Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 TCEA1-203ENST00000518310 569 ntTSL 433.42■■■□□ 2.944e-7■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 METTL9-203ENST00000562379 701 ntTSL 232.95■■■□□ 2.873e-7■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.863e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 TCEA1-205ENST00000519704 563 ntTSL 432.79■■■□□ 2.844e-7■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 METTL9-210ENST00000570074 447 ntTSL 331.54■■■□□ 2.643e-7■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC31.25■■■□□ 2.593e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.481e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 TCEA1-210ENST00000522397 852 ntTSL 330.37■■■□□ 2.451e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 ATG4B-221ENST00000483778 1103 ntTSL 329.11■■■□□ 2.254e-7■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 CARS-204ENST00000439280 1021 ntTSL 328.69■■■□□ 2.183e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 26e-9■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.986e-9■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.823e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.87e-12■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 ATG4B-216ENST00000475195 762 ntTSL 225.89■■□□□ 1.744e-7■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 ATG4B-201ENST00000344376 1566 ntTSL 525.35■■□□□ 1.651e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.643e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 ATG4B-203ENST00000400772 625 ntTSL 425.25■■□□□ 1.634e-7■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 ATG4B-202ENST00000400771 663 ntTSL 524.52■■□□□ 1.521e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 ATG4B-209ENST00000425239 807 ntTSL 224.41■■□□□ 1.54e-7■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 ATG4B-225ENST00000494465 2365 ntTSL 524.01■■□□□ 1.431e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 ATG4B-215ENST00000468018 721 ntTSL 523.97■■□□□ 1.434e-7■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.41e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.361e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 ATG4B-223ENST00000493618 899 ntTSL 523.49■■□□□ 1.354e-7■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.335e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 ATG4B-214ENST00000465399 581 ntTSL 222.92■■□□□ 1.264e-7■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 ATG4B-218ENST00000479554 556 ntTSL 422.89■■□□□ 1.254e-7■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 SGSM3-204ENST00000457767 1086 ntTSL 222.86■■□□□ 1.253e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.243e-7■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.228e-7■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.123e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.057e-12■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 ATG4B-220ENST00000482507 2414 ntTSL 1 (best)20.87■□□□□ 0.931e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.93e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 KLHDC4-224ENST00000568502 546 ntTSL 420.47■□□□□ 0.873e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.871e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.841e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 TCEA1-207ENST00000521086 2966 ntTSL 1 (best)20.18■□□□□ 0.821e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.753e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 ATG4B-208ENST00000419606 553 ntTSL 419.64■□□□□ 0.734e-7■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.723e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.693e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.583e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 ATG4B-207ENST00000415107 356 ntTSL 518.37■□□□□ 0.534e-7■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 KLHDC4-206ENST00000561825 562 ntTSL 517.92■□□□□ 0.463e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 CCT5-203ENST00000503026 1933 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.446e-9■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 HERC1-214ENST00000561400 2215 ntTSL 217.72■□□□□ 0.433e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 CARS-202ENST00000380525 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.433e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 AL022238.4-201ENST00000639722 4563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.383e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.343e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.333e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 SGSM3-213ENST00000485962 2973 ntTSL 516.63■□□□□ 0.253e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 ATG4B-212ENST00000430617 623 ntTSL 316.61■□□□□ 0.254e-7■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 SERP1-203ENST00000479209 3934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.193e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 CARS-201ENST00000278224 2491 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.173e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 SNX8-207ENST00000479689 560 ntTSL 215.39■□□□□ 0.053e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 CARS-215ENST00000531387 2805 ntTSL 214.8□□□□□ -0.043e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 ARHGAP19-203ENST00000371027 2301 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.073e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 CCT5-202ENST00000423695 1232 ntTSL 214.41□□□□□ -0.16e-9■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 CARS-212ENST00000526890 5732 ntTSL 214.33□□□□□ -0.113e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 TCEA1-206ENST00000520534 635 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.134e-7■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 TCEA1-204ENST00000518784 586 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.194e-7■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 CCT5-213ENST00000515390 1728 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.316e-9■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 CCT5-207ENST00000509846 546 ntTSL 212.09□□□□□ -0.476e-9■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 CCT5-201ENST00000280326 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.556e-9■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 AC139491.2-201ENST00000515403 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.623e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 CCT5-211ENST00000512975 578 ntTSL 49.84□□□□□ -0.836e-9■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.93e-7■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.983e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 AC139491.2-202ENST00000503307 962 ntTSL 28.54□□□□□ -1.043e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 METTL9-207ENST00000567404 763 ntTSL 36.73□□□□□ -1.333e-7■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.443e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 EIF3E-212ENST00000521614 1990 ntTSL 24.43□□□□□ -1.77e-12■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 BRD2-204ENST00000449025 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)16.85■□□□□ 0.299e-11■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 BRD2-205ENST00000449085 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.299e-11■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 RGS12-211ENST00000506998 1625 ntTSL 1 (best)30.42■■■□□ 2.463e-8■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC9.38□□□□□ -0.916e-7■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 DMXL2-201ENST00000251076 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.372e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.42e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.482e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 TUSC3-210ENST00000510836 1452 ntTSL 539.27■■■■□ 3.882e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 TUSC3-213ENST00000515859 1627 ntTSL 537.37■■■■□ 3.572e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.932e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.792e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.862e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.712e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 TUSC3-212ENST00000511783 1203 ntTSL 59.7□□□□□ -0.862e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 TUSC3-207ENST00000508446 457 ntTSL 35.1□□□□□ -1.592e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 HNRNPF-206ENST00000498176 715 ntTSL 1 (best)34.92■■■■□ 3.187e-15■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 HNRNPF-205ENST00000477108 636 ntTSL 1 (best)24.13■■□□□ 1.457e-15■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.167e-15■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.087e-15■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 HNRNPF-202ENST00000356053 2670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.347e-15■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 HNRNPF-207ENST00000544000 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.347e-15■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 HNRNPF-203ENST00000357065 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.037e-15■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 GOLGA3-205ENST00000537317 298 ntTSL 324.45■■□□□ 1.55e-8■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 CHFR-219ENST00000541341 581 ntTSL 315.35■□□□□ 0.055e-8■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 SON-215ENST00000475072 658 ntTSL 216.65■□□□□ 0.261e-6■■■■□ 21.8
HNRNPMP52272 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.111e-6■■■■□ 21.8
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 325.5 ms