RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393952.3

LRFN4-202, Transcript of leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LRFN4, Length 1,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN4-202ENST00000393952 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.66■■■■■ 6.66
LRFN4-202ENST00000393952 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.78■■■■■ 5.56
LRFN4-202ENST00000393952 ABCC9O60706 1549 aa47.66■■■■■ 5.22
LRFN4-202ENST00000393952 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.46■■■■■ 5.19
LRFN4-202ENST00000393952 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.94■■■■■ 5.1
LRFN4-202ENST00000393952 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.86■■■■■ 5.09
LRFN4-202ENST00000393952 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.56■■■■■ 5.04
LRFN4-202ENST00000393952 NACADO15069 1562 aa46.5■■■■■ 5.03
LRFN4-202ENST00000393952 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.28■■■■■ 5
LRFN4-202ENST00000393952 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.67■■■■■ 4.9
LRFN4-202ENST00000393952 SCRIBQ14160 1630 aa45.66■■■■■ 4.9
LRFN4-202ENST00000393952 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.36■■■■■ 4.85
LRFN4-202ENST00000393952 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.91■■■■■ 4.78
LRFN4-202ENST00000393952 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.77■■■■■ 4.76
LRFN4-202ENST00000393952 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.07■■■■■ 4.65
LRFN4-202ENST00000393952 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.81■■■■■ 4.6
LRFN4-202ENST00000393952 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.74■■■■■ 4.59
LRFN4-202ENST00000393952 SMARCA4P51532 1647 aa43.72■■■■■ 4.59
LRFN4-202ENST00000393952 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.66■■■■■ 4.58
LRFN4-202ENST00000393952 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.6■■■■■ 4.57
LRFN4-202ENST00000393952 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.57■■■■■ 4.57
LRFN4-202ENST00000393952 WIZO95785 1651 aa43.36■■■■■ 4.53
LRFN4-202ENST00000393952 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.21■■■■■ 4.51
LRFN4-202ENST00000393952 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.16■■■■■ 4.5
LRFN4-202ENST00000393952 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.13■■■■■ 4.5
LRFN4-202ENST00000393952 SMARCA2P51531 1590 aa43.13■■■■■ 4.49
LRFN4-202ENST00000393952 NCAPD3P42695 1498 aa42.9■■■■■ 4.46
LRFN4-202ENST00000393952 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.9■■■■■ 4.46
LRFN4-202ENST00000393952 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.87■■■■■ 4.45
LRFN4-202ENST00000393952 HMGXB3Q12766 1538 aa42.81■■■■■ 4.44
LRFN4-202ENST00000393952 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.65■■■■■ 4.42
LRFN4-202ENST00000393952 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.42■■■■■ 4.38
LRFN4-202ENST00000393952 CFTRP13569 1480 aa41.75■■■■■ 4.27
LRFN4-202ENST00000393952 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.74■■■■■ 4.27
LRFN4-202ENST00000393952 NESP48681 1621 aa41.63■■■■■ 4.25
LRFN4-202ENST00000393952 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.58■■■■■ 4.25
LRFN4-202ENST00000393952 PRDM2Q13029 1718 aa41.57■■■■■ 4.24
LRFN4-202ENST00000393952 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.34■■■■■ 4.21
LRFN4-202ENST00000393952 ABCC8Q09428 1581 aa41.31■■■■■ 4.2
LRFN4-202ENST00000393952 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.29■■■■■ 4.2
LRFN4-202ENST00000393952 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.26■■■■■ 4.2
LRFN4-202ENST00000393952 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.16■■■■■ 4.18
LRFN4-202ENST00000393952 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.12■■■■■ 4.17
LRFN4-202ENST00000393952 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.12■■■■■ 4.17
LRFN4-202ENST00000393952 TRIM41Q8WV44 630 aa41.02■■■■■ 4.16
LRFN4-202ENST00000393952 SYNJ1O43426 1573 aa41.01■■■■■ 4.16
LRFN4-202ENST00000393952 CUX1P39880 1505 aa40.96■■■■■ 4.15
LRFN4-202ENST00000393952 ERCC6Q03468 1493 aa40.93■■■■■ 4.14
LRFN4-202ENST00000393952 TOP2BQ02880 1626 aa40.89■■■■■ 4.14
LRFN4-202ENST00000393952 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.89■■■■■ 4.14
LRFN4-202ENST00000393952 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
LRFN4-202ENST00000393952 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.82■■■■■ 4.13
LRFN4-202ENST00000393952 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.8■■■■■ 4.12
LRFN4-202ENST00000393952 TOPBP1Q92547 1522 aa40.78■■■■■ 4.12
LRFN4-202ENST00000393952 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
LRFN4-202ENST00000393952 WDR62O43379 1518 aa40.62■■■■■ 4.09
LRFN4-202ENST00000393952 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.61■■■■■ 4.09
LRFN4-202ENST00000393952 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
LRFN4-202ENST00000393952 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.38■■■■■ 4.05
LRFN4-202ENST00000393952 SOGA1O94964 1423 aa40.36■■■■■ 4.05
LRFN4-202ENST00000393952 CUX2O14529 1486 aa40.31■■■■■ 4.04
LRFN4-202ENST00000393952 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.27■■■■■ 4.04
LRFN4-202ENST00000393952 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.25■■■■■ 4.03
LRFN4-202ENST00000393952 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
LRFN4-202ENST00000393952 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.24■■■■■ 4.03
LRFN4-202ENST00000393952 WDR97A6NE52 1622 aa40.22■■■■■ 4.03
LRFN4-202ENST00000393952 IFT140Q96RY7 1462 aa40.17■■■■■ 4.02
LRFN4-202ENST00000393952 EEA1Q15075 1411 aa40.15■■■■■ 4.02
LRFN4-202ENST00000393952 KIF27Q86VH2 1401 aa40.13■■■■■ 4.02
LRFN4-202ENST00000393952 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.03■■■■■ 4
LRFN4-202ENST00000393952 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40■■■■□ 3.99
LRFN4-202ENST00000393952 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.98■■■■□ 3.99
LRFN4-202ENST00000393952 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.97■■■■□ 3.99
LRFN4-202ENST00000393952 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.92■■■■□ 3.98
LRFN4-202ENST00000393952 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.9■■■■□ 3.982e-9■■■■□ 19.4
LRFN4-202ENST00000393952 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.85■■■■□ 3.97
LRFN4-202ENST00000393952 IGF1RP08069 1367 aa39.84■■■■□ 3.97
LRFN4-202ENST00000393952 PBRM1Q86U86 1689 aa39.79■■■■□ 3.96
LRFN4-202ENST00000393952 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.76■■■■□ 3.96
LRFN4-202ENST00000393952 GRIN2BQ13224 1484 aa39.73■■■■□ 3.95
LRFN4-202ENST00000393952 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.72■■■■□ 3.95
LRFN4-202ENST00000393952 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.7■■■■□ 3.95
LRFN4-202ENST00000393952 KIF21BO75037 1637 aa39.7■■■■□ 3.95
LRFN4-202ENST00000393952 PRXQ9BXM0 1461 aa39.69■■■■□ 3.94
LRFN4-202ENST00000393952 CUL7Q14999 1698 aa39.65■■■■□ 3.94
LRFN4-202ENST00000393952 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.64■■■■□ 3.94
LRFN4-202ENST00000393952 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.59■■■■□ 3.93
LRFN4-202ENST00000393952 GOLGA3Q08378 1498 aa39.57■■■■□ 3.93
LRFN4-202ENST00000393952 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.55■■■■□ 3.92
LRFN4-202ENST00000393952 ADAMTS12P58397 1594 aa39.54■■■■□ 3.92
LRFN4-202ENST00000393952 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.47■■■■□ 3.91
LRFN4-202ENST00000393952 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.47■■■■□ 3.91
LRFN4-202ENST00000393952 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.39■■■■□ 3.9
LRFN4-202ENST00000393952 SYNJ2O15056 1496 aa39.32■■■■□ 3.88
LRFN4-202ENST00000393952 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.29■■■■□ 3.88
LRFN4-202ENST00000393952 GRIN2AQ12879 1464 aa39.24■■■■□ 3.87
LRFN4-202ENST00000393952 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.22■■■■□ 3.87
LRFN4-202ENST00000393952 FBLN2P98095 1184 aa39.2■■■■□ 3.87
LRFN4-202ENST00000393952 CHD1O14646 1710 aa39.15■■■■□ 3.86
LRFN4-202ENST00000393952 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.13■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms