RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640041.1

TCEA1-213, Transcript of transcription elongation factor A1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TCEA1, Length 1,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1-213ENST00000640041 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.65■■■■■ 6.98
TCEA1-213ENST00000640041 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.19■■■■■ 5.95
TCEA1-213ENST00000640041 ABCC9O60706 1549 aa51.42■■■■■ 5.82
TCEA1-213ENST00000640041 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.28■■■■■ 5.48
TCEA1-213ENST00000640041 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.22■■■■■ 5.47
TCEA1-213ENST00000640041 NACADO15069 1562 aa49.15■■■■■ 5.46
TCEA1-213ENST00000640041 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.8■■■■■ 5.4
TCEA1-213ENST00000640041 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.73■■■■■ 5.39
TCEA1-213ENST00000640041 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.45■■■■■ 5.35
TCEA1-213ENST00000640041 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.13■■■■■ 5.3
TCEA1-213ENST00000640041 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.04■■■■■ 5.28
TCEA1-213ENST00000640041 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.81■■■■■ 5.24
TCEA1-213ENST00000640041 SCRIBQ14160 1630 aa47.7■■■■■ 5.23
TCEA1-213ENST00000640041 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.42■■■■■ 5.18
TCEA1-213ENST00000640041 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.21■■■■■ 5.15
TCEA1-213ENST00000640041 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.58■■■■■ 5.05
TCEA1-213ENST00000640041 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.46■■■■■ 5.03
TCEA1-213ENST00000640041 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.2■■■■■ 4.99
TCEA1-213ENST00000640041 SMARCA4P51532 1647 aa45.55■■■■■ 4.88
TCEA1-213ENST00000640041 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.46■■■■■ 4.87
TCEA1-213ENST00000640041 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.37■■■■■ 4.85
TCEA1-213ENST00000640041 NCAPD3P42695 1498 aa45.36■■■■■ 4.85
TCEA1-213ENST00000640041 SMARCA2P51531 1590 aa45.29■■■■■ 4.84
TCEA1-213ENST00000640041 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.23■■■■■ 4.83
TCEA1-213ENST00000640041 HMGXB3Q12766 1538 aa45.11■■■■■ 4.81
TCEA1-213ENST00000640041 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.07■■■■■ 4.8
TCEA1-213ENST00000640041 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.01■■■■■ 4.8
TCEA1-213ENST00000640041 WIZO95785 1651 aa44.73■■■■■ 4.75
TCEA1-213ENST00000640041 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.61■■■■■ 4.73
TCEA1-213ENST00000640041 NESP48681 1621 aa44.42■■■■■ 4.7
TCEA1-213ENST00000640041 ERCC6Q03468 1493 aa44.33■■■■■ 4.69
TCEA1-213ENST00000640041 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.21■■■■■ 4.67
TCEA1-213ENST00000640041 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.2■■■■■ 4.67
TCEA1-213ENST00000640041 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.05■■■■■ 4.64
TCEA1-213ENST00000640041 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.94■■■■■ 4.62
TCEA1-213ENST00000640041 CUX2O14529 1486 aa43.89■■■■■ 4.62
TCEA1-213ENST00000640041 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.84■■■■■ 4.61
TCEA1-213ENST00000640041 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.75■■■■■ 4.59
TCEA1-213ENST00000640041 CFTRP13569 1480 aa43.73■■■■■ 4.59
TCEA1-213ENST00000640041 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.71■■■■■ 4.59
TCEA1-213ENST00000640041 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.57■■■■■ 4.56
TCEA1-213ENST00000640041 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.53■■■■■ 4.56
TCEA1-213ENST00000640041 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.51■■■■■ 4.56
TCEA1-213ENST00000640041 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.39■■■■■ 4.54
TCEA1-213ENST00000640041 WDR62O43379 1518 aa43.36■■■■■ 4.53
TCEA1-213ENST00000640041 PRDM2Q13029 1718 aa43.31■■■■■ 4.52
TCEA1-213ENST00000640041 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.15■■■■■ 4.5
TCEA1-213ENST00000640041 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.86■■■■■ 4.45
TCEA1-213ENST00000640041 TOPBP1Q92547 1522 aa42.84■■■■■ 4.45
TCEA1-213ENST00000640041 ABCC8Q09428 1581 aa42.78■■■■■ 4.44
TCEA1-213ENST00000640041 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.75■■■■■ 4.43
TCEA1-213ENST00000640041 IFT140Q96RY7 1462 aa42.62■■■■■ 4.41
TCEA1-213ENST00000640041 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.49■■■■■ 4.39
TCEA1-213ENST00000640041 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.46■■■■■ 4.39
TCEA1-213ENST00000640041 CUX1P39880 1505 aa42.44■■■■■ 4.38
TCEA1-213ENST00000640041 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.37■■■■■ 4.37
TCEA1-213ENST00000640041 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.34■■■■■ 4.37
TCEA1-213ENST00000640041 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.31■■■■■ 4.36
TCEA1-213ENST00000640041 SOGA1O94964 1423 aa42.29■■■■■ 4.36
TCEA1-213ENST00000640041 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.28■■■■■ 4.36
TCEA1-213ENST00000640041 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.23■■■■■ 4.354e-8■■■■□ 23.2
TCEA1-213ENST00000640041 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.12■■■■■ 4.33
TCEA1-213ENST00000640041 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.07■■■■■ 4.33
TCEA1-213ENST00000640041 OSCARQ8IYS5 282 aa42.07■■■■■ 4.33
TCEA1-213ENST00000640041 SYNJ1O43426 1573 aa41.99■■■■■ 4.31
TCEA1-213ENST00000640041 TOP2BQ02880 1626 aa41.98■■■■■ 4.31
TCEA1-213ENST00000640041 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.97■■■■■ 4.31
TCEA1-213ENST00000640041 WDR97A6NE52 1622 aa41.96■■■■■ 4.31
TCEA1-213ENST00000640041 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.88■■■■■ 4.29
TCEA1-213ENST00000640041 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.82■■■■■ 4.29
TCEA1-213ENST00000640041 GRIN2BQ13224 1484 aa41.81■■■■■ 4.28
TCEA1-213ENST00000640041 FBLN2P98095 1184 aa41.81■■■■■ 4.28
TCEA1-213ENST00000640041 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.79■■■■■ 4.28
TCEA1-213ENST00000640041 CHD1O14646 1710 aa41.78■■■■■ 4.28
TCEA1-213ENST00000640041 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.73■■■■■ 4.27
TCEA1-213ENST00000640041 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.71■■■■■ 4.27
TCEA1-213ENST00000640041 PBRM1Q86U86 1689 aa41.69■■■■■ 4.26
TCEA1-213ENST00000640041 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.62■■■■■ 4.25
TCEA1-213ENST00000640041 SYNJ2O15056 1496 aa41.57■■■■■ 4.25
TCEA1-213ENST00000640041 TRIM41Q8WV44 630 aa41.44■■■■■ 4.22
TCEA1-213ENST00000640041 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.41■■■■■ 4.22
TCEA1-213ENST00000640041 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.41■■■■■ 4.22
TCEA1-213ENST00000640041 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.41■■■■■ 4.22
TCEA1-213ENST00000640041 ARHGEF11O15085 1522 aa41.38■■■■■ 4.21
TCEA1-213ENST00000640041 ADAMTS12P58397 1594 aa41.37■■■■■ 4.21
TCEA1-213ENST00000640041 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.36■■■■■ 4.21
TCEA1-213ENST00000640041 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.32■■■■■ 4.2
TCEA1-213ENST00000640041 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.29■■■■■ 4.2
TCEA1-213ENST00000640041 GRIN2AQ12879 1464 aa41.28■■■■■ 4.2
TCEA1-213ENST00000640041 KIF27Q86VH2 1401 aa41.2■■■■■ 4.19
TCEA1-213ENST00000640041 CEP170Q5SW79 1584 aa41.1■■■■■ 4.17
TCEA1-213ENST00000640041 NUP160Q12769 1436 aa41.09■■■■■ 4.17
TCEA1-213ENST00000640041 IGF1RP08069 1367 aa41.07■■■■■ 4.16
TCEA1-213ENST00000640041 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.06■■■■■ 4.16
TCEA1-213ENST00000640041 ARAP1Q96P48 1450 aa41.04■■■■■ 4.16
TCEA1-213ENST00000640041 CUL7Q14999 1698 aa40.94■■■■■ 4.14
TCEA1-213ENST00000640041 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.83■■■■■ 4.13
TCEA1-213ENST00000640041 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.82■■■■■ 4.12
TCEA1-213ENST00000640041 SHROOM2Q13796 1616 aa40.78■■■■■ 4.12
TCEA1-213ENST00000640041 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.78■■■■■ 4.12
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