Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 ABCC5-213ENST00000492216 954 ntTSL 510.51□□□□□ -0.733e-16■■■■■ 60.7
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PRPF8Q6P2Q9 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.753e-16■■■■■ 60.7
PRPF8Q6P2Q9 TMEM68-215ENST00000523180 510 ntTSL 29.95□□□□□ -0.823e-16■■■■■ 60.7
PRPF8Q6P2Q9 PHYH-207ENST00000479604 642 ntTSL 39.61□□□□□ -0.873e-16■■■■■ 60.7
PRPF8Q6P2Q9 CCDC66-206ENST00000434467 2413 ntTSL 29.6□□□□□ -0.873e-16■■■■■ 60.7
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PRPF8Q6P2Q9 YTHDC2-201ENST00000161863 6316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.932e-6■■■■■ 59.8
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PRPF8Q6P2Q9 RC3H1-205ENST00000484867 368 ntTSL 31.11□□□□□ -2.232e-9■■■■■ 59.7
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PRPF8Q6P2Q9 GLOD4-207ENST00000574354 558 ntTSL 47.8□□□□□ -1.162e-12■■■■■ 59.7
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PRPF8Q6P2Q9 GAS5-206ENST00000422183 745 ntTSL 25.05□□□□□ -1.64e-22■■■■■ 59.6
PRPF8Q6P2Q9 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.624e-22■■■■■ 59.6
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