RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557471.5

PAPOLA-225, Transcript of poly(A) polymerase alpha, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PAPOLA, Length 1,421 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLA-225ENST00000557471 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.55■■■■■ 6.8
PAPOLA-225ENST00000557471 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.92■■■■■ 5.74
PAPOLA-225ENST00000557471 ABCC9O60706 1549 aa49.44■■■■■ 5.5
PAPOLA-225ENST00000557471 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.1■■■■■ 5.29
PAPOLA-225ENST00000557471 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48■■■■■ 5.27
PAPOLA-225ENST00000557471 NACADO15069 1562 aa47.83■■■■■ 5.25
PAPOLA-225ENST00000557471 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.79■■■■■ 5.24
PAPOLA-225ENST00000557471 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.69■■■■■ 5.22
PAPOLA-225ENST00000557471 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.64■■■■■ 5.22
PAPOLA-225ENST00000557471 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.52■■■■■ 5.04
PAPOLA-225ENST00000557471 SCRIBQ14160 1630 aa46.5■■■■■ 5.03
PAPOLA-225ENST00000557471 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.33■■■■■ 5.01
PAPOLA-225ENST00000557471 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.19■■■■■ 4.98
PAPOLA-225ENST00000557471 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.88■■■■■ 4.94
PAPOLA-225ENST00000557471 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.01■■■■■ 4.8
PAPOLA-225ENST00000557471 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.92■■■■■ 4.78
PAPOLA-225ENST00000557471 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.74■■■■■ 4.75
PAPOLA-225ENST00000557471 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.7■■■■■ 4.75
PAPOLA-225ENST00000557471 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.6■■■■■ 4.73
PAPOLA-225ENST00000557471 SMARCA4P51532 1647 aa44.52■■■■■ 4.72
PAPOLA-225ENST00000557471 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.32■■■■■ 4.69
PAPOLA-225ENST00000557471 SMARCA2P51531 1590 aa44.21■■■■■ 4.67
PAPOLA-225ENST00000557471 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.21■■■■■ 4.67
PAPOLA-225ENST00000557471 NCAPD3P42695 1498 aa44.14■■■■■ 4.66
PAPOLA-225ENST00000557471 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.07■■■■■ 4.65
PAPOLA-225ENST00000557471 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.02■■■■■ 4.64
PAPOLA-225ENST00000557471 HMGXB3Q12766 1538 aa43.93■■■■■ 4.62
PAPOLA-225ENST00000557471 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.91■■■■■ 4.62
PAPOLA-225ENST00000557471 WIZO95785 1651 aa43.85■■■■■ 4.61
PAPOLA-225ENST00000557471 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.45■■■■■ 4.55
PAPOLA-225ENST00000557471 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.39■■■■■ 4.54
PAPOLA-225ENST00000557471 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.96■■■■■ 4.47
PAPOLA-225ENST00000557471 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.92■■■■■ 4.46
PAPOLA-225ENST00000557471 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.89■■■■■ 4.46
PAPOLA-225ENST00000557471 NESP48681 1621 aa42.87■■■■■ 4.45
PAPOLA-225ENST00000557471 CFTRP13569 1480 aa42.71■■■■■ 4.43
PAPOLA-225ENST00000557471 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.69■■■■■ 4.42
PAPOLA-225ENST00000557471 ERCC6Q03468 1493 aa42.66■■■■■ 4.42
PAPOLA-225ENST00000557471 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.39■■■■■ 4.38
PAPOLA-225ENST00000557471 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.33■■■■■ 4.37
PAPOLA-225ENST00000557471 PRDM2Q13029 1718 aa42.32■■■■■ 4.36
PAPOLA-225ENST00000557471 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.31■■■■■ 4.36
PAPOLA-225ENST00000557471 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.13■■■■■ 4.33
PAPOLA-225ENST00000557471 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.08■■■■■ 4.33
PAPOLA-225ENST00000557471 CUX2O14529 1486 aa42■■■■■ 4.31
PAPOLA-225ENST00000557471 WDR62O43379 1518 aa41.92■■■■■ 4.3
PAPOLA-225ENST00000557471 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.87■■■■■ 4.29
PAPOLA-225ENST00000557471 ABCC8Q09428 1581 aa41.87■■■■■ 4.29
PAPOLA-225ENST00000557471 TOPBP1Q92547 1522 aa41.73■■■■■ 4.27
PAPOLA-225ENST00000557471 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.72■■■■■ 4.27
PAPOLA-225ENST00000557471 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.55■■■■■ 4.24
PAPOLA-225ENST00000557471 CUX1P39880 1505 aa41.55■■■■■ 4.24
PAPOLA-225ENST00000557471 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.41■■■■■ 4.22
PAPOLA-225ENST00000557471 IFT140Q96RY7 1462 aa41.41■■■■■ 4.22
PAPOLA-225ENST00000557471 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.38■■■■■ 4.21
PAPOLA-225ENST00000557471 TOP2BQ02880 1626 aa41.34■■■■■ 4.21
PAPOLA-225ENST00000557471 SOGA1O94964 1423 aa41.33■■■■■ 4.21
PAPOLA-225ENST00000557471 SYNJ1O43426 1573 aa41.3■■■■■ 4.2
PAPOLA-225ENST00000557471 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.3■■■■■ 4.2
PAPOLA-225ENST00000557471 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.22■■■■■ 4.19
PAPOLA-225ENST00000557471 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.19■■■■■ 4.18
PAPOLA-225ENST00000557471 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.1■■■■■ 4.17
PAPOLA-225ENST00000557471 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.02■■■■■ 4.16
PAPOLA-225ENST00000557471 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.01■■■■■ 4.16
PAPOLA-225ENST00000557471 TRIM41Q8WV44 630 aa41.01■■■■■ 4.15
PAPOLA-225ENST00000557471 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.98■■■■■ 4.152e-10■■■■□ 19.7
PAPOLA-225ENST00000557471 WDR97A6NE52 1622 aa40.96■■■■■ 4.15
PAPOLA-225ENST00000557471 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
PAPOLA-225ENST00000557471 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.84■■■■■ 4.13
PAPOLA-225ENST00000557471 GRIN2BQ13224 1484 aa40.77■■■■■ 4.12
PAPOLA-225ENST00000557471 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.74■■■■■ 4.11
PAPOLA-225ENST00000557471 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.71■■■■■ 4.11
PAPOLA-225ENST00000557471 KIF27Q86VH2 1401 aa40.68■■■■■ 4.1
PAPOLA-225ENST00000557471 PBRM1Q86U86 1689 aa40.61■■■■■ 4.09
PAPOLA-225ENST00000557471 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.6■■■■■ 4.09
PAPOLA-225ENST00000557471 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.6■■■■■ 4.09
PAPOLA-225ENST00000557471 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.55■■■■■ 4.08
PAPOLA-225ENST00000557471 FBLN2P98095 1184 aa40.54■■■■■ 4.08
PAPOLA-225ENST00000557471 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.5■■■■■ 4.07
PAPOLA-225ENST00000557471 OSCARQ8IYS5 282 aa40.46■■■■■ 4.07
PAPOLA-225ENST00000557471 SYNJ2O15056 1496 aa40.43■■■■■ 4.06
PAPOLA-225ENST00000557471 IGF1RP08069 1367 aa40.42■■■■■ 4.06
PAPOLA-225ENST00000557471 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.4■■■■■ 4.06
PAPOLA-225ENST00000557471 ADAMTS12P58397 1594 aa40.33■■■■■ 4.05
PAPOLA-225ENST00000557471 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.32■■■■■ 4.05
PAPOLA-225ENST00000557471 CHD1O14646 1710 aa40.31■■■■■ 4.04
PAPOLA-225ENST00000557471 CUL7Q14999 1698 aa40.25■■■■■ 4.03
PAPOLA-225ENST00000557471 EEA1Q15075 1411 aa40.24■■■■■ 4.03
PAPOLA-225ENST00000557471 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.23■■■■■ 4.03
PAPOLA-225ENST00000557471 GRIN2AQ12879 1464 aa40.21■■■■■ 4.03
PAPOLA-225ENST00000557471 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.21■■■■■ 4.03
PAPOLA-225ENST00000557471 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.14■■■■■ 4.02
PAPOLA-225ENST00000557471 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.08■■■■■ 4.01
PAPOLA-225ENST00000557471 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.02■■■■■ 4
PAPOLA-225ENST00000557471 NUP160Q12769 1436 aa40■■■■□ 3.99
PAPOLA-225ENST00000557471 PRXQ9BXM0 1461 aa39.94■■■■□ 3.98
PAPOLA-225ENST00000557471 CEP170Q5SW79 1584 aa39.92■■■■□ 3.98
PAPOLA-225ENST00000557471 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.91■■■■□ 3.98
PAPOLA-225ENST00000557471 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa39.78■■■■□ 3.96
PAPOLA-225ENST00000557471 JPH4Q96JJ6 628 aa39.72■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.3 ms