RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496015.5

ABCD4-217, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 5

Gene ABCD4, Length 1,248 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-217ENST00000496015 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.61■■■□□ 2.97
ABCD4-217ENST00000496015 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.1■■■□□ 2.41
ABCD4-217ENST00000496015 ABCC9O60706 1549 aa29.78■■■□□ 2.36
ABCD4-217ENST00000496015 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.53■■■□□ 2.16
ABCD4-217ENST00000496015 NACADO15069 1562 aa28.39■■■□□ 2.14
ABCD4-217ENST00000496015 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.32■■■□□ 2.12
ABCD4-217ENST00000496015 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.07■■■□□ 2.08
ABCD4-217ENST00000496015 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
ABCD4-217ENST00000496015 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.89■■■□□ 2.06
ABCD4-217ENST00000496015 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.87■■■□□ 2.05
ABCD4-217ENST00000496015 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.8■■■□□ 2.04
ABCD4-217ENST00000496015 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.76■■■□□ 2.03
ABCD4-217ENST00000496015 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.61■■■□□ 2.01
ABCD4-217ENST00000496015 SCRIBQ14160 1630 aa27.4■■□□□ 1.98
ABCD4-217ENST00000496015 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.34■■□□□ 1.97
ABCD4-217ENST00000496015 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.94■■□□□ 1.9
ABCD4-217ENST00000496015 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
ABCD4-217ENST00000496015 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.82■■□□□ 1.88
ABCD4-217ENST00000496015 SMARCA4P51532 1647 aa26.17■■□□□ 1.78
ABCD4-217ENST00000496015 NCAPD3P42695 1498 aa26.17■■□□□ 1.78
ABCD4-217ENST00000496015 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
ABCD4-217ENST00000496015 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.11■■□□□ 1.77
ABCD4-217ENST00000496015 SMARCA2P51531 1590 aa26.11■■□□□ 1.77
ABCD4-217ENST00000496015 HMGXB3Q12766 1538 aa26.01■■□□□ 1.75
ABCD4-217ENST00000496015 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
ABCD4-217ENST00000496015 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.91■■□□□ 1.74
ABCD4-217ENST00000496015 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.87■■□□□ 1.73
ABCD4-217ENST00000496015 ERCC6Q03468 1493 aa25.76■■□□□ 1.71
ABCD4-217ENST00000496015 CUX2O14529 1486 aa25.67■■□□□ 1.7
ABCD4-217ENST00000496015 NESP48681 1621 aa25.63■■□□□ 1.69
ABCD4-217ENST00000496015 WIZO95785 1651 aa25.6■■□□□ 1.69
ABCD4-217ENST00000496015 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.57■■□□□ 1.68
ABCD4-217ENST00000496015 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.57■■□□□ 1.68
ABCD4-217ENST00000496015 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
ABCD4-217ENST00000496015 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
ABCD4-217ENST00000496015 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.43■■□□□ 1.66
ABCD4-217ENST00000496015 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.4■■□□□ 1.66
ABCD4-217ENST00000496015 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.36■■□□□ 1.65
ABCD4-217ENST00000496015 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
ABCD4-217ENST00000496015 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.15■■□□□ 1.62
ABCD4-217ENST00000496015 CFTRP13569 1480 aa25.15■■□□□ 1.62
ABCD4-217ENST00000496015 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.13■■□□□ 1.61
ABCD4-217ENST00000496015 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.11■■□□□ 1.61
ABCD4-217ENST00000496015 WDR62O43379 1518 aa25.07■■□□□ 1.6
ABCD4-217ENST00000496015 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.01■■□□□ 1.59
ABCD4-217ENST00000496015 PRDM2Q13029 1718 aa24.99■■□□□ 1.59
ABCD4-217ENST00000496015 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
ABCD4-217ENST00000496015 ABCC8Q09428 1581 aa24.69■■□□□ 1.54
ABCD4-217ENST00000496015 TOPBP1Q92547 1522 aa24.66■■□□□ 1.54
ABCD4-217ENST00000496015 IFT140Q96RY7 1462 aa24.62■■□□□ 1.53
ABCD4-217ENST00000496015 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.6■■□□□ 1.53
ABCD4-217ENST00000496015 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
ABCD4-217ENST00000496015 OSCARQ8IYS5 282 aa24.5■■□□□ 1.51
ABCD4-217ENST00000496015 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
ABCD4-217ENST00000496015 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
ABCD4-217ENST00000496015 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
ABCD4-217ENST00000496015 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
ABCD4-217ENST00000496015 TRIM41Q8WV44 630 aa24.34■■□□□ 1.49
ABCD4-217ENST00000496015 SOGA1O94964 1423 aa24.34■■□□□ 1.49
ABCD4-217ENST00000496015 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.486e-8■■■■□ 23.4
ABCD4-217ENST00000496015 CUX1P39880 1505 aa24.3■■□□□ 1.48
ABCD4-217ENST00000496015 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.3■■□□□ 1.48
ABCD4-217ENST00000496015 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.3■■□□□ 1.48
ABCD4-217ENST00000496015 WDR97A6NE52 1622 aa24.24■■□□□ 1.47
ABCD4-217ENST00000496015 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
ABCD4-217ENST00000496015 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.23■■□□□ 1.47
ABCD4-217ENST00000496015 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.23■■□□□ 1.47
ABCD4-217ENST00000496015 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.23■■□□□ 1.47
ABCD4-217ENST00000496015 CHD1O14646 1710 aa24.2■■□□□ 1.46
ABCD4-217ENST00000496015 FBLN2P98095 1184 aa24.18■■□□□ 1.46
ABCD4-217ENST00000496015 ARHGEF11O15085 1522 aa24.11■■□□□ 1.45
ABCD4-217ENST00000496015 GRIN2BQ13224 1484 aa24.1■■□□□ 1.45
ABCD4-217ENST00000496015 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.09■■□□□ 1.45
ABCD4-217ENST00000496015 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
ABCD4-217ENST00000496015 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.05■■□□□ 1.44
ABCD4-217ENST00000496015 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
ABCD4-217ENST00000496015 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.05■■□□□ 1.44
ABCD4-217ENST00000496015 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.04■■□□□ 1.44
ABCD4-217ENST00000496015 PBRM1Q86U86 1689 aa24.03■■□□□ 1.44
ABCD4-217ENST00000496015 TOP2BQ02880 1626 aa24.02■■□□□ 1.44
ABCD4-217ENST00000496015 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.02■■□□□ 1.44
ABCD4-217ENST00000496015 SYNJ2O15056 1496 aa23.98■■□□□ 1.43
ABCD4-217ENST00000496015 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.98■■□□□ 1.43
ABCD4-217ENST00000496015 SYNJ1O43426 1573 aa23.96■■□□□ 1.43
ABCD4-217ENST00000496015 ARAP1Q96P48 1450 aa23.89■■□□□ 1.42
ABCD4-217ENST00000496015 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.89■■□□□ 1.41
ABCD4-217ENST00000496015 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.88■■□□□ 1.41
ABCD4-217ENST00000496015 ADAMTS12P58397 1594 aa23.78■■□□□ 1.4
ABCD4-217ENST00000496015 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.78■■□□□ 1.4
ABCD4-217ENST00000496015 GRIN2AQ12879 1464 aa23.77■■□□□ 1.4
ABCD4-217ENST00000496015 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.76■■□□□ 1.39
ABCD4-217ENST00000496015 NUP160Q12769 1436 aa23.66■■□□□ 1.38
ABCD4-217ENST00000496015 CEP170Q5SW79 1584 aa23.65■■□□□ 1.38
ABCD4-217ENST00000496015 KIF27Q86VH2 1401 aa23.59■■□□□ 1.37
ABCD4-217ENST00000496015 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
ABCD4-217ENST00000496015 SHROOM2Q13796 1616 aa23.54■■□□□ 1.36
ABCD4-217ENST00000496015 CUL7Q14999 1698 aa23.51■■□□□ 1.35
ABCD4-217ENST00000496015 IGF1RP08069 1367 aa23.5■■□□□ 1.35
ABCD4-217ENST00000496015 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.49■■□□□ 1.35
ABCD4-217ENST00000496015 JPH4Q96JJ6 628 aa23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms