RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620536.4

ATXN3-252, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ATXN3, Length 1,044 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-252ENST00000620536 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.49■■■■■ 7.11
ATXN3-252ENST00000620536 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.2■■■■■ 6.11
ATXN3-252ENST00000620536 ABCC9O60706 1549 aa52.93■■■■■ 6.06
ATXN3-252ENST00000620536 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.54■■■■■ 5.68
ATXN3-252ENST00000620536 NACADO15069 1562 aa50.26■■■■■ 5.64
ATXN3-252ENST00000620536 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.21■■■■■ 5.63
ATXN3-252ENST00000620536 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.66■■■■■ 5.54
ATXN3-252ENST00000620536 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.37■■■■■ 5.49
ATXN3-252ENST00000620536 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.35■■■■■ 5.49
ATXN3-252ENST00000620536 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.32■■■■■ 5.49
ATXN3-252ENST00000620536 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.28■■■■■ 5.48
ATXN3-252ENST00000620536 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.15■■■■■ 5.46
ATXN3-252ENST00000620536 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.98■■■■■ 5.43
ATXN3-252ENST00000620536 SCRIBQ14160 1630 aa48.53■■■■■ 5.36
ATXN3-252ENST00000620536 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.42■■■■■ 5.34
ATXN3-252ENST00000620536 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.81■■■■■ 5.24
ATXN3-252ENST00000620536 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.79■■■■■ 5.24
ATXN3-252ENST00000620536 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.65■■■■■ 5.22
ATXN3-252ENST00000620536 NCAPD3P42695 1498 aa46.4■■■■■ 5.02
ATXN3-252ENST00000620536 SMARCA4P51532 1647 aa46.32■■■■■ 5
ATXN3-252ENST00000620536 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.3■■■■■ 5
ATXN3-252ENST00000620536 SMARCA2P51531 1590 aa46.21■■■■■ 4.99
ATXN3-252ENST00000620536 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.18■■■■■ 4.98
ATXN3-252ENST00000620536 HMGXB3Q12766 1538 aa46.07■■■■■ 4.97
ATXN3-252ENST00000620536 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.9■■■■■ 4.94
ATXN3-252ENST00000620536 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.85■■■■■ 4.93
ATXN3-252ENST00000620536 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.83■■■■■ 4.93
ATXN3-252ENST00000620536 ERCC6Q03468 1493 aa45.73■■■■■ 4.91
ATXN3-252ENST00000620536 NESP48681 1621 aa45.54■■■■■ 4.88
ATXN3-252ENST00000620536 CUX2O14529 1486 aa45.49■■■■■ 4.87
ATXN3-252ENST00000620536 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.3■■■■■ 4.84
ATXN3-252ENST00000620536 WIZO95785 1651 aa45.28■■■■■ 4.84
ATXN3-252ENST00000620536 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.1■■■■■ 4.81
ATXN3-252ENST00000620536 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.08■■■■■ 4.81
ATXN3-252ENST00000620536 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.03■■■■■ 4.8
ATXN3-252ENST00000620536 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.02■■■■■ 4.8
ATXN3-252ENST00000620536 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.98■■■■■ 4.79
ATXN3-252ENST00000620536 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.93■■■■■ 4.78
ATXN3-252ENST00000620536 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.76■■■■■ 4.76
ATXN3-252ENST00000620536 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.63■■■■■ 4.73
ATXN3-252ENST00000620536 CFTRP13569 1480 aa44.56■■■■■ 4.72
ATXN3-252ENST00000620536 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.53■■■■■ 4.72
ATXN3-252ENST00000620536 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.51■■■■■ 4.72
ATXN3-252ENST00000620536 WDR62O43379 1518 aa44.48■■■■■ 4.71
ATXN3-252ENST00000620536 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.27■■■■■ 4.68
ATXN3-252ENST00000620536 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.09■■■■■ 4.65
ATXN3-252ENST00000620536 PRDM2Q13029 1718 aa44.07■■■■■ 4.65
ATXN3-252ENST00000620536 TOPBP1Q92547 1522 aa43.68■■■■■ 4.58
ATXN3-252ENST00000620536 ABCC8Q09428 1581 aa43.67■■■■■ 4.58
ATXN3-252ENST00000620536 IFT140Q96RY7 1462 aa43.64■■■■■ 4.58
ATXN3-252ENST00000620536 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.55■■■■■ 4.56
ATXN3-252ENST00000620536 OSCARQ8IYS5 282 aa43.54■■■■■ 4.56
ATXN3-252ENST00000620536 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.49■■■■■ 4.55
ATXN3-252ENST00000620536 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.37■■■■■ 4.53
ATXN3-252ENST00000620536 TRIM41Q8WV44 630 aa43.31■■■■■ 4.52
ATXN3-252ENST00000620536 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.26■■■■■ 4.52
ATXN3-252ENST00000620536 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.25■■■■■ 4.51
ATXN3-252ENST00000620536 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.24■■■■■ 4.51
ATXN3-252ENST00000620536 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.18■■■■■ 4.5
ATXN3-252ENST00000620536 SOGA1O94964 1423 aa43.12■■■■■ 4.49
ATXN3-252ENST00000620536 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.1■■■■■ 4.49
ATXN3-252ENST00000620536 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.05■■■■■ 4.48
ATXN3-252ENST00000620536 CUX1P39880 1505 aa43.04■■■■■ 4.48
ATXN3-252ENST00000620536 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.98■■■■■ 4.47
ATXN3-252ENST00000620536 FBLN2P98095 1184 aa42.91■■■■■ 4.46
ATXN3-252ENST00000620536 WDR97A6NE52 1622 aa42.86■■■■■ 4.45
ATXN3-252ENST00000620536 CHD1O14646 1710 aa42.85■■■■■ 4.45
ATXN3-252ENST00000620536 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.83■■■■■ 4.45
ATXN3-252ENST00000620536 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.83■■■■■ 4.45
ATXN3-252ENST00000620536 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.83■■■■■ 4.45
ATXN3-252ENST00000620536 ARHGEF11O15085 1522 aa42.75■■■■■ 4.43
ATXN3-252ENST00000620536 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.74■■■■■ 4.43
ATXN3-252ENST00000620536 GRIN2BQ13224 1484 aa42.68■■■■■ 4.42
ATXN3-252ENST00000620536 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.64■■■■■ 4.42
ATXN3-252ENST00000620536 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.64■■■■■ 4.42
ATXN3-252ENST00000620536 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.59■■■■■ 4.41
ATXN3-252ENST00000620536 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.57■■■■■ 4.41
ATXN3-252ENST00000620536 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.52■■■■■ 4.4
ATXN3-252ENST00000620536 SYNJ2O15056 1496 aa42.5■■■■■ 4.39
ATXN3-252ENST00000620536 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.49■■■■■ 4.39
ATXN3-252ENST00000620536 PBRM1Q86U86 1689 aa42.48■■■■■ 4.39
ATXN3-252ENST00000620536 TOP2BQ02880 1626 aa42.45■■■■■ 4.39
ATXN3-252ENST00000620536 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.45■■■■■ 4.39
ATXN3-252ENST00000620536 SYNJ1O43426 1573 aa42.44■■■■■ 4.39
ATXN3-252ENST00000620536 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.43■■■■■ 4.38
ATXN3-252ENST00000620536 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.38■■■■■ 4.37
ATXN3-252ENST00000620536 ARAP1Q96P48 1450 aa42.34■■■■■ 4.37
ATXN3-252ENST00000620536 GRIN2AQ12879 1464 aa42.12■■■■■ 4.33
ATXN3-252ENST00000620536 ADAMTS12P58397 1594 aa42.11■■■■■ 4.33
ATXN3-252ENST00000620536 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.06■■■■■ 4.32
ATXN3-252ENST00000620536 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.05■■■■■ 4.32
ATXN3-252ENST00000620536 NUP160Q12769 1436 aa41.95■■■■■ 4.31
ATXN3-252ENST00000620536 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.95■■■■■ 4.31
ATXN3-252ENST00000620536 CEP170Q5SW79 1584 aa41.92■■■■■ 4.3
ATXN3-252ENST00000620536 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.74■■■■■ 4.27
ATXN3-252ENST00000620536 KIF27Q86VH2 1401 aa41.69■■■■■ 4.27
ATXN3-252ENST00000620536 SHROOM2Q13796 1616 aa41.69■■■■■ 4.27
ATXN3-252ENST00000620536 IGF1RP08069 1367 aa41.62■■■■■ 4.25
ATXN3-252ENST00000620536 JPH4Q96JJ6 628 aa41.59■■■■■ 4.25
ATXN3-252ENST00000620536 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.57■■■■■ 4.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.1 ms