RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483778.5

ATG4B-221, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 3

Gene ATG4B, Length 1,103 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-221ENST00000483778 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.11■■■■■ 4.81
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ATG4B-221ENST00000483778 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.34■■■■■ 4.05
ATG4B-221ENST00000483778 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.35■■■■□ 3.73
ATG4B-221ENST00000483778 NACADO15069 1562 aa38.11■■■■□ 3.69
ATG4B-221ENST00000483778 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.11■■■■□ 3.69
ATG4B-221ENST00000483778 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.89■■■■□ 3.66
ATG4B-221ENST00000483778 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.68■■■■□ 3.62
ATG4B-221ENST00000483778 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.66■■■■□ 3.62
ATG4B-221ENST00000483778 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.57■■■■□ 3.61
ATG4B-221ENST00000483778 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.37■■■■□ 3.57
ATG4B-221ENST00000483778 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.37■■■■□ 3.57
ATG4B-221ENST00000483778 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.17■■■■□ 3.54
ATG4B-221ENST00000483778 SCRIBQ14160 1630 aa36.88■■■■□ 3.49
ATG4B-221ENST00000483778 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.6■■■■□ 3.45
ATG4B-221ENST00000483778 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.44■■■■□ 3.42
ATG4B-221ENST00000483778 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
ATG4B-221ENST00000483778 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.27■■■■□ 3.4
ATG4B-221ENST00000483778 NCAPD3P42695 1498 aa35.22■■■■□ 3.23
ATG4B-221ENST00000483778 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.16■■■■□ 3.22
ATG4B-221ENST00000483778 SMARCA4P51532 1647 aa35.16■■■■□ 3.22
ATG4B-221ENST00000483778 SMARCA2P51531 1590 aa34.99■■■■□ 3.19
ATG4B-221ENST00000483778 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.94■■■■□ 3.18
ATG4B-221ENST00000483778 HMGXB3Q12766 1538 aa34.92■■■■□ 3.18
ATG4B-221ENST00000483778 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.83■■■■□ 3.17
ATG4B-221ENST00000483778 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.78■■■■□ 3.16
ATG4B-221ENST00000483778 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.76■■■■□ 3.16
ATG4B-221ENST00000483778 NESP48681 1621 aa34.75■■■■□ 3.15
ATG4B-221ENST00000483778 ERCC6Q03468 1493 aa34.72■■■■□ 3.15
ATG4B-221ENST00000483778 CUX2O14529 1486 aa34.58■■■■□ 3.13
ATG4B-221ENST00000483778 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.55■■■■□ 3.12
ATG4B-221ENST00000483778 WIZO95785 1651 aa34.44■■■■□ 3.1
ATG4B-221ENST00000483778 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.37■■■■□ 3.09
ATG4B-221ENST00000483778 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.28■■■■□ 3.08
ATG4B-221ENST00000483778 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
ATG4B-221ENST00000483778 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.16■■■■□ 3.06
ATG4B-221ENST00000483778 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.15■■■■□ 3.06
ATG4B-221ENST00000483778 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
ATG4B-221ENST00000483778 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.89■■■■□ 3.02
ATG4B-221ENST00000483778 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.88■■■■□ 3.01
ATG4B-221ENST00000483778 CFTRP13569 1480 aa33.8■■■■□ 3
ATG4B-221ENST00000483778 WDR62O43379 1518 aa33.79■■■■□ 3
ATG4B-221ENST00000483778 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.78■■■■□ 3
ATG4B-221ENST00000483778 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.76■■■■□ 3
ATG4B-221ENST00000483778 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.59■■■□□ 2.97
ATG4B-221ENST00000483778 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.55■■■□□ 2.96
ATG4B-221ENST00000483778 PRDM2Q13029 1718 aa33.5■■■□□ 2.95
ATG4B-221ENST00000483778 TOPBP1Q92547 1522 aa33.18■■■□□ 2.9
ATG4B-221ENST00000483778 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.14■■■□□ 2.9
ATG4B-221ENST00000483778 TRIM41Q8WV44 630 aa33.12■■■□□ 2.89
ATG4B-221ENST00000483778 OSCARQ8IYS5 282 aa33.11■■■□□ 2.89
ATG4B-221ENST00000483778 IFT140Q96RY7 1462 aa33.07■■■□□ 2.88
ATG4B-221ENST00000483778 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.02■■■□□ 2.88
ATG4B-221ENST00000483778 ABCC8Q09428 1581 aa33■■■□□ 2.87
ATG4B-221ENST00000483778 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.9■■■□□ 2.86
ATG4B-221ENST00000483778 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.88■■■□□ 2.85
ATG4B-221ENST00000483778 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.86■■■□□ 2.852e-11■■■□□ 18.5
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ATG4B-221ENST00000483778 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.79■■■□□ 2.84
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ATG4B-221ENST00000483778 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.71■■■□□ 2.83
ATG4B-221ENST00000483778 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.71■■■□□ 2.83
ATG4B-221ENST00000483778 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.71■■■□□ 2.83
ATG4B-221ENST00000483778 SOGA1O94964 1423 aa32.7■■■□□ 2.83
ATG4B-221ENST00000483778 CHD1O14646 1710 aa32.7■■■□□ 2.83
ATG4B-221ENST00000483778 CUX1P39880 1505 aa32.7■■■□□ 2.83
ATG4B-221ENST00000483778 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.68■■■□□ 2.82
ATG4B-221ENST00000483778 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.66■■■□□ 2.82
ATG4B-221ENST00000483778 FBLN2P98095 1184 aa32.59■■■□□ 2.81
ATG4B-221ENST00000483778 ARHGEF11O15085 1522 aa32.57■■■□□ 2.8
ATG4B-221ENST00000483778 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.46■■■□□ 2.79
ATG4B-221ENST00000483778 WDR97A6NE52 1622 aa32.43■■■□□ 2.78
ATG4B-221ENST00000483778 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.4■■■□□ 2.78
ATG4B-221ENST00000483778 GRIN2BQ13224 1484 aa32.35■■■□□ 2.77
ATG4B-221ENST00000483778 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.32■■■□□ 2.76
ATG4B-221ENST00000483778 PBRM1Q86U86 1689 aa32.31■■■□□ 2.76
ATG4B-221ENST00000483778 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.3■■■□□ 2.76
ATG4B-221ENST00000483778 ARAP1Q96P48 1450 aa32.29■■■□□ 2.76
ATG4B-221ENST00000483778 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.29■■■□□ 2.76
ATG4B-221ENST00000483778 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.26■■■□□ 2.75
ATG4B-221ENST00000483778 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.26■■■□□ 2.75
ATG4B-221ENST00000483778 SYNJ2O15056 1496 aa32.23■■■□□ 2.75
ATG4B-221ENST00000483778 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.22■■■□□ 2.75
ATG4B-221ENST00000483778 SYNJ1O43426 1573 aa32.18■■■□□ 2.74
ATG4B-221ENST00000483778 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.16■■■□□ 2.74
ATG4B-221ENST00000483778 TOP2BQ02880 1626 aa32.15■■■□□ 2.74
ATG4B-221ENST00000483778 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.14■■■□□ 2.74
ATG4B-221ENST00000483778 ADAMTS12P58397 1594 aa31.95■■■□□ 2.71
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ATG4B-221ENST00000483778 GRIN2AQ12879 1464 aa31.95■■■□□ 2.7
ATG4B-221ENST00000483778 CEP170Q5SW79 1584 aa31.89■■■□□ 2.7
ATG4B-221ENST00000483778 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.88■■■□□ 2.69
ATG4B-221ENST00000483778 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.84■■■□□ 2.69
ATG4B-221ENST00000483778 NUP160Q12769 1436 aa31.83■■■□□ 2.69
ATG4B-221ENST00000483778 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.83■■■□□ 2.69
ATG4B-221ENST00000483778 SHROOM2Q13796 1616 aa31.71■■■□□ 2.67
ATG4B-221ENST00000483778 JPH4Q96JJ6 628 aa31.58■■■□□ 2.65
ATG4B-221ENST00000483778 IGF1RP08069 1367 aa31.56■■■□□ 2.64
ATG4B-221ENST00000483778 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.56■■■□□ 2.64
ATG4B-221ENST00000483778 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.49■■■□□ 2.63
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