RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598904.5

RINL-208, Transcript of Ras and Rab interactor like, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene RINL, Length 1,846 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RINL-208ENST00000598904 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.15■■■■■ 6.58
RINL-208ENST00000598904 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.14■■■■■ 5.46
RINL-208ENST00000598904 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.07■■■■■ 5.13
RINL-208ENST00000598904 ABCC9O60706 1549 aa46.8■■■■■ 5.08
RINL-208ENST00000598904 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.55■■■■■ 5.04
RINL-208ENST00000598904 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.49■■■■■ 5.03
RINL-208ENST00000598904 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.13■■■■■ 4.98
RINL-208ENST00000598904 NACADO15069 1562 aa45.93■■■■■ 4.94
RINL-208ENST00000598904 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.61■■■■■ 4.89
RINL-208ENST00000598904 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.43■■■■■ 4.86
RINL-208ENST00000598904 SCRIBQ14160 1630 aa45.05■■■■■ 4.8
RINL-208ENST00000598904 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.47■■■■■ 4.71
RINL-208ENST00000598904 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.14■■■■■ 4.66
RINL-208ENST00000598904 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.08■■■■■ 4.65
RINL-208ENST00000598904 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.6■■■■■ 4.57
RINL-208ENST00000598904 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.59■■■■■ 4.57
RINL-208ENST00000598904 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.41■■■■■ 4.54
RINL-208ENST00000598904 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.39■■■■■ 4.54
RINL-208ENST00000598904 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.3■■■■■ 4.52
RINL-208ENST00000598904 SMARCA4P51532 1647 aa43.21■■■■■ 4.51
RINL-208ENST00000598904 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.89■■■■■ 4.46
RINL-208ENST00000598904 WIZO95785 1651 aa42.88■■■■■ 4.46
RINL-208ENST00000598904 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.74■■■■■ 4.43
RINL-208ENST00000598904 SMARCA2P51531 1590 aa42.65■■■■■ 4.42
RINL-208ENST00000598904 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.65■■■■■ 4.42
RINL-208ENST00000598904 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.52■■■■■ 4.4
RINL-208ENST00000598904 NCAPD3P42695 1498 aa42.41■■■■■ 4.38
RINL-208ENST00000598904 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.4■■■■■ 4.38
RINL-208ENST00000598904 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.34■■■■■ 4.37
RINL-208ENST00000598904 HMGXB3Q12766 1538 aa42.27■■■■■ 4.36
RINL-208ENST00000598904 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.08■■■■■ 4.33
RINL-208ENST00000598904 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.64■■■■■ 4.26
RINL-208ENST00000598904 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.52■■■■■ 4.24
RINL-208ENST00000598904 CFTRP13569 1480 aa41.32■■■■■ 4.21
RINL-208ENST00000598904 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.3■■■■■ 4.2
RINL-208ENST00000598904 TRIM41Q8WV44 630 aa41.1■■■■■ 4.17
RINL-208ENST00000598904 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41■■■■■ 4.15
RINL-208ENST00000598904 ABCC8Q09428 1581 aa40.97■■■■■ 4.15
RINL-208ENST00000598904 PRDM2Q13029 1718 aa40.95■■■■■ 4.15
RINL-208ENST00000598904 NESP48681 1621 aa40.92■■■■■ 4.14
RINL-208ENST00000598904 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.89■■■■■ 4.14
RINL-208ENST00000598904 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.79■■■■■ 4.12
RINL-208ENST00000598904 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.77■■■■■ 4.12
RINL-208ENST00000598904 SYNJ1O43426 1573 aa40.62■■■■■ 4.09
RINL-208ENST00000598904 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.59■■■■■ 4.09
RINL-208ENST00000598904 TOP2BQ02880 1626 aa40.56■■■■■ 4.08
RINL-208ENST00000598904 CUX1P39880 1505 aa40.52■■■■■ 4.08
RINL-208ENST00000598904 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.49■■■■■ 4.07
RINL-208ENST00000598904 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.38■■■■■ 4.06
RINL-208ENST00000598904 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.33■■■■■ 4.05
RINL-208ENST00000598904 TOPBP1Q92547 1522 aa40.28■■■■■ 4.04
RINL-208ENST00000598904 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
RINL-208ENST00000598904 ERCC6Q03468 1493 aa40.25■■■■■ 4.03
RINL-208ENST00000598904 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.23■■■■■ 4.03
RINL-208ENST00000598904 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.2■■■■■ 4.03
RINL-208ENST00000598904 SOGA1O94964 1423 aa40.18■■■■■ 4.02
RINL-208ENST00000598904 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.18■■■■■ 4.02
RINL-208ENST00000598904 EEA1Q15075 1411 aa40.17■■■■■ 4.02
RINL-208ENST00000598904 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.06■■■■■ 4
RINL-208ENST00000598904 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.01■■■■□ 3.99
RINL-208ENST00000598904 WDR62O43379 1518 aa39.97■■■■□ 3.99
RINL-208ENST00000598904 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.97■■■■□ 3.99
RINL-208ENST00000598904 KIF27Q86VH2 1401 aa39.94■■■■□ 3.98
RINL-208ENST00000598904 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.89■■■■□ 3.98
RINL-208ENST00000598904 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.87■■■■□ 3.97
RINL-208ENST00000598904 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.87■■■■□ 3.97
RINL-208ENST00000598904 CUX2O14529 1486 aa39.86■■■■□ 3.97
RINL-208ENST00000598904 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.85■■■■□ 3.97
RINL-208ENST00000598904 IFT140Q96RY7 1462 aa39.68■■■■□ 3.94
RINL-208ENST00000598904 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.67■■■■□ 3.94
RINL-208ENST00000598904 WDR97A6NE52 1622 aa39.63■■■■□ 3.93
RINL-208ENST00000598904 IGF1RP08069 1367 aa39.6■■■■□ 3.93
RINL-208ENST00000598904 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.6■■■■□ 3.93
RINL-208ENST00000598904 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.58■■■■□ 3.93
RINL-208ENST00000598904 KIF21BO75037 1637 aa39.54■■■■□ 3.92
RINL-208ENST00000598904 GOLGA3Q08378 1498 aa39.53■■■■□ 3.92
RINL-208ENST00000598904 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.51■■■■□ 3.92
RINL-208ENST00000598904 PRXQ9BXM0 1461 aa39.51■■■■□ 3.92
RINL-208ENST00000598904 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.49■■■■□ 3.91
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RINL-208ENST00000598904 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.41■■■■□ 3.9
RINL-208ENST00000598904 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.4■■■■□ 3.9
RINL-208ENST00000598904 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.39■■■■□ 3.9
RINL-208ENST00000598904 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.39■■■■□ 3.9
RINL-208ENST00000598904 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.36■■■■□ 3.89
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RINL-208ENST00000598904 GRIN2BQ13224 1484 aa39.29■■■■□ 3.88
RINL-208ENST00000598904 CUL7Q14999 1698 aa39.29■■■■□ 3.88
RINL-208ENST00000598904 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.21■■■■□ 3.87
RINL-208ENST00000598904 PBRM1Q86U86 1689 aa39.19■■■■□ 3.86
RINL-208ENST00000598904 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.11■■■■□ 3.85
RINL-208ENST00000598904 CEP162Q5TB80 1403 aa39.04■■■■□ 3.84
RINL-208ENST00000598904 ADAMTS12P58397 1594 aa39.01■■■■□ 3.83
RINL-208ENST00000598904 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.01■■■■□ 3.83
RINL-208ENST00000598904 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.01■■■■□ 3.83
RINL-208ENST00000598904 CLIP1P30622 1438 aa38.87■■■■□ 3.81
RINL-208ENST00000598904 SYNJ2O15056 1496 aa38.85■■■■□ 3.81
RINL-208ENST00000598904 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.84■■■■□ 3.81
RINL-208ENST00000598904 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP38.79■■■■□ 3.8
RINL-208ENST00000598904 GRIN2AQ12879 1464 aa38.77■■■■□ 3.8
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