP07858 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSBP07858 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSBP07858 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSBP07858 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSBP07858 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSBP07858 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSBP07858 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSBP07858 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSBP07858 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSBP07858 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSBP07858 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSBP07858 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSBP07858 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSBP07858 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSBP07858 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSBP07858 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSBP07858 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSBP07858 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSBP07858 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSBP07858 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSBP07858 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSBP07858 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSBP07858 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSBP07858 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSBP07858 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSBP07858 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSBP07858 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSBP07858 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSBP07858 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSBP07858 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSBP07858 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSBP07858 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSBP07858 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSBP07858 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSBP07858 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSBP07858 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSBP07858 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSBP07858 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSBP07858 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSBP07858 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSBP07858 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSBP07858 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSBP07858 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSBP07858 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSBP07858 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSBP07858 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSBP07858 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSBP07858 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSBP07858 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTSBP07858 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTSBP07858 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTSBP07858 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CTSBP07858 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSBP07858 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSBP07858 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSBP07858 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSBP07858 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSBP07858 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSBP07858 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSBP07858 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSBP07858 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSBP07858 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSBP07858 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSBP07858 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSBP07858 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSBP07858 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms