RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515209.5

LMAN2-208, Transcript of lectin, mannose binding 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene LMAN2, Length 1,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2-208ENST00000515209 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.62■■■■■ 6.98
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LMAN2-208ENST00000515209 ABCC9O60706 1549 aa50.92■■■■■ 5.74
LMAN2-208ENST00000515209 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.09■■■■■ 5.45
LMAN2-208ENST00000515209 NACADO15069 1562 aa49.03■■■■■ 5.44
LMAN2-208ENST00000515209 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.87■■■■■ 5.41
LMAN2-208ENST00000515209 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.8■■■■■ 5.4
LMAN2-208ENST00000515209 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.65■■■■■ 5.38
LMAN2-208ENST00000515209 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.58■■■■■ 5.37
LMAN2-208ENST00000515209 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.14■■■■■ 5.3
LMAN2-208ENST00000515209 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.66■■■■■ 5.22
LMAN2-208ENST00000515209 SCRIBQ14160 1630 aa47.56■■■■■ 5.2
LMAN2-208ENST00000515209 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.48■■■■■ 5.19
LMAN2-208ENST00000515209 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.17■■■■■ 5.14
LMAN2-208ENST00000515209 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.72■■■■■ 5.07
LMAN2-208ENST00000515209 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.36■■■■■ 5.01
LMAN2-208ENST00000515209 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.17■■■■■ 4.98
LMAN2-208ENST00000515209 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.78■■■■■ 4.92
LMAN2-208ENST00000515209 SMARCA4P51532 1647 aa45.54■■■■■ 4.88
LMAN2-208ENST00000515209 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.45■■■■■ 4.87
LMAN2-208ENST00000515209 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.23■■■■■ 4.83
LMAN2-208ENST00000515209 NCAPD3P42695 1498 aa45.21■■■■■ 4.83
LMAN2-208ENST00000515209 SMARCA2P51531 1590 aa45.2■■■■■ 4.83
LMAN2-208ENST00000515209 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.17■■■■■ 4.82
LMAN2-208ENST00000515209 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.14■■■■■ 4.82
LMAN2-208ENST00000515209 HMGXB3Q12766 1538 aa45.06■■■■■ 4.8
LMAN2-208ENST00000515209 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.83■■■■■ 4.77
LMAN2-208ENST00000515209 WIZO95785 1651 aa44.71■■■■■ 4.75
LMAN2-208ENST00000515209 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.6■■■■■ 4.73
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LMAN2-208ENST00000515209 NESP48681 1621 aa44.1■■■■■ 4.65
LMAN2-208ENST00000515209 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.07■■■■■ 4.65
LMAN2-208ENST00000515209 ERCC6Q03468 1493 aa43.87■■■■■ 4.61
LMAN2-208ENST00000515209 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.83■■■■■ 4.61
LMAN2-208ENST00000515209 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.71■■■■■ 4.59
LMAN2-208ENST00000515209 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.66■■■■■ 4.58
LMAN2-208ENST00000515209 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.65■■■■■ 4.58
LMAN2-208ENST00000515209 CFTRP13569 1480 aa43.64■■■■■ 4.58
LMAN2-208ENST00000515209 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.57■■■■■ 4.57
LMAN2-208ENST00000515209 CUX2O14529 1486 aa43.52■■■■■ 4.56
LMAN2-208ENST00000515209 PRDM2Q13029 1718 aa43.51■■■■■ 4.56
LMAN2-208ENST00000515209 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.36■■■■■ 4.53
LMAN2-208ENST00000515209 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.32■■■■■ 4.52
LMAN2-208ENST00000515209 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.27■■■■■ 4.52
LMAN2-208ENST00000515209 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.25■■■■■ 4.51
LMAN2-208ENST00000515209 WDR62O43379 1518 aa43.19■■■■■ 4.5
LMAN2-208ENST00000515209 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.97■■■■■ 4.47
LMAN2-208ENST00000515209 TOPBP1Q92547 1522 aa42.7■■■■■ 4.43
LMAN2-208ENST00000515209 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.69■■■■■ 4.42
LMAN2-208ENST00000515209 ABCC8Q09428 1581 aa42.67■■■■■ 4.42
LMAN2-208ENST00000515209 IFT140Q96RY7 1462 aa42.42■■■■■ 4.38
LMAN2-208ENST00000515209 CUX1P39880 1505 aa42.39■■■■■ 4.38
LMAN2-208ENST00000515209 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.33■■■■■ 4.37
LMAN2-208ENST00000515209 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.31■■■■■ 4.36
LMAN2-208ENST00000515209 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.22■■■■■ 4.35
LMAN2-208ENST00000515209 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.21■■■■■ 4.35
LMAN2-208ENST00000515209 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
LMAN2-208ENST00000515209 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.1■■■■■ 4.33
LMAN2-208ENST00000515209 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.1■■■■■ 4.33
LMAN2-208ENST00000515209 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.08■■■■■ 4.33
LMAN2-208ENST00000515209 SOGA1O94964 1423 aa42.07■■■■■ 4.33
LMAN2-208ENST00000515209 TOP2BQ02880 1626 aa42.06■■■■■ 4.32
LMAN2-208ENST00000515209 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.03■■■■■ 4.32
LMAN2-208ENST00000515209 WDR97A6NE52 1622 aa42.03■■■■■ 4.32
LMAN2-208ENST00000515209 SYNJ1O43426 1573 aa42.03■■■■■ 4.32
LMAN2-208ENST00000515209 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.93■■■■■ 4.36e-7■■■■□ 21.3
LMAN2-208ENST00000515209 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.84■■■■■ 4.29
LMAN2-208ENST00000515209 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.81■■■■■ 4.28
LMAN2-208ENST00000515209 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.75■■■■■ 4.27
LMAN2-208ENST00000515209 PBRM1Q86U86 1689 aa41.7■■■■■ 4.27
LMAN2-208ENST00000515209 CHD1O14646 1710 aa41.64■■■■■ 4.26
LMAN2-208ENST00000515209 GRIN2BQ13224 1484 aa41.64■■■■■ 4.26
LMAN2-208ENST00000515209 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.63■■■■■ 4.25
LMAN2-208ENST00000515209 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.59■■■■■ 4.25
LMAN2-208ENST00000515209 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.57■■■■■ 4.25
LMAN2-208ENST00000515209 OSCARQ8IYS5 282 aa41.55■■■■■ 4.24
LMAN2-208ENST00000515209 SYNJ2O15056 1496 aa41.39■■■■■ 4.22
LMAN2-208ENST00000515209 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.35■■■■■ 4.21
LMAN2-208ENST00000515209 ADAMTS12P58397 1594 aa41.33■■■■■ 4.21
LMAN2-208ENST00000515209 FBLN2P98095 1184 aa41.27■■■■■ 4.2
LMAN2-208ENST00000515209 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
LMAN2-208ENST00000515209 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.17■■■■■ 4.18
LMAN2-208ENST00000515209 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.15■■■■■ 4.18
LMAN2-208ENST00000515209 KIF27Q86VH2 1401 aa41.14■■■■■ 4.18
LMAN2-208ENST00000515209 GRIN2AQ12879 1464 aa41.13■■■■■ 4.17
LMAN2-208ENST00000515209 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.08■■■■■ 4.17
LMAN2-208ENST00000515209 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.08■■■■■ 4.17
LMAN2-208ENST00000515209 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.08■■■■■ 4.17
LMAN2-208ENST00000515209 ARHGEF11O15085 1522 aa41.03■■■■■ 4.16
LMAN2-208ENST00000515209 CUL7Q14999 1698 aa41.01■■■■■ 4.16
LMAN2-208ENST00000515209 IGF1RP08069 1367 aa40.98■■■■■ 4.15
LMAN2-208ENST00000515209 CEP170Q5SW79 1584 aa40.97■■■■■ 4.15
LMAN2-208ENST00000515209 NUP160Q12769 1436 aa40.96■■■■■ 4.15
LMAN2-208ENST00000515209 TRIM41Q8WV44 630 aa40.87■■■■■ 4.13
LMAN2-208ENST00000515209 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.78■■■■■ 4.12
LMAN2-208ENST00000515209 SHROOM2Q13796 1616 aa40.75■■■■■ 4.11
LMAN2-208ENST00000515209 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.71■■■■■ 4.11
LMAN2-208ENST00000515209 ARAP1Q96P48 1450 aa40.7■■■■■ 4.11
LMAN2-208ENST00000515209 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.56■■■■■ 4.08
LMAN2-208ENST00000515209 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.53■■■■■ 4.08
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