RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468018.5

ATG4B-215, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 721 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-215ENST00000468018 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.46■■■■□ 3.59
ATG4B-215ENST00000468018 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.45■■■□□ 2.95
ATG4B-215ENST00000468018 ABCC9O60706 1549 aa32.7■■■□□ 2.83
ATG4B-215ENST00000468018 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.47■■■□□ 2.63
ATG4B-215ENST00000468018 NACADO15069 1562 aa31.43■■■□□ 2.62
ATG4B-215ENST00000468018 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.26■■■□□ 2.59
ATG4B-215ENST00000468018 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.58
ATG4B-215ENST00000468018 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.07■■■□□ 2.56
ATG4B-215ENST00000468018 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.05■■■□□ 2.56
ATG4B-215ENST00000468018 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.9■■■□□ 2.54
ATG4B-215ENST00000468018 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.59■■■□□ 2.49
ATG4B-215ENST00000468018 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.46■■■□□ 2.47
ATG4B-215ENST00000468018 SCRIBQ14160 1630 aa30.38■■■□□ 2.45
ATG4B-215ENST00000468018 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.25■■■□□ 2.43
ATG4B-215ENST00000468018 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.18■■■□□ 2.42
ATG4B-215ENST00000468018 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
ATG4B-215ENST00000468018 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.67■■■□□ 2.34
ATG4B-215ENST00000468018 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.42■■■□□ 2.3
ATG4B-215ENST00000468018 SMARCA4P51532 1647 aa29.12■■■□□ 2.25
ATG4B-215ENST00000468018 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
ATG4B-215ENST00000468018 NCAPD3P42695 1498 aa28.99■■■□□ 2.23
ATG4B-215ENST00000468018 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.97■■■□□ 2.23
ATG4B-215ENST00000468018 SMARCA2P51531 1590 aa28.92■■■□□ 2.22
ATG4B-215ENST00000468018 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.9■■■□□ 2.22
ATG4B-215ENST00000468018 HMGXB3Q12766 1538 aa28.86■■■□□ 2.21
ATG4B-215ENST00000468018 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.84■■■□□ 2.21
ATG4B-215ENST00000468018 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
ATG4B-215ENST00000468018 WIZO95785 1651 aa28.54■■■□□ 2.16
ATG4B-215ENST00000468018 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
ATG4B-215ENST00000468018 NESP48681 1621 aa28.29■■■□□ 2.12
ATG4B-215ENST00000468018 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.25■■■□□ 2.11
ATG4B-215ENST00000468018 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
ATG4B-215ENST00000468018 ERCC6Q03468 1493 aa28.15■■■□□ 2.1
ATG4B-215ENST00000468018 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.08■■■□□ 2.09
ATG4B-215ENST00000468018 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.03■■■□□ 2.08
ATG4B-215ENST00000468018 CUX2O14529 1486 aa28.02■■■□□ 2.08
ATG4B-215ENST00000468018 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
ATG4B-215ENST00000468018 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.98■■■□□ 2.07
ATG4B-215ENST00000468018 CFTRP13569 1480 aa27.93■■■□□ 2.06
ATG4B-215ENST00000468018 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.86■■■□□ 2.05
ATG4B-215ENST00000468018 PRDM2Q13029 1718 aa27.83■■■□□ 2.05
ATG4B-215ENST00000468018 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.76■■■□□ 2.03
ATG4B-215ENST00000468018 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.74■■■□□ 2.03
ATG4B-215ENST00000468018 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.73■■■□□ 2.03
ATG4B-215ENST00000468018 WDR62O43379 1518 aa27.72■■■□□ 2.03
ATG4B-215ENST00000468018 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
ATG4B-215ENST00000468018 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
ATG4B-215ENST00000468018 TOPBP1Q92547 1522 aa27.33■■□□□ 1.97
ATG4B-215ENST00000468018 ABCC8Q09428 1581 aa27.31■■□□□ 1.96
ATG4B-215ENST00000468018 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.3■■□□□ 1.96
ATG4B-215ENST00000468018 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.28■■□□□ 1.96
ATG4B-215ENST00000468018 IFT140Q96RY7 1462 aa27.18■■□□□ 1.94
ATG4B-215ENST00000468018 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
ATG4B-215ENST00000468018 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
ATG4B-215ENST00000468018 CUX1P39880 1505 aa27.07■■□□□ 1.92
ATG4B-215ENST00000468018 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
ATG4B-215ENST00000468018 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
ATG4B-215ENST00000468018 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.98■■□□□ 1.91
ATG4B-215ENST00000468018 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.93■■□□□ 1.9
ATG4B-215ENST00000468018 SOGA1O94964 1423 aa26.9■■□□□ 1.9
ATG4B-215ENST00000468018 WDR97A6NE52 1622 aa26.9■■□□□ 1.9
ATG4B-215ENST00000468018 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.87■■□□□ 1.89
ATG4B-215ENST00000468018 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.86■■□□□ 1.892e-11■■■□□ 18.5
ATG4B-215ENST00000468018 TOP2BQ02880 1626 aa26.83■■□□□ 1.88
ATG4B-215ENST00000468018 SYNJ1O43426 1573 aa26.8■■□□□ 1.88
ATG4B-215ENST00000468018 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.79■■□□□ 1.88
ATG4B-215ENST00000468018 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.75■■□□□ 1.87
ATG4B-215ENST00000468018 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
ATG4B-215ENST00000468018 OSCARQ8IYS5 282 aa26.72■■□□□ 1.87
ATG4B-215ENST00000468018 CHD1O14646 1710 aa26.71■■□□□ 1.87
ATG4B-215ENST00000468018 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.7■■□□□ 1.86
ATG4B-215ENST00000468018 PBRM1Q86U86 1689 aa26.67■■□□□ 1.86
ATG4B-215ENST00000468018 GRIN2BQ13224 1484 aa26.64■■□□□ 1.86
ATG4B-215ENST00000468018 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.62■■□□□ 1.85
ATG4B-215ENST00000468018 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.62■■□□□ 1.85
ATG4B-215ENST00000468018 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
ATG4B-215ENST00000468018 SYNJ2O15056 1496 aa26.5■■□□□ 1.83
ATG4B-215ENST00000468018 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.43■■□□□ 1.82
ATG4B-215ENST00000468018 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.43■■□□□ 1.82
ATG4B-215ENST00000468018 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.43■■□□□ 1.82
ATG4B-215ENST00000468018 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.43■■□□□ 1.82
ATG4B-215ENST00000468018 ADAMTS12P58397 1594 aa26.42■■□□□ 1.82
ATG4B-215ENST00000468018 FBLN2P98095 1184 aa26.42■■□□□ 1.82
ATG4B-215ENST00000468018 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.42■■□□□ 1.82
ATG4B-215ENST00000468018 ARHGEF11O15085 1522 aa26.39■■□□□ 1.82
ATG4B-215ENST00000468018 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
ATG4B-215ENST00000468018 GRIN2AQ12879 1464 aa26.32■■□□□ 1.8
ATG4B-215ENST00000468018 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.31■■□□□ 1.8
ATG4B-215ENST00000468018 NUP160Q12769 1436 aa26.25■■□□□ 1.79
ATG4B-215ENST00000468018 CEP170Q5SW79 1584 aa26.23■■□□□ 1.79
ATG4B-215ENST00000468018 KIF27Q86VH2 1401 aa26.22■■□□□ 1.79
ATG4B-215ENST00000468018 TRIM41Q8WV44 630 aa26.18■■□□□ 1.78
ATG4B-215ENST00000468018 ARAP1Q96P48 1450 aa26.17■■□□□ 1.78
ATG4B-215ENST00000468018 IGF1RP08069 1367 aa26.17■■□□□ 1.78
ATG4B-215ENST00000468018 CUL7Q14999 1698 aa26.16■■□□□ 1.78
ATG4B-215ENST00000468018 SHROOM2Q13796 1616 aa26.12■■□□□ 1.77
ATG4B-215ENST00000468018 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.05■■□□□ 1.76
ATG4B-215ENST00000468018 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.02■■□□□ 1.76
ATG4B-215ENST00000468018 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26■■□□□ 1.75
ATG4B-215ENST00000468018 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.97■■□□□ 1.75
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