RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465399.5

ATG4B-214, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 581 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-214ENST00000465399 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.7■■■■□ 3.31
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ATG4B-214ENST00000465399 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.59■■■□□ 2.49
ATG4B-214ENST00000465399 NACADO15069 1562 aa30.37■■■□□ 2.45
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ATG4B-214ENST00000465399 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.02■■■□□ 2.24
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ATG4B-214ENST00000465399 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.92■■■□□ 2.22
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ATG4B-214ENST00000465399 SMARCA2P51531 1590 aa27.86■■■□□ 2.05
ATG4B-214ENST00000465399 HMGXB3Q12766 1538 aa27.82■■■□□ 2.04
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ATG4B-214ENST00000465399 CUX2O14529 1486 aa27.7■■■□□ 2.03
ATG4B-214ENST00000465399 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.65■■■□□ 2.02
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ATG4B-214ENST00000465399 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.1■■□□□ 1.93
ATG4B-214ENST00000465399 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.99■■□□□ 1.91
ATG4B-214ENST00000465399 WDR62O43379 1518 aa26.94■■□□□ 1.9
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ATG4B-214ENST00000465399 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.88■■□□□ 1.89
ATG4B-214ENST00000465399 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
ATG4B-214ENST00000465399 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.83■■□□□ 1.89
ATG4B-214ENST00000465399 CFTRP13569 1480 aa26.81■■□□□ 1.88
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ATG4B-214ENST00000465399 TRIM41Q8WV44 630 aa26.45■■□□□ 1.82
ATG4B-214ENST00000465399 OSCARQ8IYS5 282 aa26.38■■□□□ 1.81
ATG4B-214ENST00000465399 IFT140Q96RY7 1462 aa26.33■■□□□ 1.81
ATG4B-214ENST00000465399 TOPBP1Q92547 1522 aa26.32■■□□□ 1.8
ATG4B-214ENST00000465399 ABCC8Q09428 1581 aa26.29■■□□□ 1.8
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ATG4B-214ENST00000465399 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
ATG4B-214ENST00000465399 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
ATG4B-214ENST00000465399 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
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ATG4B-214ENST00000465399 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.11■■□□□ 1.77
ATG4B-214ENST00000465399 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.11■■□□□ 1.77
ATG4B-214ENST00000465399 CHD1O14646 1710 aa26.05■■□□□ 1.76
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ATG4B-214ENST00000465399 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.92■■□□□ 1.74
ATG4B-214ENST00000465399 SOGA1O94964 1423 aa25.9■■□□□ 1.74
ATG4B-214ENST00000465399 WDR97A6NE52 1622 aa25.9■■□□□ 1.74
ATG4B-214ENST00000465399 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.88■■□□□ 1.73
ATG4B-214ENST00000465399 FBLN2P98095 1184 aa25.86■■□□□ 1.73
ATG4B-214ENST00000465399 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
ATG4B-214ENST00000465399 CUX1P39880 1505 aa25.84■■□□□ 1.73
ATG4B-214ENST00000465399 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.79■■□□□ 1.72
ATG4B-214ENST00000465399 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.76■■□□□ 1.71
ATG4B-214ENST00000465399 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
ATG4B-214ENST00000465399 ARAP1Q96P48 1450 aa25.72■■□□□ 1.71
ATG4B-214ENST00000465399 PBRM1Q86U86 1689 aa25.71■■□□□ 1.71
ATG4B-214ENST00000465399 GRIN2BQ13224 1484 aa25.71■■□□□ 1.71
ATG4B-214ENST00000465399 SYNJ1O43426 1573 aa25.7■■□□□ 1.71
ATG4B-214ENST00000465399 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.68■■□□□ 1.7
ATG4B-214ENST00000465399 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
ATG4B-214ENST00000465399 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
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ATG4B-214ENST00000465399 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.61■■□□□ 1.69
ATG4B-214ENST00000465399 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.59■■□□□ 1.69
ATG4B-214ENST00000465399 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.58■■□□□ 1.69
ATG4B-214ENST00000465399 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
ATG4B-214ENST00000465399 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.49■■□□□ 1.67
ATG4B-214ENST00000465399 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.47■■□□□ 1.67
ATG4B-214ENST00000465399 TOP2BQ02880 1626 aa25.47■■□□□ 1.67
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ATG4B-214ENST00000465399 CEP170Q5SW79 1584 aa25.31■■□□□ 1.64
ATG4B-214ENST00000465399 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.29■■□□□ 1.64
ATG4B-214ENST00000465399 NUP160Q12769 1436 aa25.29■■□□□ 1.64
ATG4B-214ENST00000465399 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.28■■□□□ 1.64
ATG4B-214ENST00000465399 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.25■■□□□ 1.63
ATG4B-214ENST00000465399 SHROOM2Q13796 1616 aa25.23■■□□□ 1.63
ATG4B-214ENST00000465399 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.06■■□□□ 1.6
ATG4B-214ENST00000465399 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
ATG4B-214ENST00000465399 JPH4Q96JJ6 628 aa24.98■■□□□ 1.59
ATG4B-214ENST00000465399 CUL7Q14999 1698 aa24.97■■□□□ 1.59
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