RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341756.10

MPC1-201, Transcript of mitochondrial pyruvate carrier 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MPC1, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MPC1-201ENST00000341756 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.07■■■■■ 7.05
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MPC1-201ENST00000341756 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.78■■■■■ 5.56
MPC1-201ENST00000341756 NACADO15069 1562 aa49.65■■■■■ 5.54
MPC1-201ENST00000341756 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.41■■■■■ 5.5
MPC1-201ENST00000341756 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.29■■■■■ 5.48
MPC1-201ENST00000341756 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.16■■■■■ 5.46
MPC1-201ENST00000341756 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.96■■■■■ 5.43
MPC1-201ENST00000341756 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.49■■■■■ 5.35
MPC1-201ENST00000341756 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.19■■■■■ 5.38e-6■□□□□ 8.9
MPC1-201ENST00000341756 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.09■■■■■ 5.29
MPC1-201ENST00000341756 SCRIBQ14160 1630 aa47.98■■■■■ 5.27
MPC1-201ENST00000341756 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.85■■■■■ 5.25
MPC1-201ENST00000341756 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.5■■■■■ 5.19
MPC1-201ENST00000341756 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.94■■■■■ 5.1
MPC1-201ENST00000341756 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.79■■■■■ 5.08
MPC1-201ENST00000341756 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.54■■■■■ 5.04
MPC1-201ENST00000341756 SMARCA4P51532 1647 aa45.9■■■■■ 4.94
MPC1-201ENST00000341756 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.88■■■■■ 4.94
MPC1-201ENST00000341756 SMARCA2P51531 1590 aa45.75■■■■■ 4.92
MPC1-201ENST00000341756 NCAPD3P42695 1498 aa45.74■■■■■ 4.91
MPC1-201ENST00000341756 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.69■■■■■ 4.91
MPC1-201ENST00000341756 HMGXB3Q12766 1538 aa45.56■■■■■ 4.88
MPC1-201ENST00000341756 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.5■■■■■ 4.87
MPC1-201ENST00000341756 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.44■■■■■ 4.86
MPC1-201ENST00000341756 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.37■■■■■ 4.85
MPC1-201ENST00000341756 WIZO95785 1651 aa44.95■■■■■ 4.79
MPC1-201ENST00000341756 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.84■■■■■ 4.77
MPC1-201ENST00000341756 ERCC6Q03468 1493 aa44.72■■■■■ 4.75
MPC1-201ENST00000341756 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.65■■■■■ 4.74
MPC1-201ENST00000341756 NESP48681 1621 aa44.59■■■■■ 4.73
MPC1-201ENST00000341756 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.56■■■■■ 4.72
MPC1-201ENST00000341756 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.4■■■■■ 4.7
MPC1-201ENST00000341756 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.38■■■■■ 4.69
MPC1-201ENST00000341756 CUX2O14529 1486 aa44.37■■■■■ 4.69
MPC1-201ENST00000341756 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.14■■■■■ 4.66
MPC1-201ENST00000341756 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.09■■■■■ 4.65
MPC1-201ENST00000341756 CFTRP13569 1480 aa44.08■■■■■ 4.65
MPC1-201ENST00000341756 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.95■■■■■ 4.63
MPC1-201ENST00000341756 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.91■■■■■ 4.62
MPC1-201ENST00000341756 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.89■■■■■ 4.62
MPC1-201ENST00000341756 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.88■■■■■ 4.61
MPC1-201ENST00000341756 PRDM2Q13029 1718 aa43.8■■■■■ 4.6
MPC1-201ENST00000341756 WDR62O43379 1518 aa43.73■■■■■ 4.59
MPC1-201ENST00000341756 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.49■■■■■ 4.55
MPC1-201ENST00000341756 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.39■■■■■ 4.54
MPC1-201ENST00000341756 ABCC8Q09428 1581 aa43.29■■■■■ 4.52
MPC1-201ENST00000341756 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.18■■■■■ 4.5
MPC1-201ENST00000341756 TOPBP1Q92547 1522 aa43.14■■■■■ 4.5
MPC1-201ENST00000341756 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.12■■■■■ 4.49
MPC1-201ENST00000341756 IFT140Q96RY7 1462 aa43.01■■■■■ 4.48
MPC1-201ENST00000341756 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.74■■■■■ 4.43
MPC1-201ENST00000341756 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.67■■■■■ 4.42
MPC1-201ENST00000341756 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.67■■■■■ 4.42
MPC1-201ENST00000341756 CUX1P39880 1505 aa42.66■■■■■ 4.42
MPC1-201ENST00000341756 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.61■■■■■ 4.41
MPC1-201ENST00000341756 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.61■■■■■ 4.41
MPC1-201ENST00000341756 SOGA1O94964 1423 aa42.59■■■■■ 4.41
MPC1-201ENST00000341756 WDR97A6NE52 1622 aa42.52■■■■■ 4.4
MPC1-201ENST00000341756 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.49■■■■■ 4.39
MPC1-201ENST00000341756 OSCARQ8IYS5 282 aa42.42■■■■■ 4.38
MPC1-201ENST00000341756 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.42■■■■■ 4.382e-10■■■■■ 41
MPC1-201ENST00000341756 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.37■■■■■ 4.376e-6■■■□□ 16.7
MPC1-201ENST00000341756 TOP2BQ02880 1626 aa42.31■■■■■ 4.36
MPC1-201ENST00000341756 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.31■■■■■ 4.36
MPC1-201ENST00000341756 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.31■■■■■ 4.36
MPC1-201ENST00000341756 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.23■■■■■ 4.35
MPC1-201ENST00000341756 SYNJ1O43426 1573 aa42.19■■■■■ 4.34
MPC1-201ENST00000341756 GRIN2BQ13224 1484 aa42.17■■■■■ 4.34
MPC1-201ENST00000341756 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.12■■■■■ 4.33
MPC1-201ENST00000341756 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.11■■■■■ 4.33
MPC1-201ENST00000341756 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.1■■■■■ 4.33
MPC1-201ENST00000341756 CHD1O14646 1710 aa42.09■■■■■ 4.33
MPC1-201ENST00000341756 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.06■■■■■ 4.32
MPC1-201ENST00000341756 PBRM1Q86U86 1689 aa42.05■■■■■ 4.32
MPC1-201ENST00000341756 FBLN2P98095 1184 aa42.04■■■■■ 4.32
MPC1-201ENST00000341756 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.93■■■■■ 4.3
MPC1-201ENST00000341756 SYNJ2O15056 1496 aa41.92■■■■■ 4.3
MPC1-201ENST00000341756 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.76■■■■■ 4.28
MPC1-201ENST00000341756 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.72■■■■■ 4.27
MPC1-201ENST00000341756 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.72■■■■■ 4.27
MPC1-201ENST00000341756 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.72■■■■■ 4.27
MPC1-201ENST00000341756 ARHGEF11O15085 1522 aa41.69■■■■■ 4.27
MPC1-201ENST00000341756 ADAMTS12P58397 1594 aa41.69■■■■■ 4.26
MPC1-201ENST00000341756 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.65■■■■■ 4.26
MPC1-201ENST00000341756 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.64■■■■■ 4.26
MPC1-201ENST00000341756 TRIM41Q8WV44 630 aa41.63■■■■■ 4.25
MPC1-201ENST00000341756 GRIN2AQ12879 1464 aa41.6■■■■■ 4.25
MPC1-201ENST00000341756 KIF27Q86VH2 1401 aa41.57■■■■■ 4.25
MPC1-201ENST00000341756 NUP160Q12769 1436 aa41.41■■■■■ 4.22
MPC1-201ENST00000341756 CUL7Q14999 1698 aa41.36■■■■■ 4.21
MPC1-201ENST00000341756 CEP170Q5SW79 1584 aa41.34■■■■■ 4.21
MPC1-201ENST00000341756 ARAP1Q96P48 1450 aa41.3■■■■■ 4.2
MPC1-201ENST00000341756 IGF1RP08069 1367 aa41.3■■■■■ 4.2
MPC1-201ENST00000341756 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.29■■■■■ 4.2
MPC1-201ENST00000341756 SHROOM2Q13796 1616 aa41.14■■■■■ 4.18
MPC1-201ENST00000341756 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.12■■■■■ 4.17
MPC1-201ENST00000341756 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.08■■■■■ 4.17
MPC1-201ENST00000341756 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.98■■■■■ 4.15
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