RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615125.1

PVT1_1.1-201, humanhuman

BASIC

Gene PVT1_1, Length 194 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVT1_1.1-201ENST00000615125 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.8■■■■■ 7
PVT1_1.1-201ENST00000615125 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.37■■■■■ 5.97
PVT1_1.1-201ENST00000615125 ABCC9O60706 1549 aa51.79■■■■■ 5.88
PVT1_1.1-201ENST00000615125 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.49■■■■■ 5.51
PVT1_1.1-201ENST00000615125 NACADO15069 1562 aa49.35■■■■■ 5.49
PVT1_1.1-201ENST00000615125 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.34■■■■■ 5.49
PVT1_1.1-201ENST00000615125 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.88■■■■■ 5.42
PVT1_1.1-201ENST00000615125 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.88■■■■■ 5.41
PVT1_1.1-201ENST00000615125 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.55■■■■■ 5.36
PVT1_1.1-201ENST00000615125 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.54■■■■■ 5.36
PVT1_1.1-201ENST00000615125 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.38■■■■■ 5.34
PVT1_1.1-201ENST00000615125 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.18■■■■■ 5.3
PVT1_1.1-201ENST00000615125 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.08■■■■■ 5.29
PVT1_1.1-201ENST00000615125 SCRIBQ14160 1630 aa47.87■■■■■ 5.25
PVT1_1.1-201ENST00000615125 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.36■■■■■ 5.17
PVT1_1.1-201ENST00000615125 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.86■■■■■ 5.09
PVT1_1.1-201ENST00000615125 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.8■■■■■ 5.08
PVT1_1.1-201ENST00000615125 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.52■■■■■ 5.04
PVT1_1.1-201ENST00000615125 SMARCA4P51532 1647 aa45.71■■■■■ 4.91
PVT1_1.1-201ENST00000615125 NCAPD3P42695 1498 aa45.59■■■■■ 4.89
PVT1_1.1-201ENST00000615125 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.58■■■■■ 4.89
PVT1_1.1-201ENST00000615125 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.53■■■■■ 4.88
PVT1_1.1-201ENST00000615125 SMARCA2P51531 1590 aa45.41■■■■■ 4.86
PVT1_1.1-201ENST00000615125 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.38■■■■■ 4.86
PVT1_1.1-201ENST00000615125 HMGXB3Q12766 1538 aa45.27■■■■■ 4.84
PVT1_1.1-201ENST00000615125 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.24■■■■■ 4.83
PVT1_1.1-201ENST00000615125 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.12■■■■■ 4.81
PVT1_1.1-201ENST00000615125 WIZO95785 1651 aa44.88■■■■■ 4.78
PVT1_1.1-201ENST00000615125 NESP48681 1621 aa44.75■■■■■ 4.75
PVT1_1.1-201ENST00000615125 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.68■■■■■ 4.74
PVT1_1.1-201ENST00000615125 ERCC6Q03468 1493 aa44.54■■■■■ 4.72
PVT1_1.1-201ENST00000615125 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.39■■■■■ 4.7
PVT1_1.1-201ENST00000615125 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.28■■■■■ 4.68
PVT1_1.1-201ENST00000615125 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.23■■■■■ 4.67
PVT1_1.1-201ENST00000615125 CUX2O14529 1486 aa44.21■■■■■ 4.67
PVT1_1.1-201ENST00000615125 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.16■■■■■ 4.66
PVT1_1.1-201ENST00000615125 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.09■■■■■ 4.65
PVT1_1.1-201ENST00000615125 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.07■■■■■ 4.65
PVT1_1.1-201ENST00000615125 CFTRP13569 1480 aa43.89■■■■■ 4.62
PVT1_1.1-201ENST00000615125 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.83■■■■■ 4.61
PVT1_1.1-201ENST00000615125 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.73■■■■■ 4.59
PVT1_1.1-201ENST00000615125 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.72■■■■■ 4.59
PVT1_1.1-201ENST00000615125 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.68■■■■■ 4.58
PVT1_1.1-201ENST00000615125 WDR62O43379 1518 aa43.6■■■■■ 4.57
PVT1_1.1-201ENST00000615125 PRDM2Q13029 1718 aa43.51■■■■■ 4.56
PVT1_1.1-201ENST00000615125 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.47■■■■■ 4.55
PVT1_1.1-201ENST00000615125 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.39■■■■■ 4.54
PVT1_1.1-201ENST00000615125 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.26■■■■■ 4.52
PVT1_1.1-201ENST00000615125 TOPBP1Q92547 1522 aa43.02■■■■■ 4.48
PVT1_1.1-201ENST00000615125 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.88■■■■■ 4.45
PVT1_1.1-201ENST00000615125 ABCC8Q09428 1581 aa42.85■■■■■ 4.45
PVT1_1.1-201ENST00000615125 IFT140Q96RY7 1462 aa42.77■■■■■ 4.44
PVT1_1.1-201ENST00000615125 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.76■■■■■ 4.44
PVT1_1.1-201ENST00000615125 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.62■■■■■ 4.41
PVT1_1.1-201ENST00000615125 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.6■■■■■ 4.41
PVT1_1.1-201ENST00000615125 CUX1P39880 1505 aa42.58■■■■■ 4.41
PVT1_1.1-201ENST00000615125 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.51■■■■■ 4.4
PVT1_1.1-201ENST00000615125 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.48■■■■■ 4.39
PVT1_1.1-201ENST00000615125 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.46■■■■■ 4.39
PVT1_1.1-201ENST00000615125 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.44■■■■■ 4.38
PVT1_1.1-201ENST00000615125 SOGA1O94964 1423 aa42.43■■■■■ 4.38
PVT1_1.1-201ENST00000615125 OSCARQ8IYS5 282 aa42.36■■■■■ 4.37
PVT1_1.1-201ENST00000615125 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.29■■■■■ 4.36
PVT1_1.1-201ENST00000615125 WDR97A6NE52 1622 aa42.13■■■■■ 4.34
PVT1_1.1-201ENST00000615125 CHD1O14646 1710 aa42.08■■■■■ 4.33
PVT1_1.1-201ENST00000615125 SYNJ1O43426 1573 aa42.07■■■■■ 4.33
PVT1_1.1-201ENST00000615125 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.07■■■■■ 4.33
PVT1_1.1-201ENST00000615125 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.04■■■■■ 4.32
PVT1_1.1-201ENST00000615125 TOP2BQ02880 1626 aa42.03■■■■■ 4.32
PVT1_1.1-201ENST00000615125 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.99■■■■■ 4.31
PVT1_1.1-201ENST00000615125 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.99■■■■■ 4.31
PVT1_1.1-201ENST00000615125 FBLN2P98095 1184 aa41.96■■■■■ 4.31
PVT1_1.1-201ENST00000615125 GRIN2BQ13224 1484 aa41.93■■■■■ 4.3
PVT1_1.1-201ENST00000615125 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.91■■■■■ 4.3
PVT1_1.1-201ENST00000615125 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.88■■■■■ 4.3
PVT1_1.1-201ENST00000615125 PBRM1Q86U86 1689 aa41.87■■■■■ 4.29
PVT1_1.1-201ENST00000615125 TRIM41Q8WV44 630 aa41.87■■■■■ 4.29
PVT1_1.1-201ENST00000615125 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.84■■■■■ 4.29
PVT1_1.1-201ENST00000615125 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.79■■■■■ 4.28
PVT1_1.1-201ENST00000615125 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.79■■■■■ 4.28
PVT1_1.1-201ENST00000615125 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.79■■■■■ 4.28
PVT1_1.1-201ENST00000615125 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.74■■■■■ 4.27
PVT1_1.1-201ENST00000615125 SYNJ2O15056 1496 aa41.72■■■■■ 4.27
PVT1_1.1-201ENST00000615125 ARHGEF11O15085 1522 aa41.7■■■■■ 4.27
PVT1_1.1-201ENST00000615125 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.59■■■■■ 4.25
PVT1_1.1-201ENST00000615125 ADAMTS12P58397 1594 aa41.5■■■■■ 4.23
PVT1_1.1-201ENST00000615125 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.44■■■■■ 4.23
PVT1_1.1-201ENST00000615125 GRIN2AQ12879 1464 aa41.42■■■■■ 4.22
PVT1_1.1-201ENST00000615125 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.39■■■■■ 4.22
PVT1_1.1-201ENST00000615125 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.38■■■■■ 4.21
PVT1_1.1-201ENST00000615125 ARAP1Q96P48 1450 aa41.38■■■■■ 4.21
PVT1_1.1-201ENST00000615125 CEP170Q5SW79 1584 aa41.29■■■■■ 4.2
PVT1_1.1-201ENST00000615125 NUP160Q12769 1436 aa41.27■■■■■ 4.2
PVT1_1.1-201ENST00000615125 KIF27Q86VH2 1401 aa41.18■■■■■ 4.18
PVT1_1.1-201ENST00000615125 IGF1RP08069 1367 aa41.18■■■■■ 4.18
PVT1_1.1-201ENST00000615125 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.09■■■■■ 4.17
PVT1_1.1-201ENST00000615125 SHROOM2Q13796 1616 aa41.01■■■■■ 4.16
PVT1_1.1-201ENST00000615125 CUL7Q14999 1698 aa40.97■■■■■ 4.15
PVT1_1.1-201ENST00000615125 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.91■■■■■ 4.14
PVT1_1.1-201ENST00000615125 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.88■■■■■ 4.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms