RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000305202.8

NECAB2-201, Transcript of N-terminal EF-hand calcium binding protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NECAB2, Length 1,608 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAB2-201ENST00000305202 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.45■■■■■ 6.79
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NECAB2-201ENST00000305202 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.92■■■■■ 5.26
NECAB2-201ENST00000305202 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.86■■■■■ 5.25
NECAB2-201ENST00000305202 NACADO15069 1562 aa47.83■■■■■ 5.25
NECAB2-201ENST00000305202 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.82■■■■■ 5.25
NECAB2-201ENST00000305202 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.64■■■■■ 5.22
NECAB2-201ENST00000305202 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.53■■■■■ 5.2
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NECAB2-201ENST00000305202 SCRIBQ14160 1630 aa46.53■■■■■ 5.04
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NECAB2-201ENST00000305202 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.14■■■■■ 4.82
NECAB2-201ENST00000305202 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.89■■■■■ 4.78
NECAB2-201ENST00000305202 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.73■■■■■ 4.75
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NECAB2-201ENST00000305202 SMARCA2P51531 1590 aa44.16■■■■■ 4.66
NECAB2-201ENST00000305202 NCAPD3P42695 1498 aa44.13■■■■■ 4.65
NECAB2-201ENST00000305202 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.09■■■■■ 4.65
NECAB2-201ENST00000305202 HMGXB3Q12766 1538 aa43.95■■■■■ 4.63
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NECAB2-201ENST00000305202 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.94■■■■■ 4.46
NECAB2-201ENST00000305202 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.86■■■■■ 4.45
NECAB2-201ENST00000305202 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.86■■■■■ 4.45
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NECAB2-201ENST00000305202 CFTRP13569 1480 aa42.67■■■■■ 4.42
NECAB2-201ENST00000305202 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.62■■■■■ 4.41
NECAB2-201ENST00000305202 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.53■■■■■ 4.4
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NECAB2-201ENST00000305202 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.38■■■■■ 4.37
NECAB2-201ENST00000305202 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.31■■■■■ 4.36
NECAB2-201ENST00000305202 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.3■■■■■ 4.36
NECAB2-201ENST00000305202 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.18■■■■■ 4.34
NECAB2-201ENST00000305202 CUX2O14529 1486 aa42.17■■■■■ 4.34
NECAB2-201ENST00000305202 WDR62O43379 1518 aa42.04■■■■■ 4.32
NECAB2-201ENST00000305202 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.94■■■■■ 4.31
NECAB2-201ENST00000305202 TOPBP1Q92547 1522 aa41.73■■■■■ 4.27
NECAB2-201ENST00000305202 ABCC8Q09428 1581 aa41.72■■■■■ 4.27
NECAB2-201ENST00000305202 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.71■■■■■ 4.27
NECAB2-201ENST00000305202 CUX1P39880 1505 aa41.53■■■■■ 4.24
NECAB2-201ENST00000305202 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.41■■■■■ 4.22
NECAB2-201ENST00000305202 IFT140Q96RY7 1462 aa41.39■■■■■ 4.22
NECAB2-201ENST00000305202 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.36■■■■■ 4.21
NECAB2-201ENST00000305202 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.34■■■■■ 4.21
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NECAB2-201ENST00000305202 TOP2BQ02880 1626 aa41.25■■■■■ 4.19
NECAB2-201ENST00000305202 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.25■■■■■ 4.19
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NECAB2-201ENST00000305202 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.22■■■■■ 4.19
NECAB2-201ENST00000305202 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.2■■■■■ 4.19
NECAB2-201ENST00000305202 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.07■■■■■ 4.17
NECAB2-201ENST00000305202 TRIM41Q8WV44 630 aa41.02■■■■■ 4.16
NECAB2-201ENST00000305202 WDR97A6NE52 1622 aa41.01■■■■■ 4.16
NECAB2-201ENST00000305202 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41■■■■■ 4.15
NECAB2-201ENST00000305202 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.96■■■■■ 4.15
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NECAB2-201ENST00000305202 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.78■■■■■ 4.12
NECAB2-201ENST00000305202 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.76■■■■■ 4.12
NECAB2-201ENST00000305202 GRIN2BQ13224 1484 aa40.71■■■■■ 4.11
NECAB2-201ENST00000305202 PBRM1Q86U86 1689 aa40.68■■■■■ 4.1
NECAB2-201ENST00000305202 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.63■■■■■ 4.1
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NECAB2-201ENST00000305202 CHD1O14646 1710 aa40.5■■■■■ 4.07
NECAB2-201ENST00000305202 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.47■■■■■ 4.07
NECAB2-201ENST00000305202 KIF27Q86VH2 1401 aa40.46■■■■■ 4.07
NECAB2-201ENST00000305202 OSCARQ8IYS5 282 aa40.45■■■■■ 4.07
NECAB2-201ENST00000305202 FBLN2P98095 1184 aa40.44■■■■■ 4.06
NECAB2-201ENST00000305202 SYNJ2O15056 1496 aa40.42■■■■■ 4.06
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NECAB2-201ENST00000305202 IGF1RP08069 1367 aa40.26■■■■■ 4.04
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NECAB2-201ENST00000305202 CUL7Q14999 1698 aa40.16■■■■■ 4.02
NECAB2-201ENST00000305202 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.01
NECAB2-201ENST00000305202 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.08■■■■■ 4.01
NECAB2-201ENST00000305202 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.05■■■■■ 4
NECAB2-201ENST00000305202 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.03■■■■■ 4
NECAB2-201ENST00000305202 NUP160Q12769 1436 aa40.01■■■■■ 4
NECAB2-201ENST00000305202 CEP170Q5SW79 1584 aa40■■■■□ 3.99
NECAB2-201ENST00000305202 PRXQ9BXM0 1461 aa39.89■■■■□ 3.98
NECAB2-201ENST00000305202 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.83■■■■□ 3.97
NECAB2-201ENST00000305202 ARHGEF11O15085 1522 aa39.83■■■■□ 3.97
NECAB2-201ENST00000305202 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.82■■■■□ 3.96
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