RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535671.5

GPRC5B-202, Transcript of G protein-coupled receptor class C group 5 member B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPRC5B, Length 1,215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPRC5B-202ENST00000535671 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.54■■■■■ 6.96
GPRC5B-202ENST00000535671 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.11■■■■■ 5.93
GPRC5B-202ENST00000535671 ABCC9O60706 1549 aa51.31■■■■■ 5.8
GPRC5B-202ENST00000535671 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.1■■■■■ 5.45
GPRC5B-202ENST00000535671 NACADO15069 1562 aa48.97■■■■■ 5.43
GPRC5B-202ENST00000535671 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.91■■■■■ 5.42
GPRC5B-202ENST00000535671 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.78■■■■■ 5.4
GPRC5B-202ENST00000535671 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.54■■■■■ 5.36
GPRC5B-202ENST00000535671 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.32■■■■■ 5.33
GPRC5B-202ENST00000535671 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.17■■■■■ 5.3
GPRC5B-202ENST00000535671 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.88■■■■■ 5.26
GPRC5B-202ENST00000535671 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.8■■■■■ 5.24
GPRC5B-202ENST00000535671 SCRIBQ14160 1630 aa47.71■■■■■ 5.23
GPRC5B-202ENST00000535671 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.28■■■■■ 5.16
GPRC5B-202ENST00000535671 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.02■■■■■ 5.12
GPRC5B-202ENST00000535671 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.5■■■■■ 5.03
GPRC5B-202ENST00000535671 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.37■■■■■ 5.01
GPRC5B-202ENST00000535671 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.05■■■■■ 4.96
GPRC5B-202ENST00000535671 SMARCA4P51532 1647 aa45.52■■■■■ 4.88
GPRC5B-202ENST00000535671 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.34■■■■■ 4.85
GPRC5B-202ENST00000535671 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.28■■■■■ 4.84
GPRC5B-202ENST00000535671 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.22■■■■■ 4.83
GPRC5B-202ENST00000535671 NCAPD3P42695 1498 aa45.19■■■■■ 4.82
GPRC5B-202ENST00000535671 SMARCA2P51531 1590 aa45.13■■■■■ 4.82
GPRC5B-202ENST00000535671 HMGXB3Q12766 1538 aa45.01■■■■■ 4.8
GPRC5B-202ENST00000535671 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.99■■■■■ 4.79
GPRC5B-202ENST00000535671 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.89■■■■■ 4.78
GPRC5B-202ENST00000535671 WIZO95785 1651 aa44.74■■■■■ 4.75
GPRC5B-202ENST00000535671 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.55■■■■■ 4.72
GPRC5B-202ENST00000535671 NESP48681 1621 aa44.4■■■■■ 4.7
GPRC5B-202ENST00000535671 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.17■■■■■ 4.66
GPRC5B-202ENST00000535671 ERCC6Q03468 1493 aa44.14■■■■■ 4.66
GPRC5B-202ENST00000535671 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.05■■■■■ 4.64
GPRC5B-202ENST00000535671 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.86■■■■■ 4.61
GPRC5B-202ENST00000535671 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.84■■■■■ 4.61
GPRC5B-202ENST00000535671 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.75■■■■■ 4.59
GPRC5B-202ENST00000535671 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.69■■■■■ 4.58
GPRC5B-202ENST00000535671 CUX2O14529 1486 aa43.69■■■■■ 4.58
GPRC5B-202ENST00000535671 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.64■■■■■ 4.58
GPRC5B-202ENST00000535671 CFTRP13569 1480 aa43.61■■■■■ 4.57
GPRC5B-202ENST00000535671 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.45■■■■■ 4.55
GPRC5B-202ENST00000535671 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.4■■■■■ 4.54
GPRC5B-202ENST00000535671 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.39■■■■■ 4.54
GPRC5B-202ENST00000535671 PRDM2Q13029 1718 aa43.3■■■■■ 4.52
GPRC5B-202ENST00000535671 WDR62O43379 1518 aa43.29■■■■■ 4.52
GPRC5B-202ENST00000535671 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.25■■■■■ 4.51
GPRC5B-202ENST00000535671 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.12■■■■■ 4.49
GPRC5B-202ENST00000535671 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.76■■■■■ 4.44
GPRC5B-202ENST00000535671 TOPBP1Q92547 1522 aa42.76■■■■■ 4.44
GPRC5B-202ENST00000535671 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.68■■■■■ 4.42
GPRC5B-202ENST00000535671 ABCC8Q09428 1581 aa42.5■■■■■ 4.39
GPRC5B-202ENST00000535671 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.46■■■■■ 4.39
GPRC5B-202ENST00000535671 IFT140Q96RY7 1462 aa42.45■■■■■ 4.39
GPRC5B-202ENST00000535671 CUX1P39880 1505 aa42.44■■■■■ 4.38
GPRC5B-202ENST00000535671 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.4■■■■■ 4.38
GPRC5B-202ENST00000535671 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.34■■■■■ 4.37
GPRC5B-202ENST00000535671 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.28■■■■■ 4.36
GPRC5B-202ENST00000535671 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.27■■■■■ 4.36
GPRC5B-202ENST00000535671 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.27■■■■■ 4.36
GPRC5B-202ENST00000535671 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.11■■■■■ 4.332e-6■■■■■ 26.9
GPRC5B-202ENST00000535671 SOGA1O94964 1423 aa42.11■■■■■ 4.33
GPRC5B-202ENST00000535671 SYNJ1O43426 1573 aa42.04■■■■■ 4.32
GPRC5B-202ENST00000535671 WDR97A6NE52 1622 aa41.99■■■■■ 4.31
GPRC5B-202ENST00000535671 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.99■■■■■ 4.31
GPRC5B-202ENST00000535671 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.97■■■■■ 4.31
GPRC5B-202ENST00000535671 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.95■■■■■ 4.31
GPRC5B-202ENST00000535671 TOP2BQ02880 1626 aa41.93■■■■■ 4.3
GPRC5B-202ENST00000535671 OSCARQ8IYS5 282 aa41.78■■■■■ 4.28
GPRC5B-202ENST00000535671 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.78■■■■■ 4.28
GPRC5B-202ENST00000535671 CHD1O14646 1710 aa41.77■■■■■ 4.28
GPRC5B-202ENST00000535671 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.76■■■■■ 4.28
GPRC5B-202ENST00000535671 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.73■■■■■ 4.27
GPRC5B-202ENST00000535671 PBRM1Q86U86 1689 aa41.69■■■■■ 4.26
GPRC5B-202ENST00000535671 GRIN2BQ13224 1484 aa41.66■■■■■ 4.26
GPRC5B-202ENST00000535671 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.66■■■■■ 4.26
GPRC5B-202ENST00000535671 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.56■■■■■ 4.24
GPRC5B-202ENST00000535671 FBLN2P98095 1184 aa41.55■■■■■ 4.24
GPRC5B-202ENST00000535671 SYNJ2O15056 1496 aa41.43■■■■■ 4.22
GPRC5B-202ENST00000535671 ADAMTS12P58397 1594 aa41.37■■■■■ 4.21
GPRC5B-202ENST00000535671 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.33■■■■■ 4.21
GPRC5B-202ENST00000535671 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.33■■■■■ 4.21
GPRC5B-202ENST00000535671 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.33■■■■■ 4.21
GPRC5B-202ENST00000535671 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.21
GPRC5B-202ENST00000535671 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.28■■■■■ 4.2
GPRC5B-202ENST00000535671 ARHGEF11O15085 1522 aa41.28■■■■■ 4.2
GPRC5B-202ENST00000535671 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.24■■■■■ 4.19
GPRC5B-202ENST00000535671 GRIN2AQ12879 1464 aa41.18■■■■■ 4.18
GPRC5B-202ENST00000535671 TRIM41Q8WV44 630 aa41.18■■■■■ 4.18
GPRC5B-202ENST00000535671 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.13■■■■■ 4.17
GPRC5B-202ENST00000535671 CEP170Q5SW79 1584 aa41.08■■■■■ 4.17
GPRC5B-202ENST00000535671 KIF27Q86VH2 1401 aa41.04■■■■■ 4.16
GPRC5B-202ENST00000535671 NUP160Q12769 1436 aa41■■■■■ 4.15
GPRC5B-202ENST00000535671 ARAP1Q96P48 1450 aa40.99■■■■■ 4.15
GPRC5B-202ENST00000535671 IGF1RP08069 1367 aa40.93■■■■■ 4.14
GPRC5B-202ENST00000535671 CUL7Q14999 1698 aa40.86■■■■■ 4.13
GPRC5B-202ENST00000535671 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.84■■■■■ 4.13
GPRC5B-202ENST00000535671 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.82■■■■■ 4.13
GPRC5B-202ENST00000535671 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.79■■■■■ 4.12
GPRC5B-202ENST00000535671 SHROOM2Q13796 1616 aa40.75■■■■■ 4.11
GPRC5B-202ENST00000535671 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.66■■■■■ 4.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.8 ms