RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355904.8

GTF2E2-201, Transcript of general transcription factor IIE subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF2E2, Length 1,762 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2-201ENST00000355904 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.39■■■■■ 6.46
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GTF2E2-201ENST00000355904 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.66■■■■■ 4.9
GTF2E2-201ENST00000355904 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.29■■■■■ 4.84
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GTF2E2-201ENST00000355904 NACADO15069 1562 aa45.02■■■■■ 4.8
GTF2E2-201ENST00000355904 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.64■■■■■ 4.74
GTF2E2-201ENST00000355904 SCRIBQ14160 1630 aa44.45■■■■■ 4.71
GTF2E2-201ENST00000355904 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.72■■■■■ 4.59
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GTF2E2-201ENST00000355904 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.02■■■■■ 4.48
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GTF2E2-201ENST00000355904 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.79■■■■■ 4.44
GTF2E2-201ENST00000355904 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.79■■■■■ 4.44
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GTF2E2-201ENST00000355904 WIZO95785 1651 aa42.44■■■■■ 4.38
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GTF2E2-201ENST00000355904 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.89■■■■■ 4.3
GTF2E2-201ENST00000355904 SMARCA2P51531 1590 aa41.88■■■■■ 4.3
GTF2E2-201ENST00000355904 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
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GTF2E2-201ENST00000355904 NCAPD3P42695 1498 aa41.53■■■■■ 4.24
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GTF2E2-201ENST00000355904 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.36■■■■■ 4.21
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GTF2E2-201ENST00000355904 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.46■■■■■ 4.07
GTF2E2-201ENST00000355904 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.44■■■■■ 4.06
GTF2E2-201ENST00000355904 PRDM2Q13029 1718 aa40.43■■■■■ 4.06
GTF2E2-201ENST00000355904 SYNJ1O43426 1573 aa40.29■■■■■ 4.04
GTF2E2-201ENST00000355904 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.25■■■■■ 4.03
GTF2E2-201ENST00000355904 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.14■■■■■ 4.02
GTF2E2-201ENST00000355904 TOP2BQ02880 1626 aa40.13■■■■■ 4.01
GTF2E2-201ENST00000355904 NESP48681 1621 aa40.11■■■■■ 4.01
GTF2E2-201ENST00000355904 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.1■■■■■ 4.01
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GTF2E2-201ENST00000355904 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.29■■■■□ 3.72
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