Protein–RNA interactions for Protein: K7EJ46

SMIM22, Small integral membrane protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM22K7EJ46 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMIM22K7EJ46 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMIM22K7EJ46 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMIM22K7EJ46 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMIM22K7EJ46 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMIM22K7EJ46 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMIM22K7EJ46 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMIM22K7EJ46 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMIM22K7EJ46 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SMIM22K7EJ46 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMIM22K7EJ46 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMIM22K7EJ46 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMIM22K7EJ46 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SMIM22K7EJ46 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMIM22K7EJ46 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMIM22K7EJ46 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMIM22K7EJ46 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SMIM22K7EJ46 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMIM22K7EJ46 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMIM22K7EJ46 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMIM22K7EJ46 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMIM22K7EJ46 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMIM22K7EJ46 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMIM22K7EJ46 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMIM22K7EJ46 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMIM22K7EJ46 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMIM22K7EJ46 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SMIM22K7EJ46 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMIM22K7EJ46 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SMIM22K7EJ46 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMIM22K7EJ46 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMIM22K7EJ46 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMIM22K7EJ46 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMIM22K7EJ46 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMIM22K7EJ46 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMIM22K7EJ46 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMIM22K7EJ46 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMIM22K7EJ46 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMIM22K7EJ46 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMIM22K7EJ46 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMIM22K7EJ46 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMIM22K7EJ46 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMIM22K7EJ46 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMIM22K7EJ46 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMIM22K7EJ46 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SMIM22K7EJ46 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMIM22K7EJ46 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMIM22K7EJ46 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMIM22K7EJ46 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMIM22K7EJ46 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMIM22K7EJ46 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMIM22K7EJ46 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMIM22K7EJ46 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SMIM22K7EJ46 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMIM22K7EJ46 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMIM22K7EJ46 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMIM22K7EJ46 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMIM22K7EJ46 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMIM22K7EJ46 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMIM22K7EJ46 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMIM22K7EJ46 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMIM22K7EJ46 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMIM22K7EJ46 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMIM22K7EJ46 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMIM22K7EJ46 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMIM22K7EJ46 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMIM22K7EJ46 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMIM22K7EJ46 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMIM22K7EJ46 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMIM22K7EJ46 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMIM22K7EJ46 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMIM22K7EJ46 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMIM22K7EJ46 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMIM22K7EJ46 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMIM22K7EJ46 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SMIM22K7EJ46 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SMIM22K7EJ46 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMIM22K7EJ46 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMIM22K7EJ46 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMIM22K7EJ46 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMIM22K7EJ46 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMIM22K7EJ46 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMIM22K7EJ46 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMIM22K7EJ46 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMIM22K7EJ46 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMIM22K7EJ46 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMIM22K7EJ46 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SMIM22K7EJ46 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMIM22K7EJ46 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMIM22K7EJ46 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMIM22K7EJ46 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMIM22K7EJ46 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMIM22K7EJ46 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMIM22K7EJ46 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SMIM22K7EJ46 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SMIM22K7EJ46 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMIM22K7EJ46 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMIM22K7EJ46 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMIM22K7EJ46 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMIM22K7EJ46 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms