RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.65■■■■■ 7.3
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCC9O60706 1549 aa54.83■■■■■ 6.37
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.52■■■■■ 6.32
CAPNS1-216ENST00000628306 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.01■■■■■ 5.92
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.87■■■■■ 5.89
CAPNS1-216ENST00000628306 NACADO15069 1562 aa51.61■■■■■ 5.85
CAPNS1-216ENST00000628306 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.11■■■■■ 5.77
CAPNS1-216ENST00000628306 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51■■■■■ 5.75
CAPNS1-216ENST00000628306 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.94■■■■■ 5.74
CAPNS1-216ENST00000628306 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.86■■■■■ 5.73
CAPNS1-216ENST00000628306 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.68■■■■■ 5.7
CAPNS1-216ENST00000628306 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.22■■■■■ 5.63
CAPNS1-216ENST00000628306 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.09■■■■■ 5.61
CAPNS1-216ENST00000628306 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.84■■■■■ 5.57
CAPNS1-216ENST00000628306 SCRIBQ14160 1630 aa49.64■■■■■ 5.54
CAPNS1-216ENST00000628306 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.55■■■■■ 5.52
CAPNS1-216ENST00000628306 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.42■■■■■ 5.5
CAPNS1-216ENST00000628306 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.37■■■■■ 5.49
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.75■■■■■ 5.24
CAPNS1-216ENST00000628306 NCAPD3P42695 1498 aa47.71■■■■■ 5.23
CAPNS1-216ENST00000628306 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.52■■■■■ 5.2
CAPNS1-216ENST00000628306 CUX2O14529 1486 aa47.38■■■■■ 5.18
CAPNS1-216ENST00000628306 SMARCA4P51532 1647 aa47.36■■■■■ 5.17
CAPNS1-216ENST00000628306 HMGXB3Q12766 1538 aa47.3■■■■■ 5.16
CAPNS1-216ENST00000628306 SMARCA2P51531 1590 aa47.28■■■■■ 5.16
CAPNS1-216ENST00000628306 ERCC6Q03468 1493 aa47.26■■■■■ 5.16
CAPNS1-216ENST00000628306 NESP48681 1621 aa47.08■■■■■ 5.13
CAPNS1-216ENST00000628306 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.04■■■■■ 5.12
CAPNS1-216ENST00000628306 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.96■■■■■ 5.11
CAPNS1-216ENST00000628306 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.95■■■■■ 5.11
CAPNS1-216ENST00000628306 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.76■■■■■ 5.08
CAPNS1-216ENST00000628306 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.67■■■■■ 5.06
CAPNS1-216ENST00000628306 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.62■■■■■ 5.05
CAPNS1-216ENST00000628306 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.41■■■■■ 5.02
CAPNS1-216ENST00000628306 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.32■■■■■ 5.01
CAPNS1-216ENST00000628306 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.21■■■■■ 4.99
CAPNS1-216ENST00000628306 WIZO95785 1651 aa46.14■■■■■ 4.98
CAPNS1-216ENST00000628306 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.99■■■■■ 4.95
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR62O43379 1518 aa45.93■■■■■ 4.94
CAPNS1-216ENST00000628306 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.71■■■■■ 4.91
CAPNS1-216ENST00000628306 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.67■■■■■ 4.9
CAPNS1-216ENST00000628306 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.66■■■■■ 4.9
CAPNS1-216ENST00000628306 CFTRP13569 1480 aa45.65■■■■■ 4.9
CAPNS1-216ENST00000628306 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.52■■■■■ 4.88
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM41Q8WV44 630 aa45.4■■■■■ 4.86
CAPNS1-216ENST00000628306 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.38■■■■■ 4.86
CAPNS1-216ENST00000628306 OSCARQ8IYS5 282 aa45.1■■■■■ 4.81
CAPNS1-216ENST00000628306 PRDM2Q13029 1718 aa45.08■■■■■ 4.81
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.04■■■■■ 4.8
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.88■■■■■ 4.78
CAPNS1-216ENST00000628306 IFT140Q96RY7 1462 aa44.83■■■■■ 4.77
CAPNS1-216ENST00000628306 TOPBP1Q92547 1522 aa44.79■■■■■ 4.76
CAPNS1-216ENST00000628306 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.64■■■■■ 4.74
CAPNS1-216ENST00000628306 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.64■■■■■ 4.74
CAPNS1-216ENST00000628306 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.64■■■■■ 4.74
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCC8Q09428 1581 aa44.58■■■■■ 4.73
CAPNS1-216ENST00000628306 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.57■■■■■ 4.73
CAPNS1-216ENST00000628306 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.56■■■■■ 4.72
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGEF11O15085 1522 aa44.47■■■■■ 4.71
CAPNS1-216ENST00000628306 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.47■■■■■ 4.71
CAPNS1-216ENST00000628306 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.39■■■■■ 4.78e-9■□□□□ 10.5
CAPNS1-216ENST00000628306 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.33■■■■■ 4.69
CAPNS1-216ENST00000628306 CHD1O14646 1710 aa44.27■■■■■ 4.68
CAPNS1-216ENST00000628306 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.17■■■■■ 4.66
CAPNS1-216ENST00000628306 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.07■■■■■ 4.65
CAPNS1-216ENST00000628306 SOGA1O94964 1423 aa44.06■■■■■ 4.64
CAPNS1-216ENST00000628306 ARAP1Q96P48 1450 aa44.05■■■■■ 4.64
CAPNS1-216ENST00000628306 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.04■■■■■ 4.64
CAPNS1-216ENST00000628306 FBLN2P98095 1184 aa44■■■■■ 4.63
CAPNS1-216ENST00000628306 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.98■■■■■ 4.63
CAPNS1-216ENST00000628306 CUX1P39880 1505 aa43.94■■■■■ 4.62
CAPNS1-216ENST00000628306 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.91■■■■■ 4.62
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR97A6NE52 1622 aa43.9■■■■■ 4.62
CAPNS1-216ENST00000628306 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.83■■■■■ 4.61
CAPNS1-216ENST00000628306 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.76■■■■■ 4.6
CAPNS1-216ENST00000628306 GRIN2BQ13224 1484 aa43.72■■■■■ 4.59
CAPNS1-216ENST00000628306 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.65■■■■■ 4.58
CAPNS1-216ENST00000628306 SYNJ1O43426 1573 aa43.64■■■■■ 4.58
CAPNS1-216ENST00000628306 SYNJ2O15056 1496 aa43.62■■■■■ 4.57
CAPNS1-216ENST00000628306 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.58■■■■■ 4.57
CAPNS1-216ENST00000628306 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.52■■■■■ 4.56
CAPNS1-216ENST00000628306 PBRM1Q86U86 1689 aa43.52■■■■■ 4.56
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.48■■■■■ 4.55
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.46■■■■■ 4.55
CAPNS1-216ENST00000628306 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.23■■■■■ 4.51
CAPNS1-216ENST00000628306 GRIN2AQ12879 1464 aa43.18■■■■■ 4.5
CAPNS1-216ENST00000628306 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.17■■■■■ 4.5
CAPNS1-216ENST00000628306 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.15■■■■■ 4.5
CAPNS1-216ENST00000628306 ADAMTS12P58397 1594 aa43.14■■■■■ 4.5
CAPNS1-216ENST00000628306 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.11■■■■■ 4.49
CAPNS1-216ENST00000628306 NUP160Q12769 1436 aa43.11■■■■■ 4.49
CAPNS1-216ENST00000628306 TOP2BQ02880 1626 aa43.1■■■■■ 4.49
CAPNS1-216ENST00000628306 CEP170Q5SW79 1584 aa43.09■■■■■ 4.49
CAPNS1-216ENST00000628306 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.96■■■■■ 4.47
CAPNS1-216ENST00000628306 SHROOM2Q13796 1616 aa42.95■■■■■ 4.47
CAPNS1-216ENST00000628306 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.9■■■■■ 4.46
CAPNS1-216ENST00000628306 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.64■■■■■ 4.42
CAPNS1-216ENST00000628306 JPH4Q96JJ6 628 aa42.57■■■■■ 4.41
CAPNS1-216ENST00000628306 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.55■■■■■ 4.4
CAPNS1-216ENST00000628306 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.52■■■■■ 4.4
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