RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574882.5

TSPAN10-203, Transcript of tetraspanin 10, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSPAN10, Length 1,837 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN10-203ENST00000574882 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.33■■■■■ 6.45
TSPAN10-203ENST00000574882 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.36■■■■■ 5.33
TSPAN10-203ENST00000574882 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.51■■■■■ 5.04
TSPAN10-203ENST00000574882 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.8■■■■■ 4.92
TSPAN10-203ENST00000574882 ABCC9O60706 1549 aa45.58■■■■■ 4.89
TSPAN10-203ENST00000574882 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.55■■■■■ 4.88
TSPAN10-203ENST00000574882 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.26■■■■■ 4.84
TSPAN10-203ENST00000574882 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.03■■■■■ 4.8
TSPAN10-203ENST00000574882 NACADO15069 1562 aa44.98■■■■■ 4.79
TSPAN10-203ENST00000574882 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.6■■■■■ 4.73
TSPAN10-203ENST00000574882 SCRIBQ14160 1630 aa44.39■■■■■ 4.7
TSPAN10-203ENST00000574882 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.78■■■■■ 4.6
TSPAN10-203ENST00000574882 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.31■■■■■ 4.52
TSPAN10-203ENST00000574882 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.24■■■■■ 4.51
TSPAN10-203ENST00000574882 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.94■■■■■ 4.47
TSPAN10-203ENST00000574882 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.91■■■■■ 4.46
TSPAN10-203ENST00000574882 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.88■■■■■ 4.46
TSPAN10-203ENST00000574882 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.76■■■■■ 4.44
TSPAN10-203ENST00000574882 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.73■■■■■ 4.43
TSPAN10-203ENST00000574882 SMARCA4P51532 1647 aa42.58■■■■■ 4.41
TSPAN10-203ENST00000574882 WIZO95785 1651 aa42.42■■■■■ 4.38
TSPAN10-203ENST00000574882 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.07■■■■■ 4.32
TSPAN10-203ENST00000574882 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.99■■■■■ 4.31
TSPAN10-203ENST00000574882 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.93■■■■■ 4.3
TSPAN10-203ENST00000574882 SMARCA2P51531 1590 aa41.86■■■■■ 4.29
TSPAN10-203ENST00000574882 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.81■■■■■ 4.28
TSPAN10-203ENST00000574882 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.6■■■■■ 4.25
TSPAN10-203ENST00000574882 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.49■■■■■ 4.23
TSPAN10-203ENST00000574882 HMGXB3Q12766 1538 aa41.47■■■■■ 4.23
TSPAN10-203ENST00000574882 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.47■■■■■ 4.23
TSPAN10-203ENST00000574882 NCAPD3P42695 1498 aa41.46■■■■■ 4.23
TSPAN10-203ENST00000574882 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.31■■■■■ 4.2
TSPAN10-203ENST00000574882 TRIM41Q8WV44 630 aa40.74■■■■■ 4.11
TSPAN10-203ENST00000574882 ABCC8Q09428 1581 aa40.65■■■■■ 4.1
TSPAN10-203ENST00000574882 CFTRP13569 1480 aa40.55■■■■■ 4.08
TSPAN10-203ENST00000574882 PRDM2Q13029 1718 aa40.51■■■■■ 4.08
TSPAN10-203ENST00000574882 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.39■■■■■ 4.06
TSPAN10-203ENST00000574882 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.38■■■■■ 4.05
TSPAN10-203ENST00000574882 SYNJ1O43426 1573 aa40.25■■■■■ 4.03
TSPAN10-203ENST00000574882 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.12■■■■■ 4.01
TSPAN10-203ENST00000574882 TOP2BQ02880 1626 aa40.11■■■■■ 4.01
TSPAN10-203ENST00000574882 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.11■■■■■ 4.01
TSPAN10-203ENST00000574882 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.11■■■■■ 4.01
TSPAN10-203ENST00000574882 NESP48681 1621 aa40.03■■■■■ 4
TSPAN10-203ENST00000574882 CUX1P39880 1505 aa39.97■■■■□ 3.99
TSPAN10-203ENST00000574882 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.96■■■■□ 3.99
TSPAN10-203ENST00000574882 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.96■■■■□ 3.99
TSPAN10-203ENST00000574882 EEA1Q15075 1411 aa39.84■■■■□ 3.97
TSPAN10-203ENST00000574882 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.84■■■■□ 3.97
TSPAN10-203ENST00000574882 SOGA1O94964 1423 aa39.83■■■■□ 3.97
TSPAN10-203ENST00000574882 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.74■■■■□ 3.95
TSPAN10-203ENST00000574882 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.74■■■■□ 3.95
TSPAN10-203ENST00000574882 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.68■■■■□ 3.94
TSPAN10-203ENST00000574882 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.65■■■■□ 3.94
TSPAN10-203ENST00000574882 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.65■■■■□ 3.94
TSPAN10-203ENST00000574882 TOPBP1Q92547 1522 aa39.54■■■■□ 3.92
TSPAN10-203ENST00000574882 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.53■■■■□ 3.92
TSPAN10-203ENST00000574882 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.53■■■■□ 3.92
TSPAN10-203ENST00000574882 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.46■■■■□ 3.91
TSPAN10-203ENST00000574882 KIF27Q86VH2 1401 aa39.37■■■■□ 3.89
TSPAN10-203ENST00000574882 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.36■■■■□ 3.89
TSPAN10-203ENST00000574882 KIF21BO75037 1637 aa39.36■■■■□ 3.89
TSPAN10-203ENST00000574882 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.34■■■■□ 3.89
TSPAN10-203ENST00000574882 GOLGA3Q08378 1498 aa39.28■■■■□ 3.88
TSPAN10-203ENST00000574882 CUX2O14529 1486 aa39.26■■■■□ 3.88
TSPAN10-203ENST00000574882 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.26■■■■□ 3.88
TSPAN10-203ENST00000574882 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.19■■■■□ 3.86
TSPAN10-203ENST00000574882 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.17■■■■□ 3.86
TSPAN10-203ENST00000574882 WDR97A6NE52 1622 aa39.15■■■■□ 3.86
TSPAN10-203ENST00000574882 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.12■■■■□ 3.85
TSPAN10-203ENST00000574882 ERCC6Q03468 1493 aa39.11■■■■□ 3.85
TSPAN10-203ENST00000574882 PRXQ9BXM0 1461 aa39.1■■■■□ 3.85
TSPAN10-203ENST00000574882 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.09■■■■□ 3.85
TSPAN10-203ENST00000574882 WDR62O43379 1518 aa39.08■■■■□ 3.85
TSPAN10-203ENST00000574882 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.05■■■■□ 3.84
TSPAN10-203ENST00000574882 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.02■■■■□ 3.84
TSPAN10-203ENST00000574882 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.98■■■■□ 3.83
TSPAN10-203ENST00000574882 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.98■■■■□ 3.83
TSPAN10-203ENST00000574882 IGF1RP08069 1367 aa38.97■■■■□ 3.83
TSPAN10-203ENST00000574882 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.92■■■■□ 3.82
TSPAN10-203ENST00000574882 CEP162Q5TB80 1403 aa38.92■■■■□ 3.82
TSPAN10-203ENST00000574882 CUL7Q14999 1698 aa38.81■■■■□ 3.8
TSPAN10-203ENST00000574882 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.79■■■■□ 3.8
TSPAN10-203ENST00000574882 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.78■■■■□ 3.8
TSPAN10-203ENST00000574882 IFT140Q96RY7 1462 aa38.78■■■■□ 3.8
TSPAN10-203ENST00000574882 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.77■■■■□ 3.8
TSPAN10-203ENST00000574882 PBRM1Q86U86 1689 aa38.67■■■■□ 3.78
TSPAN10-203ENST00000574882 CLIP1P30622 1438 aa38.62■■■■□ 3.77
TSPAN10-203ENST00000574882 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.53■■■■□ 3.76
TSPAN10-203ENST00000574882 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.52■■■■□ 3.76
TSPAN10-203ENST00000574882 GRIN2BQ13224 1484 aa38.49■■■■□ 3.75
TSPAN10-203ENST00000574882 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.47■■■■□ 3.75
TSPAN10-203ENST00000574882 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.42■■■■□ 3.74
TSPAN10-203ENST00000574882 ADAMTS12P58397 1594 aa38.41■■■■□ 3.74
TSPAN10-203ENST00000574882 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.36■■■■□ 3.73
TSPAN10-203ENST00000574882 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP38.33■■■■□ 3.73
TSPAN10-203ENST00000574882 VPS8Q8N3P4 1428 aa38.3■■■■□ 3.72
TSPAN10-203ENST00000574882 ARAP1Q96P48 1450 aa38.26■■■■□ 3.71
TSPAN10-203ENST00000574882 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.25■■■■□ 3.71
TSPAN10-203ENST00000574882 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.23■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.2 ms