RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539804.1

PITX3-202, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PITX3, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-202ENST00000539804 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.93■■■■■ 7.02
PITX3-202ENST00000539804 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.58■■■■■ 6.01
PITX3-202ENST00000539804 ABCC9O60706 1549 aa51.47■■■■■ 5.83
PITX3-202ENST00000539804 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.62■■■■■ 5.53
PITX3-202ENST00000539804 NACADO15069 1562 aa49.53■■■■■ 5.52
PITX3-202ENST00000539804 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.32■■■■■ 5.49
PITX3-202ENST00000539804 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.22■■■■■ 5.47
PITX3-202ENST00000539804 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.04■■■■■ 5.44
PITX3-202ENST00000539804 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.88■■■■■ 5.42
PITX3-202ENST00000539804 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.24■■■■■ 5.31
PITX3-202ENST00000539804 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.03■■■■■ 5.28
PITX3-202ENST00000539804 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.89■■■■■ 5.26
PITX3-202ENST00000539804 SCRIBQ14160 1630 aa47.78■■■■■ 5.24
PITX3-202ENST00000539804 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.74■■■■■ 5.23
PITX3-202ENST00000539804 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.28■■■■■ 5.16
PITX3-202ENST00000539804 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.76■■■■■ 5.08
PITX3-202ENST00000539804 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.59■■■■■ 5.05
PITX3-202ENST00000539804 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.37■■■■■ 5.01
PITX3-202ENST00000539804 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.79■■■■■ 4.92
PITX3-202ENST00000539804 SMARCA4P51532 1647 aa45.75■■■■■ 4.91
PITX3-202ENST00000539804 NCAPD3P42695 1498 aa45.65■■■■■ 4.9
PITX3-202ENST00000539804 SMARCA2P51531 1590 aa45.63■■■■■ 4.9
PITX3-202ENST00000539804 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.58■■■■■ 4.89
PITX3-202ENST00000539804 HMGXB3Q12766 1538 aa45.42■■■■■ 4.86
PITX3-202ENST00000539804 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.38■■■■■ 4.86
PITX3-202ENST00000539804 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.31■■■■■ 4.84
PITX3-202ENST00000539804 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.25■■■■■ 4.83
PITX3-202ENST00000539804 WIZO95785 1651 aa44.8■■■■■ 4.76
PITX3-202ENST00000539804 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.77■■■■■ 4.76
PITX3-202ENST00000539804 ERCC6Q03468 1493 aa44.55■■■■■ 4.72
PITX3-202ENST00000539804 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.52■■■■■ 4.72
PITX3-202ENST00000539804 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.45■■■■■ 4.71
PITX3-202ENST00000539804 NESP48681 1621 aa44.4■■■■■ 4.7
PITX3-202ENST00000539804 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.31■■■■■ 4.68
PITX3-202ENST00000539804 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.28■■■■■ 4.68
PITX3-202ENST00000539804 CUX2O14529 1486 aa44.2■■■■■ 4.67
PITX3-202ENST00000539804 CFTRP13569 1480 aa43.98■■■■■ 4.63
PITX3-202ENST00000539804 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.92■■■■■ 4.62
PITX3-202ENST00000539804 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.87■■■■■ 4.61
PITX3-202ENST00000539804 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.86■■■■■ 4.61
PITX3-202ENST00000539804 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.77■■■■■ 4.6
PITX3-202ENST00000539804 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.76■■■■■ 4.6
PITX3-202ENST00000539804 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.74■■■■■ 4.59
PITX3-202ENST00000539804 PRDM2Q13029 1718 aa43.62■■■■■ 4.57
PITX3-202ENST00000539804 WDR62O43379 1518 aa43.58■■■■■ 4.57
PITX3-202ENST00000539804 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.47■■■■■ 4.55
PITX3-202ENST00000539804 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.24■■■■■ 4.51
PITX3-202ENST00000539804 ABCC8Q09428 1581 aa43.23■■■■■ 4.51
PITX3-202ENST00000539804 TOPBP1Q92547 1522 aa43.02■■■■■ 4.48
PITX3-202ENST00000539804 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43■■■■■ 4.47
PITX3-202ENST00000539804 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.99■■■■■ 4.47
PITX3-202ENST00000539804 IFT140Q96RY7 1462 aa42.9■■■■■ 4.46
PITX3-202ENST00000539804 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.62■■■■■ 4.41
PITX3-202ENST00000539804 CUX1P39880 1505 aa42.54■■■■■ 4.4
PITX3-202ENST00000539804 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.51■■■■■ 4.4
PITX3-202ENST00000539804 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.51■■■■■ 4.4
PITX3-202ENST00000539804 SOGA1O94964 1423 aa42.51■■■■■ 4.4
PITX3-202ENST00000539804 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.49■■■■■ 4.39
PITX3-202ENST00000539804 WDR97A6NE52 1622 aa42.42■■■■■ 4.38
PITX3-202ENST00000539804 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.41■■■■■ 4.38
PITX3-202ENST00000539804 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.36■■■■■ 4.37
PITX3-202ENST00000539804 OSCARQ8IYS5 282 aa42.34■■■■■ 4.37
PITX3-202ENST00000539804 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.31■■■■■ 4.36
PITX3-202ENST00000539804 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.3■■■■■ 4.36
PITX3-202ENST00000539804 TOP2BQ02880 1626 aa42.21■■■■■ 4.35
PITX3-202ENST00000539804 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
PITX3-202ENST00000539804 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.19■■■■■ 4.34
PITX3-202ENST00000539804 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.14■■■■■ 4.34
PITX3-202ENST00000539804 GRIN2BQ13224 1484 aa42.07■■■■■ 4.33
PITX3-202ENST00000539804 SYNJ1O43426 1573 aa42.06■■■■■ 4.32
PITX3-202ENST00000539804 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.02■■■■■ 4.32
PITX3-202ENST00000539804 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.01■■■■■ 4.32
PITX3-202ENST00000539804 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.95■■■■■ 4.31
PITX3-202ENST00000539804 FBLN2P98095 1184 aa41.93■■■■■ 4.3
PITX3-202ENST00000539804 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.91■■■■■ 4.3
PITX3-202ENST00000539804 CHD1O14646 1710 aa41.87■■■■■ 4.29
PITX3-202ENST00000539804 PBRM1Q86U86 1689 aa41.87■■■■■ 4.29
PITX3-202ENST00000539804 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.86■■■■■ 4.29
PITX3-202ENST00000539804 SYNJ2O15056 1496 aa41.81■■■■■ 4.28
PITX3-202ENST00000539804 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.68■■■■■ 4.26
PITX3-202ENST00000539804 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.56■■■■■ 4.24
PITX3-202ENST00000539804 ADAMTS12P58397 1594 aa41.54■■■■■ 4.24
PITX3-202ENST00000539804 KIF27Q86VH2 1401 aa41.52■■■■■ 4.24
PITX3-202ENST00000539804 ARHGEF11O15085 1522 aa41.51■■■■■ 4.24
PITX3-202ENST00000539804 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.5■■■■■ 4.23
PITX3-202ENST00000539804 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.5■■■■■ 4.23
PITX3-202ENST00000539804 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.5■■■■■ 4.23
PITX3-202ENST00000539804 GRIN2AQ12879 1464 aa41.47■■■■■ 4.23
PITX3-202ENST00000539804 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.47■■■■■ 4.23
PITX3-202ENST00000539804 TRIM41Q8WV44 630 aa41.43■■■■■ 4.22
PITX3-202ENST00000539804 NUP160Q12769 1436 aa41.3■■■■■ 4.2
PITX3-202ENST00000539804 CUL7Q14999 1698 aa41.26■■■■■ 4.2
PITX3-202ENST00000539804 IGF1RP08069 1367 aa41.25■■■■■ 4.19
PITX3-202ENST00000539804 CEP170Q5SW79 1584 aa41.18■■■■■ 4.18
PITX3-202ENST00000539804 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.16■■■■■ 4.18
PITX3-202ENST00000539804 ARAP1Q96P48 1450 aa41.11■■■■■ 4.17
PITX3-202ENST00000539804 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.07■■■■■ 4.16
PITX3-202ENST00000539804 SHROOM2Q13796 1616 aa40.98■■■■■ 4.15
PITX3-202ENST00000539804 JPH4Q96JJ6 628 aa40.92■■■■■ 4.14
PITX3-202ENST00000539804 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.92■■■■■ 4.14
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