RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.61■■■■■ 6.97
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SMKR1-201ENST00000462322 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.32■■■■■ 5.49
SMKR1-201ENST00000462322 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.23■■■■■ 5.47
SMKR1-201ENST00000462322 NACADO15069 1562 aa49.18■■■■■ 5.46
SMKR1-201ENST00000462322 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.76■■■■■ 5.4
SMKR1-201ENST00000462322 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.74■■■■■ 5.39
SMKR1-201ENST00000462322 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.44■■■■■ 5.35
SMKR1-201ENST00000462322 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.15■■■■■ 5.3
SMKR1-201ENST00000462322 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.07■■■■■ 5.29
SMKR1-201ENST00000462322 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.82■■■■■ 5.25
SMKR1-201ENST00000462322 SCRIBQ14160 1630 aa47.67■■■■■ 5.22
SMKR1-201ENST00000462322 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.51■■■■■ 5.2
SMKR1-201ENST00000462322 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.27■■■■■ 5.16
SMKR1-201ENST00000462322 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.6■■■■■ 5.05
SMKR1-201ENST00000462322 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.49■■■■■ 5.03
SMKR1-201ENST00000462322 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.25■■■■■ 5
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SMKR1-201ENST00000462322 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.45■■■■■ 4.87
SMKR1-201ENST00000462322 NCAPD3P42695 1498 aa45.4■■■■■ 4.86
SMKR1-201ENST00000462322 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.38■■■■■ 4.86
SMKR1-201ENST00000462322 SMARCA2P51531 1590 aa45.31■■■■■ 4.84
SMKR1-201ENST00000462322 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.17■■■■■ 4.82
SMKR1-201ENST00000462322 HMGXB3Q12766 1538 aa45.12■■■■■ 4.81
SMKR1-201ENST00000462322 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.07■■■■■ 4.8
SMKR1-201ENST00000462322 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.01■■■■■ 4.8
SMKR1-201ENST00000462322 WIZO95785 1651 aa44.67■■■■■ 4.74
SMKR1-201ENST00000462322 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.56■■■■■ 4.72
SMKR1-201ENST00000462322 NESP48681 1621 aa44.42■■■■■ 4.7
SMKR1-201ENST00000462322 ERCC6Q03468 1493 aa44.39■■■■■ 4.7
SMKR1-201ENST00000462322 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.23■■■■■ 4.67
SMKR1-201ENST00000462322 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.17■■■■■ 4.66
SMKR1-201ENST00000462322 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.08■■■■■ 4.65
SMKR1-201ENST00000462322 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.99■■■■■ 4.63
SMKR1-201ENST00000462322 CUX2O14529 1486 aa43.97■■■■■ 4.63
SMKR1-201ENST00000462322 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.85■■■■■ 4.61
SMKR1-201ENST00000462322 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.76■■■■■ 4.6
SMKR1-201ENST00000462322 CFTRP13569 1480 aa43.73■■■■■ 4.59
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.68■■■■■ 4.58
SMKR1-201ENST00000462322 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.57■■■■■ 4.57
SMKR1-201ENST00000462322 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.55■■■■■ 4.56
SMKR1-201ENST00000462322 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.54■■■■■ 4.56
SMKR1-201ENST00000462322 WDR62O43379 1518 aa43.38■■■■■ 4.53
SMKR1-201ENST00000462322 PRDM2Q13029 1718 aa43.33■■■■■ 4.53
SMKR1-201ENST00000462322 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.3■■■■■ 4.52
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SMKR1-201ENST00000462322 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.03■■■■■ 4.48
SMKR1-201ENST00000462322 TOPBP1Q92547 1522 aa42.83■■■■■ 4.45
SMKR1-201ENST00000462322 ABCC8Q09428 1581 aa42.82■■■■■ 4.44
SMKR1-201ENST00000462322 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.74■■■■■ 4.43
SMKR1-201ENST00000462322 IFT140Q96RY7 1462 aa42.65■■■■■ 4.42
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.48■■■■■ 4.39
SMKR1-201ENST00000462322 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.45■■■■■ 4.39
SMKR1-201ENST00000462322 CUX1P39880 1505 aa42.39■■■■■ 4.38
SMKR1-201ENST00000462322 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.36■■■■■ 4.37
SMKR1-201ENST00000462322 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.31■■■■■ 4.36
SMKR1-201ENST00000462322 SOGA1O94964 1423 aa42.3■■■■■ 4.36
SMKR1-201ENST00000462322 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.3■■■■■ 4.36
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SMKR1-201ENST00000462322 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.12■■■■■ 4.33
SMKR1-201ENST00000462322 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.03■■■■■ 4.32
SMKR1-201ENST00000462322 WDR97A6NE52 1622 aa41.99■■■■■ 4.31
SMKR1-201ENST00000462322 TOP2BQ02880 1626 aa41.94■■■■■ 4.3
SMKR1-201ENST00000462322 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.92■■■■■ 4.3
SMKR1-201ENST00000462322 SYNJ1O43426 1573 aa41.92■■■■■ 4.3
SMKR1-201ENST00000462322 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.87■■■■■ 4.29
SMKR1-201ENST00000462322 FBLN2P98095 1184 aa41.85■■■■■ 4.29
SMKR1-201ENST00000462322 GRIN2BQ13224 1484 aa41.83■■■■■ 4.29
SMKR1-201ENST00000462322 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.81■■■■■ 4.28
SMKR1-201ENST00000462322 CHD1O14646 1710 aa41.8■■■■■ 4.28
SMKR1-201ENST00000462322 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.79■■■■■ 4.28
SMKR1-201ENST00000462322 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.73■■■■■ 4.27
SMKR1-201ENST00000462322 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.71■■■■■ 4.27
SMKR1-201ENST00000462322 PBRM1Q86U86 1689 aa41.68■■■■■ 4.26
SMKR1-201ENST00000462322 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.66■■■■■ 4.26
SMKR1-201ENST00000462322 SYNJ2O15056 1496 aa41.59■■■■■ 4.25
SMKR1-201ENST00000462322 TRIM41Q8WV44 630 aa41.54■■■■■ 4.24
SMKR1-201ENST00000462322 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.46■■■■■ 4.23
SMKR1-201ENST00000462322 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.46■■■■■ 4.23
SMKR1-201ENST00000462322 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.46■■■■■ 4.23
SMKR1-201ENST00000462322 ARHGEF11O15085 1522 aa41.43■■■■■ 4.22
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SMKR1-201ENST00000462322 ADAMTS12P58397 1594 aa41.34■■■■■ 4.21
SMKR1-201ENST00000462322 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.34■■■■■ 4.21
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SMKR1-201ENST00000462322 KIF27Q86VH2 1401 aa41.19■■■■■ 4.18
SMKR1-201ENST00000462322 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.14■■■■■ 4.18
SMKR1-201ENST00000462322 NUP160Q12769 1436 aa41.1■■■■■ 4.17
SMKR1-201ENST00000462322 ARAP1Q96P48 1450 aa41.08■■■■■ 4.17
SMKR1-201ENST00000462322 CEP170Q5SW79 1584 aa41.08■■■■■ 4.17
SMKR1-201ENST00000462322 IGF1RP08069 1367 aa41.06■■■■■ 4.16
SMKR1-201ENST00000462322 CUL7Q14999 1698 aa40.91■■■■■ 4.14
SMKR1-201ENST00000462322 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.82■■■■■ 4.12
SMKR1-201ENST00000462322 SHROOM2Q13796 1616 aa40.79■■■■■ 4.12
SMKR1-201ENST00000462322 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.77■■■■■ 4.12
SMKR1-201ENST00000462322 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.73■■■■■ 4.11
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