RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395019.3

CTF1-202, Transcript of cardiotrophin 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTF1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1-202ENST00000395019 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.72■■■■■ 6.67
CTF1-202ENST00000395019 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.05■■■■■ 5.6
CTF1-202ENST00000395019 ABCC9O60706 1549 aa48.27■■■■■ 5.32
CTF1-202ENST00000395019 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.43■■■■■ 5.18
CTF1-202ENST00000395019 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.05■■■■■ 5.12
CTF1-202ENST00000395019 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.87■■■■■ 5.09
CTF1-202ENST00000395019 NACADO15069 1562 aa46.8■■■■■ 5.08
CTF1-202ENST00000395019 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.71■■■■■ 5.07
CTF1-202ENST00000395019 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.68■■■■■ 5.06
CTF1-202ENST00000395019 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.91■■■■■ 4.94
CTF1-202ENST00000395019 SCRIBQ14160 1630 aa45.86■■■■■ 4.93
CTF1-202ENST00000395019 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.43■■■■■ 4.86
CTF1-202ENST00000395019 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.39■■■■■ 4.86
CTF1-202ENST00000395019 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.24■■■■■ 4.83
CTF1-202ENST00000395019 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.19■■■■■ 4.66
CTF1-202ENST00000395019 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.06■■■■■ 4.64
CTF1-202ENST00000395019 SMARCA4P51532 1647 aa43.88■■■■■ 4.62
CTF1-202ENST00000395019 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.86■■■■■ 4.61
CTF1-202ENST00000395019 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.81■■■■■ 4.6
CTF1-202ENST00000395019 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.71■■■■■ 4.59
CTF1-202ENST00000395019 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.62■■■■■ 4.57
CTF1-202ENST00000395019 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.6■■■■■ 4.57
CTF1-202ENST00000395019 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.53■■■■■ 4.56
CTF1-202ENST00000395019 WIZO95785 1651 aa43.44■■■■■ 4.54
CTF1-202ENST00000395019 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.38■■■■■ 4.53
CTF1-202ENST00000395019 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.38■■■■■ 4.53
CTF1-202ENST00000395019 SMARCA2P51531 1590 aa43.31■■■■■ 4.52
CTF1-202ENST00000395019 NCAPD3P42695 1498 aa43.17■■■■■ 4.5
CTF1-202ENST00000395019 HMGXB3Q12766 1538 aa43.07■■■■■ 4.48
CTF1-202ENST00000395019 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.05■■■■■ 4.48
CTF1-202ENST00000395019 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.89■■■■■ 4.46
CTF1-202ENST00000395019 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.41■■■■■ 4.38
CTF1-202ENST00000395019 NESP48681 1621 aa42.07■■■■■ 4.33
CTF1-202ENST00000395019 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.96■■■■■ 4.31
CTF1-202ENST00000395019 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.93■■■■■ 4.3
CTF1-202ENST00000395019 CFTRP13569 1480 aa41.91■■■■■ 4.3
CTF1-202ENST00000395019 PRDM2Q13029 1718 aa41.81■■■■■ 4.28
CTF1-202ENST00000395019 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.77■■■■■ 4.28
CTF1-202ENST00000395019 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.64■■■■■ 4.26
CTF1-202ENST00000395019 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.55■■■■■ 4.24
CTF1-202ENST00000395019 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.53■■■■■ 4.24
CTF1-202ENST00000395019 ERCC6Q03468 1493 aa41.45■■■■■ 4.23
CTF1-202ENST00000395019 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.39■■■■■ 4.22
CTF1-202ENST00000395019 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
CTF1-202ENST00000395019 ABCC8Q09428 1581 aa41.22■■■■■ 4.19
CTF1-202ENST00000395019 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.15■■■■■ 4.18
CTF1-202ENST00000395019 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.14■■■■■ 4.18
CTF1-202ENST00000395019 TRIM41Q8WV44 630 aa41.04■■■■■ 4.16
CTF1-202ENST00000395019 CUX1P39880 1505 aa41.04■■■■■ 4.16
CTF1-202ENST00000395019 WDR62O43379 1518 aa41.03■■■■■ 4.16
CTF1-202ENST00000395019 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.99■■■■■ 4.15
CTF1-202ENST00000395019 TOPBP1Q92547 1522 aa40.99■■■■■ 4.15
CTF1-202ENST00000395019 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.98■■■■■ 4.15
CTF1-202ENST00000395019 SYNJ1O43426 1573 aa40.97■■■■■ 4.15
CTF1-202ENST00000395019 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.88■■■■■ 4.13
CTF1-202ENST00000395019 TOP2BQ02880 1626 aa40.86■■■■■ 4.13
CTF1-202ENST00000395019 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.73■■■■■ 4.11
CTF1-202ENST00000395019 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.7■■■■■ 4.11
CTF1-202ENST00000395019 CUX2O14529 1486 aa40.66■■■■■ 4.1
CTF1-202ENST00000395019 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.56■■■■■ 4.08
CTF1-202ENST00000395019 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.53■■■■■ 4.08
CTF1-202ENST00000395019 SOGA1O94964 1423 aa40.49■■■■■ 4.07
CTF1-202ENST00000395019 IFT140Q96RY7 1462 aa40.44■■■■■ 4.06
CTF1-202ENST00000395019 WDR97A6NE52 1622 aa40.44■■■■■ 4.06
CTF1-202ENST00000395019 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.34■■■■■ 4.05
CTF1-202ENST00000395019 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.32■■■■■ 4.05
CTF1-202ENST00000395019 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.24■■■■■ 4.03
CTF1-202ENST00000395019 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.22■■■■■ 4.03
CTF1-202ENST00000395019 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.22■■■■■ 4.03
CTF1-202ENST00000395019 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.18■■■■■ 4.02
CTF1-202ENST00000395019 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.18■■■■■ 4.02
CTF1-202ENST00000395019 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.12■■■■■ 4.01
CTF1-202ENST00000395019 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.11■■■■■ 4.01
CTF1-202ENST00000395019 EEA1Q15075 1411 aa40.11■■■■■ 4.01
CTF1-202ENST00000395019 PBRM1Q86U86 1689 aa40.06■■■■■ 4
CTF1-202ENST00000395019 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.05■■■■■ 4
CTF1-202ENST00000395019 KIF27Q86VH2 1401 aa40.01■■■■■ 4
CTF1-202ENST00000395019 GRIN2BQ13224 1484 aa39.9■■■■□ 3.98
CTF1-202ENST00000395019 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.86■■■■□ 3.97
CTF1-202ENST00000395019 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.83■■■■□ 3.97
CTF1-202ENST00000395019 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.82■■■■□ 3.96
CTF1-202ENST00000395019 IGF1RP08069 1367 aa39.8■■■■□ 3.96
CTF1-202ENST00000395019 ADAMTS12P58397 1594 aa39.72■■■■□ 3.95
CTF1-202ENST00000395019 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.7■■■■□ 3.95
CTF1-202ENST00000395019 CUL7Q14999 1698 aa39.67■■■■□ 3.94
CTF1-202ENST00000395019 CHD1O14646 1710 aa39.62■■■■□ 3.93
CTF1-202ENST00000395019 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.61■■■■□ 3.93
CTF1-202ENST00000395019 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.57■■■■□ 3.93
CTF1-202ENST00000395019 KIF21BO75037 1637 aa39.56■■■■□ 3.92
CTF1-202ENST00000395019 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.56■■■■□ 3.92
CTF1-202ENST00000395019 SYNJ2O15056 1496 aa39.55■■■■□ 3.92
CTF1-202ENST00000395019 GOLGA3Q08378 1498 aa39.51■■■■□ 3.92
CTF1-202ENST00000395019 PRXQ9BXM0 1461 aa39.51■■■■□ 3.92
CTF1-202ENST00000395019 FBLN2P98095 1184 aa39.47■■■■□ 3.91
CTF1-202ENST00000395019 GRIN2AQ12879 1464 aa39.44■■■■□ 3.9
CTF1-202ENST00000395019 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.43■■■■□ 3.9
CTF1-202ENST00000395019 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.42■■■■□ 3.9
CTF1-202ENST00000395019 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.4■■■■□ 3.9
CTF1-202ENST00000395019 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.3■■■■□ 3.88
CTF1-202ENST00000395019 CEP170Q5SW79 1584 aa39.3■■■■□ 3.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.6 ms