RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527078.5

SLC52A2-208, Transcript of solute carrier family 52 member 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SLC52A2, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2-208ENST00000527078 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.85■■■■■ 6.53
SLC52A2-208ENST00000527078 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.93■■■■■ 5.42
SLC52A2-208ENST00000527078 ABCC9O60706 1549 aa46.93■■■■■ 5.1
SLC52A2-208ENST00000527078 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.8■■■■■ 5.08
SLC52A2-208ENST00000527078 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.34■■■■■ 5.01
SLC52A2-208ENST00000527078 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.09■■■■■ 4.97
SLC52A2-208ENST00000527078 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.74■■■■■ 4.91
SLC52A2-208ENST00000527078 NACADO15069 1562 aa45.69■■■■■ 4.91
SLC52A2-208ENST00000527078 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.46■■■■■ 4.87
SLC52A2-208ENST00000527078 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.25■■■■■ 4.83
SLC52A2-208ENST00000527078 SCRIBQ14160 1630 aa45.03■■■■■ 4.8
SLC52A2-208ENST00000527078 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.69■■■■■ 4.74
SLC52A2-208ENST00000527078 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.23■■■■■ 4.67
SLC52A2-208ENST00000527078 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.15■■■■■ 4.66
SLC52A2-208ENST00000527078 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.54■■■■■ 4.56
SLC52A2-208ENST00000527078 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.19■■■■■ 4.51
SLC52A2-208ENST00000527078 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.16■■■■■ 4.5
SLC52A2-208ENST00000527078 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.12■■■■■ 4.49
SLC52A2-208ENST00000527078 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.12■■■■■ 4.49
SLC52A2-208ENST00000527078 SMARCA4P51532 1647 aa43.08■■■■■ 4.49
SLC52A2-208ENST00000527078 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.9■■■■■ 4.46
SLC52A2-208ENST00000527078 WIZO95785 1651 aa42.83■■■■■ 4.45
SLC52A2-208ENST00000527078 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.54■■■■■ 4.4
SLC52A2-208ENST00000527078 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.51■■■■■ 4.4
SLC52A2-208ENST00000527078 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.44■■■■■ 4.38
SLC52A2-208ENST00000527078 SMARCA2P51531 1590 aa42.4■■■■■ 4.38
SLC52A2-208ENST00000527078 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.28■■■■■ 4.36
SLC52A2-208ENST00000527078 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.21■■■■■ 4.35
SLC52A2-208ENST00000527078 NCAPD3P42695 1498 aa42.2■■■■■ 4.35
SLC52A2-208ENST00000527078 HMGXB3Q12766 1538 aa42.09■■■■■ 4.33
SLC52A2-208ENST00000527078 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.03■■■■■ 4.32
SLC52A2-208ENST00000527078 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.87■■■■■ 4.29
SLC52A2-208ENST00000527078 CFTRP13569 1480 aa41.12■■■■■ 4.17
SLC52A2-208ENST00000527078 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.08■■■■■ 4.17
SLC52A2-208ENST00000527078 NESP48681 1621 aa41.06■■■■■ 4.16
SLC52A2-208ENST00000527078 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.99■■■■■ 4.15
SLC52A2-208ENST00000527078 PRDM2Q13029 1718 aa40.89■■■■■ 4.14
SLC52A2-208ENST00000527078 ABCC8Q09428 1581 aa40.87■■■■■ 4.13
SLC52A2-208ENST00000527078 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.86■■■■■ 4.13
SLC52A2-208ENST00000527078 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.66■■■■■ 4.1
SLC52A2-208ENST00000527078 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.56■■■■■ 4.08
SLC52A2-208ENST00000527078 TRIM41Q8WV44 630 aa40.54■■■■■ 4.08
SLC52A2-208ENST00000527078 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.54■■■■■ 4.08
SLC52A2-208ENST00000527078 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.52■■■■■ 4.08
SLC52A2-208ENST00000527078 SYNJ1O43426 1573 aa40.51■■■■■ 4.08
SLC52A2-208ENST00000527078 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.43■■■■■ 4.06
SLC52A2-208ENST00000527078 CUX1P39880 1505 aa40.42■■■■■ 4.06
SLC52A2-208ENST00000527078 TOP2BQ02880 1626 aa40.31■■■■■ 4.04
SLC52A2-208ENST00000527078 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.3■■■■■ 4.04
SLC52A2-208ENST00000527078 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
SLC52A2-208ENST00000527078 ERCC6Q03468 1493 aa40.2■■■■■ 4.03
SLC52A2-208ENST00000527078 TOPBP1Q92547 1522 aa40.17■■■■■ 4.02
SLC52A2-208ENST00000527078 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.17■■■■■ 4.02
SLC52A2-208ENST00000527078 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.1■■■■■ 4.01
SLC52A2-208ENST00000527078 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.04■■■■■ 4
SLC52A2-208ENST00000527078 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.01■■■■□ 3.99
SLC52A2-208ENST00000527078 SOGA1O94964 1423 aa39.94■■■■□ 3.98
SLC52A2-208ENST00000527078 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.94■■■■□ 3.98
SLC52A2-208ENST00000527078 WDR62O43379 1518 aa39.93■■■■□ 3.98
SLC52A2-208ENST00000527078 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.9■■■■□ 3.98
SLC52A2-208ENST00000527078 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.89■■■■□ 3.98
SLC52A2-208ENST00000527078 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.86■■■■□ 3.97
SLC52A2-208ENST00000527078 CUX2O14529 1486 aa39.72■■■■□ 3.95
SLC52A2-208ENST00000527078 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.64■■■■□ 3.94
SLC52A2-208ENST00000527078 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.63■■■■□ 3.93
SLC52A2-208ENST00000527078 WDR97A6NE52 1622 aa39.63■■■■□ 3.93
SLC52A2-208ENST00000527078 KIF27Q86VH2 1401 aa39.55■■■■□ 3.92
SLC52A2-208ENST00000527078 EEA1Q15075 1411 aa39.53■■■■□ 3.92
SLC52A2-208ENST00000527078 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.48■■■■□ 3.91
SLC52A2-208ENST00000527078 IFT140Q96RY7 1462 aa39.48■■■■□ 3.91
SLC52A2-208ENST00000527078 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.48■■■■□ 3.91
SLC52A2-208ENST00000527078 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.47■■■■□ 3.91
SLC52A2-208ENST00000527078 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.44■■■■□ 3.9
SLC52A2-208ENST00000527078 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.43■■■■□ 3.9
SLC52A2-208ENST00000527078 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.4■■■■□ 3.9
SLC52A2-208ENST00000527078 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.35■■■■□ 3.89
SLC52A2-208ENST00000527078 IGF1RP08069 1367 aa39.32■■■■□ 3.89
SLC52A2-208ENST00000527078 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.31■■■■□ 3.88
SLC52A2-208ENST00000527078 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.23■■■■□ 3.87
SLC52A2-208ENST00000527078 PBRM1Q86U86 1689 aa39.19■■■■□ 3.86
SLC52A2-208ENST00000527078 PRXQ9BXM0 1461 aa39.18■■■■□ 3.86
SLC52A2-208ENST00000527078 KIF21BO75037 1637 aa39.16■■■■□ 3.86
SLC52A2-208ENST00000527078 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.15■■■■□ 3.86
SLC52A2-208ENST00000527078 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.13■■■■□ 3.85
SLC52A2-208ENST00000527078 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.09■■■■□ 3.85
SLC52A2-208ENST00000527078 GRIN2BQ13224 1484 aa39.07■■■■□ 3.84
SLC52A2-208ENST00000527078 GOLGA3Q08378 1498 aa39.05■■■■□ 3.84
SLC52A2-208ENST00000527078 CUL7Q14999 1698 aa39.02■■■■□ 3.84
SLC52A2-208ENST00000527078 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.96■■■■□ 3.83
SLC52A2-208ENST00000527078 ADAMTS12P58397 1594 aa38.93■■■■□ 3.82
SLC52A2-208ENST00000527078 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38.92■■■■□ 3.82
SLC52A2-208ENST00000527078 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.84■■■■□ 3.81
SLC52A2-208ENST00000527078 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.81■■■■□ 3.8
SLC52A2-208ENST00000527078 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.79■■■■□ 3.8
SLC52A2-208ENST00000527078 SYNJ2O15056 1496 aa38.67■■■■□ 3.78
SLC52A2-208ENST00000527078 GRIN2AQ12879 1464 aa38.63■■■■□ 3.78
SLC52A2-208ENST00000527078 FBLN2P98095 1184 aa38.61■■■■□ 3.77
SLC52A2-208ENST00000527078 CEP162Q5TB80 1403 aa38.61■■■■□ 3.77
SLC52A2-208ENST00000527078 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP38.59■■■■□ 3.77
SLC52A2-208ENST00000527078 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.59■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms