RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556618.1

RCCD1-206, Transcript of RCC1 domain containing 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene RCCD1, Length 1,556 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1-206ENST00000556618 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.51■■■■■ 6.8
RCCD1-206ENST00000556618 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.88■■■■■ 5.74
RCCD1-206ENST00000556618 ABCC9O60706 1549 aa49.28■■■■■ 5.48
RCCD1-206ENST00000556618 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48■■■■■ 5.28
RCCD1-206ENST00000556618 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.86■■■■■ 5.25
RCCD1-206ENST00000556618 NACADO15069 1562 aa47.71■■■■■ 5.23
RCCD1-206ENST00000556618 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.63■■■■■ 5.22
RCCD1-206ENST00000556618 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.59■■■■■ 5.21
RCCD1-206ENST00000556618 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.59■■■■■ 5.21
RCCD1-206ENST00000556618 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.64■■■■■ 5.06
RCCD1-206ENST00000556618 SCRIBQ14160 1630 aa46.48■■■■■ 5.03
RCCD1-206ENST00000556618 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.2■■■■■ 4.99
RCCD1-206ENST00000556618 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.16■■■■■ 4.98
RCCD1-206ENST00000556618 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.76■■■■■ 4.92
RCCD1-206ENST00000556618 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.92■■■■■ 4.78
RCCD1-206ENST00000556618 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.78■■■■■ 4.76
RCCD1-206ENST00000556618 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.76■■■■■ 4.76
RCCD1-206ENST00000556618 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.61■■■■■ 4.73
RCCD1-206ENST00000556618 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.52■■■■■ 4.72
RCCD1-206ENST00000556618 SMARCA4P51532 1647 aa44.51■■■■■ 4.72
RCCD1-206ENST00000556618 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.34■■■■■ 4.69
RCCD1-206ENST00000556618 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.13■■■■■ 4.65
RCCD1-206ENST00000556618 SMARCA2P51531 1590 aa44.1■■■■■ 4.65
RCCD1-206ENST00000556618 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.06■■■■■ 4.64
RCCD1-206ENST00000556618 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.02■■■■■ 4.64
RCCD1-206ENST00000556618 NCAPD3P42695 1498 aa44.02■■■■■ 4.64
RCCD1-206ENST00000556618 WIZO95785 1651 aa43.91■■■■■ 4.62
RCCD1-206ENST00000556618 HMGXB3Q12766 1538 aa43.84■■■■■ 4.61
RCCD1-206ENST00000556618 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.78■■■■■ 4.6
RCCD1-206ENST00000556618 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.44■■■■■ 4.54
RCCD1-206ENST00000556618 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.34■■■■■ 4.53
RCCD1-206ENST00000556618 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.95■■■■■ 4.47
RCCD1-206ENST00000556618 NESP48681 1621 aa42.82■■■■■ 4.44
RCCD1-206ENST00000556618 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.77■■■■■ 4.44
RCCD1-206ENST00000556618 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.77■■■■■ 4.44
RCCD1-206ENST00000556618 CFTRP13569 1480 aa42.63■■■■■ 4.41
RCCD1-206ENST00000556618 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.46■■■■■ 4.39
RCCD1-206ENST00000556618 ERCC6Q03468 1493 aa42.41■■■■■ 4.38
RCCD1-206ENST00000556618 PRDM2Q13029 1718 aa42.39■■■■■ 4.38
RCCD1-206ENST00000556618 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.35■■■■■ 4.37
RCCD1-206ENST00000556618 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.27■■■■■ 4.36
RCCD1-206ENST00000556618 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.16■■■■■ 4.34
RCCD1-206ENST00000556618 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.04■■■■■ 4.32
RCCD1-206ENST00000556618 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.99■■■■■ 4.31
RCCD1-206ENST00000556618 WDR62O43379 1518 aa41.83■■■■■ 4.29
RCCD1-206ENST00000556618 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.83■■■■■ 4.29
RCCD1-206ENST00000556618 CUX2O14529 1486 aa41.76■■■■■ 4.28
RCCD1-206ENST00000556618 ABCC8Q09428 1581 aa41.69■■■■■ 4.26
RCCD1-206ENST00000556618 TOPBP1Q92547 1522 aa41.66■■■■■ 4.26
RCCD1-206ENST00000556618 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.66■■■■■ 4.26
RCCD1-206ENST00000556618 CUX1P39880 1505 aa41.56■■■■■ 4.24
RCCD1-206ENST00000556618 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.48■■■■■ 4.23
RCCD1-206ENST00000556618 SYNJ1O43426 1573 aa41.36■■■■■ 4.21
RCCD1-206ENST00000556618 TOP2BQ02880 1626 aa41.35■■■■■ 4.21
RCCD1-206ENST00000556618 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
RCCD1-206ENST00000556618 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.34■■■■■ 4.21
RCCD1-206ENST00000556618 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.32■■■■■ 4.21
RCCD1-206ENST00000556618 IFT140Q96RY7 1462 aa41.26■■■■■ 4.2
RCCD1-206ENST00000556618 SOGA1O94964 1423 aa41.2■■■■■ 4.19
RCCD1-206ENST00000556618 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.19■■■■■ 4.18
RCCD1-206ENST00000556618 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.17■■■■■ 4.18
RCCD1-206ENST00000556618 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.04■■■■■ 4.16
RCCD1-206ENST00000556618 WDR97A6NE52 1622 aa40.97■■■■■ 4.15
RCCD1-206ENST00000556618 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.95■■■■■ 4.15
RCCD1-206ENST00000556618 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
RCCD1-206ENST00000556618 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
RCCD1-206ENST00000556618 TRIM41Q8WV44 630 aa40.9■■■■■ 4.14
RCCD1-206ENST00000556618 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.89■■■■■ 4.145e-8■■■■■ 50.5
RCCD1-206ENST00000556618 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.77■■■■■ 4.12
RCCD1-206ENST00000556618 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.75■■■■■ 4.11
RCCD1-206ENST00000556618 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.73■■■■■ 4.11
RCCD1-206ENST00000556618 GRIN2BQ13224 1484 aa40.63■■■■■ 4.1
RCCD1-206ENST00000556618 PBRM1Q86U86 1689 aa40.63■■■■■ 4.09
RCCD1-206ENST00000556618 KIF27Q86VH2 1401 aa40.57■■■■■ 4.08
RCCD1-206ENST00000556618 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.5■■■■■ 4.07
RCCD1-206ENST00000556618 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.47■■■■■ 4.07
RCCD1-206ENST00000556618 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.47■■■■■ 4.07
RCCD1-206ENST00000556618 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.41■■■■■ 4.06
RCCD1-206ENST00000556618 IGF1RP08069 1367 aa40.37■■■■■ 4.05
RCCD1-206ENST00000556618 CHD1O14646 1710 aa40.32■■■■■ 4.04
RCCD1-206ENST00000556618 SYNJ2O15056 1496 aa40.31■■■■■ 4.04
RCCD1-206ENST00000556618 ADAMTS12P58397 1594 aa40.3■■■■■ 4.04
RCCD1-206ENST00000556618 FBLN2P98095 1184 aa40.3■■■■■ 4.04
RCCD1-206ENST00000556618 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
RCCD1-206ENST00000556618 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.26■■■■■ 4.04
RCCD1-206ENST00000556618 CUL7Q14999 1698 aa40.21■■■■■ 4.03
RCCD1-206ENST00000556618 OSCARQ8IYS5 282 aa40.17■■■■■ 4.02
RCCD1-206ENST00000556618 EEA1Q15075 1411 aa40.14■■■■■ 4.02
RCCD1-206ENST00000556618 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.13■■■■■ 4.01
RCCD1-206ENST00000556618 GRIN2AQ12879 1464 aa40.12■■■■■ 4.01
RCCD1-206ENST00000556618 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.06■■■■■ 4
RCCD1-206ENST00000556618 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.05■■■■■ 4
RCCD1-206ENST00000556618 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.94■■■■□ 3.98
RCCD1-206ENST00000556618 PRXQ9BXM0 1461 aa39.94■■■■□ 3.98
RCCD1-206ENST00000556618 NUP160Q12769 1436 aa39.91■■■■□ 3.98
RCCD1-206ENST00000556618 CEP170Q5SW79 1584 aa39.9■■■■□ 3.98
RCCD1-206ENST00000556618 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.89■■■■□ 3.98
RCCD1-206ENST00000556618 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.85■■■■□ 3.97
RCCD1-206ENST00000556618 KIF21BO75037 1637 aa39.7■■■■□ 3.95
RCCD1-206ENST00000556618 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa39.67■■■■□ 3.94
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