RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369206.5

VAX1-202, Transcript of ventral anterior homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene VAX1, Length 1,723 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1-202ENST00000369206 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.17■■■■■ 6.58
VAX1-202ENST00000369206 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.27■■■■■ 5.48
VAX1-202ENST00000369206 ABCC9O60706 1549 aa47.16■■■■■ 5.14
VAX1-202ENST00000369206 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.05■■■■■ 5.12
VAX1-202ENST00000369206 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.61■■■■■ 5.05
VAX1-202ENST00000369206 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.42■■■■■ 5.02
VAX1-202ENST00000369206 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.11■■■■■ 4.97
VAX1-202ENST00000369206 NACADO15069 1562 aa46.03■■■■■ 4.96
VAX1-202ENST00000369206 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.79■■■■■ 4.92
VAX1-202ENST00000369206 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.39■■■■■ 4.86
VAX1-202ENST00000369206 SCRIBQ14160 1630 aa45.23■■■■■ 4.83
VAX1-202ENST00000369206 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.86■■■■■ 4.77
VAX1-202ENST00000369206 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.42■■■■■ 4.7
VAX1-202ENST00000369206 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.36■■■■■ 4.69
VAX1-202ENST00000369206 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.7■■■■■ 4.59
VAX1-202ENST00000369206 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.42■■■■■ 4.54
VAX1-202ENST00000369206 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.37■■■■■ 4.53
VAX1-202ENST00000369206 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.37■■■■■ 4.53
VAX1-202ENST00000369206 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.32■■■■■ 4.53
VAX1-202ENST00000369206 SMARCA4P51532 1647 aa43.31■■■■■ 4.52
VAX1-202ENST00000369206 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.14■■■■■ 4.5
VAX1-202ENST00000369206 WIZO95785 1651 aa43■■■■■ 4.47
VAX1-202ENST00000369206 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.8■■■■■ 4.44
VAX1-202ENST00000369206 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.75■■■■■ 4.43
VAX1-202ENST00000369206 SMARCA2P51531 1590 aa42.71■■■■■ 4.43
VAX1-202ENST00000369206 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.66■■■■■ 4.42
VAX1-202ENST00000369206 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.52■■■■■ 4.4
VAX1-202ENST00000369206 NCAPD3P42695 1498 aa42.48■■■■■ 4.39
VAX1-202ENST00000369206 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.48■■■■■ 4.39
VAX1-202ENST00000369206 HMGXB3Q12766 1538 aa42.37■■■■■ 4.37
VAX1-202ENST00000369206 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.15■■■■■ 4.34
VAX1-202ENST00000369206 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.08■■■■■ 4.33
VAX1-202ENST00000369206 CFTRP13569 1480 aa41.37■■■■■ 4.21
VAX1-202ENST00000369206 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.36■■■■■ 4.21
VAX1-202ENST00000369206 NESP48681 1621 aa41.21■■■■■ 4.19
VAX1-202ENST00000369206 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.17■■■■■ 4.18
VAX1-202ENST00000369206 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.15■■■■■ 4.18
VAX1-202ENST00000369206 PRDM2Q13029 1718 aa41.13■■■■■ 4.18
VAX1-202ENST00000369206 ABCC8Q09428 1581 aa41.01■■■■■ 4.16
VAX1-202ENST00000369206 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.9■■■■■ 4.14
VAX1-202ENST00000369206 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.85■■■■■ 4.13
VAX1-202ENST00000369206 TRIM41Q8WV44 630 aa40.81■■■■■ 4.12
VAX1-202ENST00000369206 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.81■■■■■ 4.12
VAX1-202ENST00000369206 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.72■■■■■ 4.11
VAX1-202ENST00000369206 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.71■■■■■ 4.11
VAX1-202ENST00000369206 SYNJ1O43426 1573 aa40.67■■■■■ 4.1
VAX1-202ENST00000369206 CUX1P39880 1505 aa40.59■■■■■ 4.09
VAX1-202ENST00000369206 TOP2BQ02880 1626 aa40.55■■■■■ 4.08
VAX1-202ENST00000369206 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.52■■■■■ 4.08
VAX1-202ENST00000369206 ERCC6Q03468 1493 aa40.51■■■■■ 4.08
VAX1-202ENST00000369206 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.43■■■■■ 4.06
VAX1-202ENST00000369206 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.42■■■■■ 4.06
VAX1-202ENST00000369206 TOPBP1Q92547 1522 aa40.4■■■■■ 4.06
VAX1-202ENST00000369206 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.37■■■■■ 4.05
VAX1-202ENST00000369206 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.25■■■■■ 4.03
VAX1-202ENST00000369206 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
VAX1-202ENST00000369206 WDR62O43379 1518 aa40.17■■■■■ 4.02
VAX1-202ENST00000369206 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
VAX1-202ENST00000369206 SOGA1O94964 1423 aa40.1■■■■■ 4.01
VAX1-202ENST00000369206 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.06■■■■■ 4
VAX1-202ENST00000369206 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.02■■■■■ 4
VAX1-202ENST00000369206 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.99■■■■□ 3.99
VAX1-202ENST00000369206 CUX2O14529 1486 aa39.91■■■■□ 3.98
VAX1-202ENST00000369206 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.88■■■■□ 3.97
VAX1-202ENST00000369206 EEA1Q15075 1411 aa39.87■■■■□ 3.97
VAX1-202ENST00000369206 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.84■■■■□ 3.97
VAX1-202ENST00000369206 KIF27Q86VH2 1401 aa39.83■■■■□ 3.97
VAX1-202ENST00000369206 WDR97A6NE52 1622 aa39.81■■■■□ 3.96
VAX1-202ENST00000369206 IFT140Q96RY7 1462 aa39.77■■■■□ 3.96
VAX1-202ENST00000369206 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.74■■■■□ 3.95
VAX1-202ENST00000369206 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.69■■■■□ 3.94
VAX1-202ENST00000369206 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.6■■■■□ 3.93
VAX1-202ENST00000369206 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.59■■■■□ 3.93
VAX1-202ENST00000369206 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.58■■■■□ 3.93
VAX1-202ENST00000369206 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.56■■■■□ 3.92
VAX1-202ENST00000369206 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.54■■■■□ 3.92
VAX1-202ENST00000369206 IGF1RP08069 1367 aa39.54■■■■□ 3.92
VAX1-202ENST00000369206 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.54■■■■□ 3.92
VAX1-202ENST00000369206 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.44■■■■□ 3.9
VAX1-202ENST00000369206 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.4■■■■□ 3.9
VAX1-202ENST00000369206 KIF21BO75037 1637 aa39.4■■■■□ 3.9
VAX1-202ENST00000369206 PRXQ9BXM0 1461 aa39.4■■■■□ 3.9
VAX1-202ENST00000369206 PBRM1Q86U86 1689 aa39.39■■■■□ 3.9
VAX1-202ENST00000369206 GRIN2BQ13224 1484 aa39.35■■■■□ 3.89
VAX1-202ENST00000369206 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.33■■■■□ 3.89
VAX1-202ENST00000369206 GOLGA3Q08378 1498 aa39.31■■■■□ 3.88
VAX1-202ENST00000369206 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.31■■■■□ 3.88
VAX1-202ENST00000369206 CUL7Q14999 1698 aa39.29■■■■□ 3.88
VAX1-202ENST00000369206 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.19■■■■□ 3.86
VAX1-202ENST00000369206 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.17■■■■□ 3.86
VAX1-202ENST00000369206 ADAMTS12P58397 1594 aa39.14■■■■□ 3.86
VAX1-202ENST00000369206 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.12■■■■□ 3.85
VAX1-202ENST00000369206 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.08■■■■□ 3.85
VAX1-202ENST00000369206 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.06■■■■□ 3.84
VAX1-202ENST00000369206 SYNJ2O15056 1496 aa38.94■■■■□ 3.82
VAX1-202ENST00000369206 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.89■■■■□ 3.82
VAX1-202ENST00000369206 FBLN2P98095 1184 aa38.88■■■■□ 3.81
VAX1-202ENST00000369206 GRIN2AQ12879 1464 aa38.86■■■■□ 3.81
VAX1-202ENST00000369206 CEP162Q5TB80 1403 aa38.81■■■■□ 3.8
VAX1-202ENST00000369206 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.78■■■■□ 3.8
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