RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527078.5

SLC52A2-208, Transcript of solute carrier family 52 member 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SLC52A2, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2-208ENST00000527078 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.85■■■■■ 6.53
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SLC52A2-208ENST00000527078 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.8■■■■■ 5.08
SLC52A2-208ENST00000527078 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.34■■■■■ 5.01
SLC52A2-208ENST00000527078 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.09■■■■■ 4.97
SLC52A2-208ENST00000527078 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.74■■■■■ 4.91
SLC52A2-208ENST00000527078 NACADO15069 1562 aa45.69■■■■■ 4.91
SLC52A2-208ENST00000527078 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.46■■■■■ 4.87
SLC52A2-208ENST00000527078 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.25■■■■■ 4.83
SLC52A2-208ENST00000527078 SCRIBQ14160 1630 aa45.03■■■■■ 4.8
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SLC52A2-208ENST00000527078 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.23■■■■■ 4.67
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SLC52A2-208ENST00000527078 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.54■■■■■ 4.56
SLC52A2-208ENST00000527078 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.19■■■■■ 4.51
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SLC52A2-208ENST00000527078 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.12■■■■■ 4.49
SLC52A2-208ENST00000527078 SMARCA4P51532 1647 aa43.08■■■■■ 4.49
SLC52A2-208ENST00000527078 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.9■■■■■ 4.46
SLC52A2-208ENST00000527078 WIZO95785 1651 aa42.83■■■■■ 4.45
SLC52A2-208ENST00000527078 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.54■■■■■ 4.4
SLC52A2-208ENST00000527078 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.51■■■■■ 4.4
SLC52A2-208ENST00000527078 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.44■■■■■ 4.38
SLC52A2-208ENST00000527078 SMARCA2P51531 1590 aa42.4■■■■■ 4.38
SLC52A2-208ENST00000527078 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.28■■■■■ 4.36
SLC52A2-208ENST00000527078 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.21■■■■■ 4.35
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SLC52A2-208ENST00000527078 HMGXB3Q12766 1538 aa42.09■■■■■ 4.33
SLC52A2-208ENST00000527078 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.03■■■■■ 4.32
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SLC52A2-208ENST00000527078 PRDM2Q13029 1718 aa40.89■■■■■ 4.14
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SLC52A2-208ENST00000527078 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.86■■■■■ 4.13
SLC52A2-208ENST00000527078 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.66■■■■■ 4.1
SLC52A2-208ENST00000527078 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.56■■■■■ 4.08
SLC52A2-208ENST00000527078 TRIM41Q8WV44 630 aa40.54■■■■■ 4.08
SLC52A2-208ENST00000527078 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.54■■■■■ 4.08
SLC52A2-208ENST00000527078 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.52■■■■■ 4.08
SLC52A2-208ENST00000527078 SYNJ1O43426 1573 aa40.51■■■■■ 4.08
SLC52A2-208ENST00000527078 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.43■■■■■ 4.06
SLC52A2-208ENST00000527078 CUX1P39880 1505 aa40.42■■■■■ 4.06
SLC52A2-208ENST00000527078 TOP2BQ02880 1626 aa40.31■■■■■ 4.04
SLC52A2-208ENST00000527078 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.3■■■■■ 4.04
SLC52A2-208ENST00000527078 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
SLC52A2-208ENST00000527078 ERCC6Q03468 1493 aa40.2■■■■■ 4.03
SLC52A2-208ENST00000527078 TOPBP1Q92547 1522 aa40.17■■■■■ 4.02
SLC52A2-208ENST00000527078 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.17■■■■■ 4.02
SLC52A2-208ENST00000527078 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.1■■■■■ 4.01
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SLC52A2-208ENST00000527078 CUX2O14529 1486 aa39.72■■■■□ 3.95
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SLC52A2-208ENST00000527078 WDR97A6NE52 1622 aa39.63■■■■□ 3.93
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SLC52A2-208ENST00000527078 EEA1Q15075 1411 aa39.53■■■■□ 3.92
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SLC52A2-208ENST00000527078 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.47■■■■□ 3.91
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SLC52A2-208ENST00000527078 PBRM1Q86U86 1689 aa39.19■■■■□ 3.86
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SLC52A2-208ENST00000527078 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.96■■■■□ 3.83
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SLC52A2-208ENST00000527078 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.81■■■■□ 3.8
SLC52A2-208ENST00000527078 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.79■■■■□ 3.8
SLC52A2-208ENST00000527078 SYNJ2O15056 1496 aa38.67■■■■□ 3.78
SLC52A2-208ENST00000527078 GRIN2AQ12879 1464 aa38.63■■■■□ 3.78
SLC52A2-208ENST00000527078 FBLN2P98095 1184 aa38.61■■■■□ 3.77
SLC52A2-208ENST00000527078 CEP162Q5TB80 1403 aa38.61■■■■□ 3.77
SLC52A2-208ENST00000527078 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP38.59■■■■□ 3.77
SLC52A2-208ENST00000527078 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.59■■■■□ 3.77
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