RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598832.1

LINC01233-202, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1233, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC01233, Length 568 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01233-202ENST00000598832 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.49■■■■■ 6.95
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LINC01233-202ENST00000598832 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.14■■■■■ 5.46
LINC01233-202ENST00000598832 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.06■■■■■ 5.44
LINC01233-202ENST00000598832 NACADO15069 1562 aa49.01■■■■■ 5.44
LINC01233-202ENST00000598832 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.71■■■■■ 5.39
LINC01233-202ENST00000598832 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.6■■■■■ 5.37
LINC01233-202ENST00000598832 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.35■■■■■ 5.33
LINC01233-202ENST00000598832 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.01■■■■■ 5.28
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LINC01233-202ENST00000598832 SCRIBQ14160 1630 aa47.6■■■■■ 5.21
LINC01233-202ENST00000598832 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.58■■■■■ 5.21
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LINC01233-202ENST00000598832 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.94■■■■■ 5.1
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LINC01233-202ENST00000598832 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.25■■■■■ 4.99
LINC01233-202ENST00000598832 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.96■■■■■ 4.95
LINC01233-202ENST00000598832 SMARCA4P51532 1647 aa45.46■■■■■ 4.87
LINC01233-202ENST00000598832 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.39■■■■■ 4.86
LINC01233-202ENST00000598832 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.21■■■■■ 4.83
LINC01233-202ENST00000598832 SMARCA2P51531 1590 aa45.2■■■■■ 4.83
LINC01233-202ENST00000598832 NCAPD3P42695 1498 aa45.17■■■■■ 4.82
LINC01233-202ENST00000598832 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.08■■■■■ 4.81
LINC01233-202ENST00000598832 HMGXB3Q12766 1538 aa45■■■■■ 4.79
LINC01233-202ENST00000598832 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.95■■■■■ 4.79
LINC01233-202ENST00000598832 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.9■■■■■ 4.78
LINC01233-202ENST00000598832 WIZO95785 1651 aa44.64■■■■■ 4.74
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LINC01233-202ENST00000598832 NESP48681 1621 aa44.19■■■■■ 4.66
LINC01233-202ENST00000598832 ERCC6Q03468 1493 aa44.16■■■■■ 4.66
LINC01233-202ENST00000598832 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.14■■■■■ 4.66
LINC01233-202ENST00000598832 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.08■■■■■ 4.65
LINC01233-202ENST00000598832 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.88■■■■■ 4.61
LINC01233-202ENST00000598832 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.79■■■■■ 4.6
LINC01233-202ENST00000598832 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.72■■■■■ 4.59
LINC01233-202ENST00000598832 CUX2O14529 1486 aa43.66■■■■■ 4.58
LINC01233-202ENST00000598832 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.59■■■■■ 4.57
LINC01233-202ENST00000598832 CFTRP13569 1480 aa43.57■■■■■ 4.57
LINC01233-202ENST00000598832 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.57■■■■■ 4.57
LINC01233-202ENST00000598832 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.42■■■■■ 4.54
LINC01233-202ENST00000598832 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.41■■■■■ 4.54
LINC01233-202ENST00000598832 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.38■■■■■ 4.53
LINC01233-202ENST00000598832 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.36■■■■■ 4.53
LINC01233-202ENST00000598832 PRDM2Q13029 1718 aa43.34■■■■■ 4.53
LINC01233-202ENST00000598832 WDR62O43379 1518 aa43.19■■■■■ 4.5
LINC01233-202ENST00000598832 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.97■■■■■ 4.47
LINC01233-202ENST00000598832 TOPBP1Q92547 1522 aa42.7■■■■■ 4.43
LINC01233-202ENST00000598832 ABCC8Q09428 1581 aa42.69■■■■■ 4.42
LINC01233-202ENST00000598832 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.66■■■■■ 4.42
LINC01233-202ENST00000598832 IFT140Q96RY7 1462 aa42.48■■■■■ 4.39
LINC01233-202ENST00000598832 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.42■■■■■ 4.38
LINC01233-202ENST00000598832 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.32■■■■■ 4.37
LINC01233-202ENST00000598832 CUX1P39880 1505 aa42.31■■■■■ 4.36
LINC01233-202ENST00000598832 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.27■■■■■ 4.36
LINC01233-202ENST00000598832 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.23■■■■■ 4.35
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LINC01233-202ENST00000598832 SOGA1O94964 1423 aa42.15■■■■■ 4.34
LINC01233-202ENST00000598832 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.15■■■■■ 4.34
LINC01233-202ENST00000598832 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.03■■■■■ 4.32
LINC01233-202ENST00000598832 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.03■■■■■ 4.32
LINC01233-202ENST00000598832 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.94■■■■■ 4.3
LINC01233-202ENST00000598832 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.94■■■■■ 4.3
LINC01233-202ENST00000598832 TOP2BQ02880 1626 aa41.93■■■■■ 4.3
LINC01233-202ENST00000598832 SYNJ1O43426 1573 aa41.92■■■■■ 4.3
LINC01233-202ENST00000598832 WDR97A6NE52 1622 aa41.91■■■■■ 4.3
LINC01233-202ENST00000598832 OSCARQ8IYS5 282 aa41.82■■■■■ 4.29
LINC01233-202ENST00000598832 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.77■■■■■ 4.28
LINC01233-202ENST00000598832 GRIN2BQ13224 1484 aa41.69■■■■■ 4.26
LINC01233-202ENST00000598832 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.67■■■■■ 4.26
LINC01233-202ENST00000598832 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.67■■■■■ 4.26
LINC01233-202ENST00000598832 CHD1O14646 1710 aa41.67■■■■■ 4.26
LINC01233-202ENST00000598832 PBRM1Q86U86 1689 aa41.65■■■■■ 4.26
LINC01233-202ENST00000598832 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.65■■■■■ 4.26
LINC01233-202ENST00000598832 FBLN2P98095 1184 aa41.64■■■■■ 4.26
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LINC01233-202ENST00000598832 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.2■■■■■ 4.19
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LINC01233-202ENST00000598832 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.2■■■■■ 4.19
LINC01233-202ENST00000598832 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.18■■■■■ 4.18
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LINC01233-202ENST00000598832 KIF27Q86VH2 1401 aa41.16■■■■■ 4.18
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LINC01233-202ENST00000598832 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.14■■■■■ 4.18
LINC01233-202ENST00000598832 TRIM41Q8WV44 630 aa41.12■■■■■ 4.17
LINC01233-202ENST00000598832 CEP170Q5SW79 1584 aa40.96■■■■■ 4.15
LINC01233-202ENST00000598832 CUL7Q14999 1698 aa40.94■■■■■ 4.14
LINC01233-202ENST00000598832 NUP160Q12769 1436 aa40.93■■■■■ 4.14
LINC01233-202ENST00000598832 IGF1RP08069 1367 aa40.93■■■■■ 4.14
LINC01233-202ENST00000598832 ARAP1Q96P48 1450 aa40.81■■■■■ 4.12
LINC01233-202ENST00000598832 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.8■■■■■ 4.12
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LINC01233-202ENST00000598832 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.7■■■■■ 4.11
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LINC01233-202ENST00000598832 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.58■■■■■ 4.09
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