Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 CDK5RAP2-206ENST00000433194 815 ntTSL 310.47□□□□□ -0.731e-7■■■□□ 17.4
RBM22Q9NW64 CDK5RAP2-213ENST00000480467 931 ntTSL 310.45□□□□□ -0.741e-7■■■□□ 17.4
RBM22Q9NW64 CDK5RAP2-205ENST00000425647 2747 ntTSL 29.53□□□□□ -0.881e-7■■■□□ 17.4
RBM22Q9NW64 CDK5RAP2-210ENST00000474262 549 ntTSL 28.88□□□□□ -0.991e-7■■■□□ 17.4
RBM22Q9NW64 RBM28-206ENST00000487602 715 ntTSL 58.17□□□□□ -1.16e-6■■■□□ 17.4
RBM22Q9NW64 ITCH-204ENST00000479215 205 ntTSL 38.7□□□□□ -1.025e-6■■■□□ 17.3
RBM22Q9NW64 ITCH-206ENST00000486883 703 ntTSL 25.13□□□□□ -1.595e-6■■■□□ 17.3
RBM22Q9NW64 SRRM2-222ENST00000575009 1146 ntTSL 526.34■■□□□ 1.812e-8■■■□□ 17.3
RBM22Q9NW64 SRRM2-229ENST00000576894 2210 ntTSL 1 (best)20.93■□□□□ 0.942e-8■■■□□ 17.3
RBM22Q9NW64 SRRM2-230ENST00000576924 3314 ntTSL 1 (best)17.13■□□□□ 0.332e-8■■■□□ 17.3
RBM22Q9NW64 SRRM2-208ENST00000571378 2870 ntTSL 1 (best)14.88□□□□□ -0.032e-8■■■□□ 17.3
RBM22Q9NW64 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.062e-6■■■□□ 17.2
RBM22Q9NW64 TBC1D8-201ENST00000376840 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.372e-6■■■□□ 17.2
RBM22Q9NW64 ABCD4-217ENST00000496015 1248 ntTSL 513.65□□□□□ -0.222e-6■■■□□ 17.2
RBM22Q9NW64 POLR3E-211ENST00000564750 2327 ntTSL 217.67■□□□□ 0.427e-7■■■□□ 17.2
RBM22Q9NW64 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.472e-7■■■□□ 17.2
RBM22Q9NW64 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.22e-7■■■□□ 17.2
RBM22Q9NW64 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.165e-10■■■□□ 17.2
RBM22Q9NW64 SRRM2-215ENST00000573498 994 ntTSL 35□□□□□ -1.615e-10■■■□□ 17.2
RBM22Q9NW64 RCL1-209ENST00000473230 441 ntTSL 37.07□□□□□ -1.283e-6■■■□□ 17.2
RBM22Q9NW64 SLC2A9-206ENST00000505104 1659 ntTSL 1 (best)17.55■□□□□ 0.43e-7■■■□□ 17.2
RBM22Q9NW64 NKTR-209ENST00000465584 3839 ntTSL 22.36□□□□□ -2.031e-8■■■□□ 17.2
RBM22Q9NW64 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.321e-9■■■□□ 17.2
RBM22Q9NW64 ENO1-206ENST00000497492 647 ntTSL 212.43□□□□□ -0.421e-9■■■□□ 17.2
RBM22Q9NW64 IPO4-220ENST00000561462 1864 ntTSL 216.72■□□□□ 0.273e-6■■■□□ 17.2
RBM22Q9NW64 TCF25-207ENST00000562256 1879 ntTSL 1 (best)18.48■□□□□ 0.555e-7■■■□□ 17.2
RBM22Q9NW64 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.175e-7■■■□□ 17.2
RBM22Q9NW64 TCF25-226ENST00000640279 2688 ntTSL 515.94■□□□□ 0.145e-7■■■□□ 17.2
RBM22Q9NW64 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.125e-7■■■□□ 17.2
RBM22Q9NW64 HDLBP-229ENST00000460826 442 ntTSL 214.18□□□□□ -0.145e-8■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 ABHD5-201ENST00000013894 833 ntTSL 318.85■□□□□ 0.613e-7■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 HDAC4-216ENST00000544989 342 ntTSL 511.87□□□□□ -0.511e-6■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 NEPRO-218ENST00000489848 1576 ntTSL 216.02■□□□□ 0.162e-8■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 NEPRO-209ENST00000470663 545 ntTSL 415.48■□□□□ 0.072e-8■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 NEPRO-203ENST00000460410 947 ntTSL 314.84□□□□□ -0.032e-8■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 NEPRO-220ENST00000494164 741 ntTSL 414.84□□□□□ -0.032e-8■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 SLC17A9-205ENST00000483113 1624 ntTSL 314.79□□□□□ -0.041e-14■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 NEPRO-211ENST00000472637 2179 ntTSL 1 (best)14.64□□□□□ -0.072e-8■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 NEPRO-219ENST00000491121 578 ntTSL 414.13□□□□□ -0.152e-8■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 NEPRO-205ENST00000462295 1382 ntTSL 213.35□□□□□ -0.272e-8■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 NEPRO-214ENST00000473284 2056 ntTSL 213.21□□□□□ -0.292e-8■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 NEPRO-207ENST00000469169 1817 ntTSL 212.63□□□□□ -0.392e-8■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 NEPRO-208ENST00000469809 1512 ntTSL 312.49□□□□□ -0.412e-8■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 NEPRO-201ENST00000314400 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.452e-8■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 NEPRO-217ENST00000486271 2842 ntTSL 211.87□□□□□ -0.512e-8■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 NEPRO-204ENST00000461381 1048 ntTSL 210.94□□□□□ -0.662e-8■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 NEPRO-221ENST00000494575 556 ntTSL 410.94□□□□□ -0.662e-8■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 NEPRO-224ENST00000496340 520 ntTSL 410.94□□□□□ -0.662e-8■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 NEPRO-222ENST00000494891 547 ntTSL 410.29□□□□□ -0.762e-8■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 NEPRO-202ENST00000383675 4672 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.812e-8■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 NEPRO-223ENST00000496206 751 ntTSL 58.76□□□□□ -1.012e-8■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 NEPRO-212ENST00000472705 1212 ntTSL 28.63□□□□□ -1.032e-8■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.62e-6■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 PLCB1-220ENST00000630757 857 ntTSL 33.96□□□□□ -1.782e-6■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 PLCB1-229ENST00000637204 100 ntTSL 50.9□□□□□ -2.272e-6■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.391e-6■■■□□ 17.1
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RBM22Q9NW64 KANK1-206ENST00000382303 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.811e-6■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 KANK1-209ENST00000489369 7193 ntTSL 59.93□□□□□ -0.821e-6■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 KANK1-205ENST00000382297 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.951e-6■■■□□ 17.1
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RBM22Q9NW64 WDR61-215ENST00000560946 603 ntTSL 1 (best)16.98■□□□□ 0.311e-6■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.171e-6■■■□□ 17.1
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RBM22Q9NW64 WDR61-209ENST00000559848 756 ntTSL 39.72□□□□□ -0.851e-6■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 WDR61-202ENST00000558311 1266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.961e-6■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 WDR61-208ENST00000559700 948 ntTSL 28.8□□□□□ -11e-6■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 WDR61-213ENST00000560610 832 ntTSL 56.84□□□□□ -1.311e-6■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.631e-6■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 RPL10A-204ENST00000478340 962 ntTSL 218.02■□□□□ 0.485e-19■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 RPL10A-205ENST00000490335 632 ntTSL 216.13■□□□□ 0.175e-19■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 RPL10A-203ENST00000467020 1069 ntTSL 315.11■□□□□ 0.015e-19■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 RPL10A-202ENST00000464112 1063 ntTSL 1 (best)12.9□□□□□ -0.345e-19■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 RPL10A-201ENST00000322203 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.525e-19■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.771e-7■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 THOP1-208ENST00000587468 671 ntTSL 218.81■□□□□ 0.61e-7■■■□□ 17.1
RBM22Q9NW64 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.051e-9■■■□□ 17
RBM22Q9NW64 ECHDC2-225ENST00000544365 1335 ntTSL 520.59■□□□□ 0.891e-9■■■□□ 17
RBM22Q9NW64 ECHDC2-206ENST00000467988 702 ntTSL 520.48■□□□□ 0.871e-9■■■□□ 17
RBM22Q9NW64 ECHDC2-202ENST00000371520 1606 ntTSL 1 (best)20.35■□□□□ 0.851e-9■■■□□ 17
RBM22Q9NW64 ECHDC2-219ENST00000495920 456 ntTSL 319.43■□□□□ 0.71e-9■■■□□ 17
RBM22Q9NW64 ECHDC2-208ENST00000476477 1676 ntTSL 218.24■□□□□ 0.511e-9■■■□□ 17
RBM22Q9NW64 ECHDC2-204ENST00000460612 2645 ntTSL 216.93■□□□□ 0.31e-9■■■□□ 17
RBM22Q9NW64 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.11e-9■■■□□ 17
RBM22Q9NW64 ECHDC2-215ENST00000487866 940 ntTSL 515.31■□□□□ 0.041e-9■■■□□ 17
RBM22Q9NW64 ECHDC2-210ENST00000479593 766 ntTSL 514.58□□□□□ -0.081e-9■■■□□ 17
RBM22Q9NW64 ECHDC2-214ENST00000487851 471 ntTSL 313.51□□□□□ -0.251e-9■■■□□ 17
RBM22Q9NW64 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.251e-9■■■□□ 17
RBM22Q9NW64 ECHDC2-205ENST00000463923 663 ntTSL 312.4□□□□□ -0.421e-9■■■□□ 17
RBM22Q9NW64 ECHDC2-216ENST00000488268 631 ntTSL 310.89□□□□□ -0.671e-9■■■□□ 17
RBM22Q9NW64 ECHDC2-224ENST00000543419 555 ntTSL 38.19□□□□□ -1.11e-9■■■□□ 17
RBM22Q9NW64 KIAA0355-201ENST00000299505 6717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.754e-6■■■□□ 17
RBM22Q9NW64 KIAA0355-203ENST00000588338 561 ntTSL 59.82□□□□□ -0.844e-6■■■□□ 17
RBM22Q9NW64 DKC1-212ENST00000492372 406 ntTSL 28.32□□□□□ -1.082e-6■■■□□ 17
RBM22Q9NW64 NDRG1-217ENST00000521414 2349 ntTSL 213.71□□□□□ -0.212e-6■■■□□ 17
RBM22Q9NW64 ACTN4-207ENST00000495553 586 ntTSL 59.65□□□□□ -0.868e-7■■■□□ 17
RBM22Q9NW64 PTBP1-212ENST00000587136 583 ntTSL 321.25■□□□□ 0.991e-9■■■□□ 17
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