RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317096.8

PARL-202, Transcript of presenilin associated rhomboid like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PARL, Length 1,414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARL-202ENST00000317096 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.18■■■■■ 6.9
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PARL-202ENST00000317096 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.59■■■■■ 5.37
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PARL-202ENST00000317096 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.25■■■■■ 5.32
PARL-202ENST00000317096 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.24■■■■■ 5.31
PARL-202ENST00000317096 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.2■■■■■ 5.31
PARL-202ENST00000317096 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.11■■■■■ 5.29
PARL-202ENST00000317096 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.47■■■■■ 5.19
PARL-202ENST00000317096 SCRIBQ14160 1630 aa47.04■■■■■ 5.12
PARL-202ENST00000317096 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.99■■■■■ 5.11
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PARL-202ENST00000317096 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.34■■■■■ 5.01
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PARL-202ENST00000317096 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.31■■■■■ 4.84
PARL-202ENST00000317096 SMARCA4P51532 1647 aa45.1■■■■■ 4.81
PARL-202ENST00000317096 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.02■■■■■ 4.8
PARL-202ENST00000317096 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.89■■■■■ 4.78
PARL-202ENST00000317096 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.7■■■■■ 4.75
PARL-202ENST00000317096 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.69■■■■■ 4.74
PARL-202ENST00000317096 SMARCA2P51531 1590 aa44.61■■■■■ 4.73
PARL-202ENST00000317096 NCAPD3P42695 1498 aa44.6■■■■■ 4.73
PARL-202ENST00000317096 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.47■■■■■ 4.71
PARL-202ENST00000317096 WIZO95785 1651 aa44.45■■■■■ 4.71
PARL-202ENST00000317096 HMGXB3Q12766 1538 aa44.45■■■■■ 4.71
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PARL-202ENST00000317096 NESP48681 1621 aa43.44■■■■■ 4.54
PARL-202ENST00000317096 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.43■■■■■ 4.54
PARL-202ENST00000317096 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.4■■■■■ 4.54
PARL-202ENST00000317096 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.36■■■■■ 4.53
PARL-202ENST00000317096 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.26■■■■■ 4.52
PARL-202ENST00000317096 CFTRP13569 1480 aa43.16■■■■■ 4.5
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PARL-202ENST00000317096 PRDM2Q13029 1718 aa43.03■■■■■ 4.48
PARL-202ENST00000317096 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.02■■■■■ 4.48
PARL-202ENST00000317096 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.92■■■■■ 4.46
PARL-202ENST00000317096 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.77■■■■■ 4.44
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PARL-202ENST00000317096 CUX2O14529 1486 aa42.72■■■■■ 4.43
PARL-202ENST00000317096 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.65■■■■■ 4.42
PARL-202ENST00000317096 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.53■■■■■ 4.4
PARL-202ENST00000317096 WDR62O43379 1518 aa42.47■■■■■ 4.39
PARL-202ENST00000317096 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.41■■■■■ 4.38
PARL-202ENST00000317096 TOPBP1Q92547 1522 aa42.19■■■■■ 4.34
PARL-202ENST00000317096 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.18■■■■■ 4.34
PARL-202ENST00000317096 ABCC8Q09428 1581 aa42.1■■■■■ 4.33
PARL-202ENST00000317096 CUX1P39880 1505 aa42.08■■■■■ 4.33
PARL-202ENST00000317096 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.86■■■■■ 4.29
PARL-202ENST00000317096 SYNJ1O43426 1573 aa41.86■■■■■ 4.29
PARL-202ENST00000317096 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.86■■■■■ 4.29
PARL-202ENST00000317096 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.83■■■■■ 4.29
PARL-202ENST00000317096 TOP2BQ02880 1626 aa41.82■■■■■ 4.29
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PARL-202ENST00000317096 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.7■■■■■ 4.27
PARL-202ENST00000317096 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.66■■■■■ 4.26
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PARL-202ENST00000317096 SOGA1O94964 1423 aa41.6■■■■■ 4.25
PARL-202ENST00000317096 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.49■■■■■ 4.23
PARL-202ENST00000317096 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.44■■■■■ 4.22
PARL-202ENST00000317096 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.38■■■■■ 4.21
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PARL-202ENST00000317096 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.32■■■■■ 4.21
PARL-202ENST00000317096 PBRM1Q86U86 1689 aa41.19■■■■■ 4.18
PARL-202ENST00000317096 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.16■■■■■ 4.18
PARL-202ENST00000317096 GRIN2BQ13224 1484 aa41.08■■■■■ 4.17
PARL-202ENST00000317096 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.99■■■■■ 4.15
PARL-202ENST00000317096 TRIM41Q8WV44 630 aa40.98■■■■■ 4.15
PARL-202ENST00000317096 CHD1O14646 1710 aa40.96■■■■■ 4.15
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PARL-202ENST00000317096 OSCARQ8IYS5 282 aa40.94■■■■■ 4.14
PARL-202ENST00000317096 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.93■■■■■ 4.14
PARL-202ENST00000317096 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.91■■■■■ 4.14
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PARL-202ENST00000317096 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.48■■■■■ 4.07
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PARL-202ENST00000317096 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.21■■■■■ 4.03
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