RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517557.5

PTDSS1-203, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene PTDSS1, Length 757 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-203ENST00000517557 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.97■■■■■ 6.71
PTDSS1-203ENST00000517557 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.15■■■■■ 5.78
PTDSS1-203ENST00000517557 ABCC9O60706 1549 aa51.05■■■■■ 5.76
PTDSS1-203ENST00000517557 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.64■■■■■ 5.38
PTDSS1-203ENST00000517557 NACADO15069 1562 aa48.32■■■■■ 5.33
PTDSS1-203ENST00000517557 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.02■■■■■ 5.28
PTDSS1-203ENST00000517557 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.82■■■■■ 5.25
PTDSS1-203ENST00000517557 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.66■■■■■ 5.22
PTDSS1-203ENST00000517557 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.61■■■■■ 5.21
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PTDSS1-203ENST00000517557 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.23■■■■■ 5.15
PTDSS1-203ENST00000517557 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.07■■■■■ 5.13
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PTDSS1-203ENST00000517557 SCRIBQ14160 1630 aa46.58■■■■■ 5.05
PTDSS1-203ENST00000517557 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.15■■■■■ 4.98
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PTDSS1-203ENST00000517557 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.99■■■■■ 4.95
PTDSS1-203ENST00000517557 NCAPD3P42695 1498 aa44.59■■■■■ 4.73
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PTDSS1-203ENST00000517557 SMARCA4P51532 1647 aa44.46■■■■■ 4.71
PTDSS1-203ENST00000517557 SMARCA2P51531 1590 aa44.35■■■■■ 4.69
PTDSS1-203ENST00000517557 HMGXB3Q12766 1538 aa44.28■■■■■ 4.68
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PTDSS1-203ENST00000517557 ERCC6Q03468 1493 aa44.07■■■■■ 4.65
PTDSS1-203ENST00000517557 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.03■■■■■ 4.64
PTDSS1-203ENST00000517557 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.02■■■■■ 4.64
PTDSS1-203ENST00000517557 CUX2O14529 1486 aa43.99■■■■■ 4.63
PTDSS1-203ENST00000517557 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.9■■■■■ 4.62
PTDSS1-203ENST00000517557 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.88■■■■■ 4.62
PTDSS1-203ENST00000517557 NESP48681 1621 aa43.88■■■■■ 4.61
PTDSS1-203ENST00000517557 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.59■■■■■ 4.57
PTDSS1-203ENST00000517557 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.46■■■■■ 4.55
PTDSS1-203ENST00000517557 WIZO95785 1651 aa43.4■■■■■ 4.54
PTDSS1-203ENST00000517557 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.36■■■■■ 4.53
PTDSS1-203ENST00000517557 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.31■■■■■ 4.52
PTDSS1-203ENST00000517557 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.22■■■■■ 4.51
PTDSS1-203ENST00000517557 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.99■■■■■ 4.47
PTDSS1-203ENST00000517557 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.95■■■■■ 4.47
PTDSS1-203ENST00000517557 WDR62O43379 1518 aa42.86■■■■■ 4.45
PTDSS1-203ENST00000517557 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.84■■■■■ 4.45
PTDSS1-203ENST00000517557 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.79■■■■■ 4.44
PTDSS1-203ENST00000517557 CFTRP13569 1480 aa42.75■■■■■ 4.43
PTDSS1-203ENST00000517557 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.74■■■■■ 4.43
PTDSS1-203ENST00000517557 PRDM2Q13029 1718 aa42.42■■■■■ 4.38
PTDSS1-203ENST00000517557 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.4■■■■■ 4.38
PTDSS1-203ENST00000517557 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.34■■■■■ 4.37
PTDSS1-203ENST00000517557 TRIM41Q8WV44 630 aa41.97■■■■■ 4.31
PTDSS1-203ENST00000517557 OSCARQ8IYS5 282 aa41.96■■■■■ 4.31
PTDSS1-203ENST00000517557 TOPBP1Q92547 1522 aa41.95■■■■■ 4.31
PTDSS1-203ENST00000517557 IFT140Q96RY7 1462 aa41.92■■■■■ 4.3
PTDSS1-203ENST00000517557 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.86■■■■■ 4.29
PTDSS1-203ENST00000517557 ABCC8Q09428 1581 aa41.86■■■■■ 4.29
PTDSS1-203ENST00000517557 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.81■■■■■ 4.28
PTDSS1-203ENST00000517557 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.66■■■■■ 4.26
PTDSS1-203ENST00000517557 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
PTDSS1-203ENST00000517557 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
PTDSS1-203ENST00000517557 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.48■■■■■ 4.23
PTDSS1-203ENST00000517557 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.46■■■■■ 4.23
PTDSS1-203ENST00000517557 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.46■■■■■ 4.23
PTDSS1-203ENST00000517557 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.46■■■■■ 4.23
PTDSS1-203ENST00000517557 CHD1O14646 1710 aa41.37■■■■■ 4.21
PTDSS1-203ENST00000517557 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.36■■■■■ 4.21
PTDSS1-203ENST00000517557 SOGA1O94964 1423 aa41.32■■■■■ 4.21
PTDSS1-203ENST00000517557 ARHGEF11O15085 1522 aa41.32■■■■■ 4.2
PTDSS1-203ENST00000517557 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.27■■■■■ 4.2
PTDSS1-203ENST00000517557 CUX1P39880 1505 aa41.25■■■■■ 4.19
PTDSS1-203ENST00000517557 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
PTDSS1-203ENST00000517557 WDR97A6NE52 1622 aa41.18■■■■■ 4.18
PTDSS1-203ENST00000517557 FBLN2P98095 1184 aa41.17■■■■■ 4.18
PTDSS1-203ENST00000517557 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.09■■■■■ 4.17
PTDSS1-203ENST00000517557 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.07■■■■■ 4.16
PTDSS1-203ENST00000517557 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.97■■■■■ 4.15
PTDSS1-203ENST00000517557 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.97■■■■■ 4.15
PTDSS1-203ENST00000517557 GRIN2BQ13224 1484 aa40.96■■■■■ 4.15
PTDSS1-203ENST00000517557 ARAP1Q96P48 1450 aa40.91■■■■■ 4.14
PTDSS1-203ENST00000517557 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.88■■■■■ 4.13
PTDSS1-203ENST00000517557 PBRM1Q86U86 1689 aa40.86■■■■■ 4.13
PTDSS1-203ENST00000517557 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.86■■■■■ 4.13
PTDSS1-203ENST00000517557 SYNJ1O43426 1573 aa40.84■■■■■ 4.13
PTDSS1-203ENST00000517557 SYNJ2O15056 1496 aa40.83■■■■■ 4.13
PTDSS1-203ENST00000517557 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.83■■■■■ 4.13
PTDSS1-203ENST00000517557 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.81■■■■■ 4.12
PTDSS1-203ENST00000517557 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.77■■■■■ 4.12
PTDSS1-203ENST00000517557 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.63■■■■■ 4.09
PTDSS1-203ENST00000517557 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.63■■■■■ 4.09
PTDSS1-203ENST00000517557 TOP2BQ02880 1626 aa40.61■■■■■ 4.09
PTDSS1-203ENST00000517557 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
PTDSS1-203ENST00000517557 ADAMTS12P58397 1594 aa40.45■■■■■ 4.07
PTDSS1-203ENST00000517557 GRIN2AQ12879 1464 aa40.45■■■■■ 4.07
PTDSS1-203ENST00000517557 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.31■■■■■ 4.04
PTDSS1-203ENST00000517557 NUP160Q12769 1436 aa40.31■■■■■ 4.04
PTDSS1-203ENST00000517557 CEP170Q5SW79 1584 aa40.31■■■■■ 4.04
PTDSS1-203ENST00000517557 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.3■■■■■ 4.04
PTDSS1-203ENST00000517557 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.23■■■■■ 4.03
PTDSS1-203ENST00000517557 SHROOM2Q13796 1616 aa40.15■■■■■ 4.02
PTDSS1-203ENST00000517557 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.9■■■■□ 3.98
PTDSS1-203ENST00000517557 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.88■■■■□ 3.97
PTDSS1-203ENST00000517557 JPH4Q96JJ6 628 aa39.86■■■■□ 3.97
PTDSS1-203ENST00000517557 KIF27Q86VH2 1401 aa39.79■■■■□ 3.96
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