RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515859.5

TUSC3-213, Transcript of tumor suppressor candidate 3, humanhuman

TSL 5

Gene TUSC3, Length 1,627 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUSC3-213ENST00000515859 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.77■■■■■ 6.84
TUSC3-213ENST00000515859 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.73■■■■■ 5.71
TUSC3-213ENST00000515859 ABCC9O60706 1549 aa48.47■■■■■ 5.35
TUSC3-213ENST00000515859 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.38■■■■■ 5.34
TUSC3-213ENST00000515859 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.87■■■■■ 5.25
TUSC3-213ENST00000515859 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.85■■■■■ 5.25
TUSC3-213ENST00000515859 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.61■■■■■ 5.21
TUSC3-213ENST00000515859 NACADO15069 1562 aa47.45■■■■■ 5.19
TUSC3-213ENST00000515859 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.18■■■■■ 5.14
TUSC3-213ENST00000515859 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.45■■■■■ 5.03
TUSC3-213ENST00000515859 SCRIBQ14160 1630 aa46.41■■■■■ 5.02
TUSC3-213ENST00000515859 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.03■■■■■ 4.96
TUSC3-213ENST00000515859 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.67■■■■■ 4.9
TUSC3-213ENST00000515859 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.55■■■■■ 4.88
TUSC3-213ENST00000515859 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.85■■■■■ 4.77
TUSC3-213ENST00000515859 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.69■■■■■ 4.74
TUSC3-213ENST00000515859 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.53■■■■■ 4.72
TUSC3-213ENST00000515859 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.52■■■■■ 4.72
TUSC3-213ENST00000515859 SMARCA4P51532 1647 aa44.52■■■■■ 4.72
TUSC3-213ENST00000515859 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.41■■■■■ 4.7
TUSC3-213ENST00000515859 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.39■■■■■ 4.7
TUSC3-213ENST00000515859 WIZO95785 1651 aa44.08■■■■■ 4.65
TUSC3-213ENST00000515859 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.08■■■■■ 4.65
TUSC3-213ENST00000515859 SMARCA2P51531 1590 aa44■■■■■ 4.63
TUSC3-213ENST00000515859 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44■■■■■ 4.63
TUSC3-213ENST00000515859 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.88■■■■■ 4.62
TUSC3-213ENST00000515859 NCAPD3P42695 1498 aa43.8■■■■■ 4.6
TUSC3-213ENST00000515859 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.72■■■■■ 4.59
TUSC3-213ENST00000515859 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.71■■■■■ 4.59
TUSC3-213ENST00000515859 HMGXB3Q12766 1538 aa43.66■■■■■ 4.58
TUSC3-213ENST00000515859 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.35■■■■■ 4.53
TUSC3-213ENST00000515859 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.23■■■■■ 4.51
TUSC3-213ENST00000515859 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.61■■■■■ 4.41
TUSC3-213ENST00000515859 CFTRP13569 1480 aa42.61■■■■■ 4.41
TUSC3-213ENST00000515859 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.4■■■■■ 4.38
TUSC3-213ENST00000515859 NESP48681 1621 aa42.31■■■■■ 4.36
TUSC3-213ENST00000515859 PRDM2Q13029 1718 aa42.27■■■■■ 4.36
TUSC3-213ENST00000515859 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.2■■■■■ 4.35
TUSC3-213ENST00000515859 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.14■■■■■ 4.34
TUSC3-213ENST00000515859 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.09■■■■■ 4.33
TUSC3-213ENST00000515859 ABCC8Q09428 1581 aa42■■■■■ 4.31
TUSC3-213ENST00000515859 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.95■■■■■ 4.31
TUSC3-213ENST00000515859 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.91■■■■■ 4.3
TUSC3-213ENST00000515859 TRIM41Q8WV44 630 aa41.91■■■■■ 4.3
TUSC3-213ENST00000515859 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.78■■■■■ 4.28
TUSC3-213ENST00000515859 SYNJ1O43426 1573 aa41.71■■■■■ 4.27
TUSC3-213ENST00000515859 ERCC6Q03468 1493 aa41.7■■■■■ 4.27
TUSC3-213ENST00000515859 CUX1P39880 1505 aa41.69■■■■■ 4.27
TUSC3-213ENST00000515859 TOP2BQ02880 1626 aa41.68■■■■■ 4.26
TUSC3-213ENST00000515859 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.63■■■■■ 4.25
TUSC3-213ENST00000515859 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.59■■■■■ 4.25
TUSC3-213ENST00000515859 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.58■■■■■ 4.25
TUSC3-213ENST00000515859 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
TUSC3-213ENST00000515859 TOPBP1Q92547 1522 aa41.54■■■■■ 4.24
TUSC3-213ENST00000515859 WDR62O43379 1518 aa41.37■■■■■ 4.21
TUSC3-213ENST00000515859 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.37■■■■■ 4.21
TUSC3-213ENST00000515859 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.35■■■■■ 4.21
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TUSC3-213ENST00000515859 SOGA1O94964 1423 aa41.17■■■■■ 4.18
TUSC3-213ENST00000515859 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.09■■■■■ 4.17
TUSC3-213ENST00000515859 EEA1Q15075 1411 aa41.08■■■■■ 4.17
TUSC3-213ENST00000515859 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.05■■■■■ 4.16
TUSC3-213ENST00000515859 CUX2O14529 1486 aa41.04■■■■■ 4.16
TUSC3-213ENST00000515859 KIF27Q86VH2 1401 aa40.99■■■■■ 4.15
TUSC3-213ENST00000515859 IFT140Q96RY7 1462 aa40.99■■■■■ 4.15
TUSC3-213ENST00000515859 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.97■■■■■ 4.15
TUSC3-213ENST00000515859 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.96■■■■■ 4.15
TUSC3-213ENST00000515859 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.96■■■■■ 4.15
TUSC3-213ENST00000515859 WDR97A6NE52 1622 aa40.88■■■■■ 4.14
TUSC3-213ENST00000515859 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.85■■■■■ 4.13
TUSC3-213ENST00000515859 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.78■■■■■ 4.12
TUSC3-213ENST00000515859 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.71■■■■■ 4.11
TUSC3-213ENST00000515859 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.71■■■■■ 4.11
TUSC3-213ENST00000515859 IGF1RP08069 1367 aa40.67■■■■■ 4.1
TUSC3-213ENST00000515859 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
TUSC3-213ENST00000515859 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.63■■■■■ 4.1
TUSC3-213ENST00000515859 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.58■■■■■ 4.09
TUSC3-213ENST00000515859 GRIN2BQ13224 1484 aa40.52■■■■■ 4.08
TUSC3-213ENST00000515859 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
TUSC3-213ENST00000515859 PRXQ9BXM0 1461 aa40.51■■■■■ 4.08
TUSC3-213ENST00000515859 KIF21BO75037 1637 aa40.48■■■■■ 4.07
TUSC3-213ENST00000515859 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.47■■■■■ 4.07
TUSC3-213ENST00000515859 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.47■■■■■ 4.07
TUSC3-213ENST00000515859 PBRM1Q86U86 1689 aa40.44■■■■■ 4.06
TUSC3-213ENST00000515859 CUL7Q14999 1698 aa40.42■■■■■ 4.06
TUSC3-213ENST00000515859 GOLGA3Q08378 1498 aa40.39■■■■■ 4.06
TUSC3-213ENST00000515859 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.35■■■■■ 4.05
TUSC3-213ENST00000515859 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.32■■■■■ 4.05
TUSC3-213ENST00000515859 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.29■■■■■ 4.04
TUSC3-213ENST00000515859 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.28■■■■■ 4.04
TUSC3-213ENST00000515859 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.27■■■■■ 4.04
TUSC3-213ENST00000515859 ADAMTS12P58397 1594 aa40.24■■■■■ 4.03
TUSC3-213ENST00000515859 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
TUSC3-213ENST00000515859 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.15■■■■■ 4.02
TUSC3-213ENST00000515859 SYNJ2O15056 1496 aa40.1■■■■■ 4.01
TUSC3-213ENST00000515859 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.05■■■■■ 4
TUSC3-213ENST00000515859 GRIN2AQ12879 1464 aa40■■■■□ 3.99
TUSC3-213ENST00000515859 FBLN2P98095 1184 aa39.94■■■■□ 3.99
TUSC3-213ENST00000515859 CEP162Q5TB80 1403 aa39.82■■■■□ 3.96
TUSC3-213ENST00000515859 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.79■■■■□ 3.96
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