RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415107.5

ATG4B-207, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 356 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-207ENST00000415107 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.75■■■□□ 2.19
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ATG4B-207ENST00000415107 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
ATG4B-207ENST00000415107 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.98■■□□□ 1.43
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ATG4B-207ENST00000415107 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.84■■□□□ 1.41
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ATG4B-207ENST00000415107 SCRIBQ14160 1630 aa23.15■■□□□ 1.3
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ATG4B-207ENST00000415107 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.28■■□□□ 1.16
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ATG4B-207ENST00000415107 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4B-207ENST00000415107 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4B-207ENST00000415107 SMARCA2P51531 1590 aa22.08■■□□□ 1.13
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ATG4B-207ENST00000415107 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.12■□□□□ 0.97
ATG4B-207ENST00000415107 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.1■□□□□ 0.97
ATG4B-207ENST00000415107 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.07■□□□□ 0.96
ATG4B-207ENST00000415107 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
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ATG4B-207ENST00000415107 WDR62O43379 1518 aa20.98■□□□□ 0.95
ATG4B-207ENST00000415107 CUX2O14529 1486 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-207ENST00000415107 ABCC8Q09428 1581 aa20.89■□□□□ 0.94
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ATG4B-207ENST00000415107 CUX1P39880 1505 aa20.73■□□□□ 0.91
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ATG4B-207ENST00000415107 TOP2BQ02880 1626 aa20.67■□□□□ 0.9
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ATG4B-207ENST00000415107 WDR97A6NE52 1622 aa20.57■□□□□ 0.88
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ATG4B-207ENST00000415107 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-207ENST00000415107 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
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ATG4B-207ENST00000415107 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.4■□□□□ 0.86
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ATG4B-207ENST00000415107 PBRM1Q86U86 1689 aa20.28■□□□□ 0.84
ATG4B-207ENST00000415107 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-207ENST00000415107 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-207ENST00000415107 TRIM41Q8WV44 630 aa20.26■□□□□ 0.83
ATG4B-207ENST00000415107 KIF27Q86VH2 1401 aa20.26■□□□□ 0.83
ATG4B-207ENST00000415107 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.21■□□□□ 0.83
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ATG4B-207ENST00000415107 SYNJ2O15056 1496 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-207ENST00000415107 CUL7Q14999 1698 aa20.13■□□□□ 0.81
ATG4B-207ENST00000415107 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.12■□□□□ 0.81
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ATG4B-207ENST00000415107 CLASP1Q7Z460 1538 aa19.97■□□□□ 0.79
ATG4B-207ENST00000415107 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa19.93■□□□□ 0.78
ATG4B-207ENST00000415107 CEP170Q5SW79 1584 aa19.92■□□□□ 0.78
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ATG4B-207ENST00000415107 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa19.9■□□□□ 0.78
ATG4B-207ENST00000415107 CSRNP3Q8WYN3 585 aa19.89■□□□□ 0.77
ATG4B-207ENST00000415107 KIF21BO75037 1637 aa19.85■□□□□ 0.77
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ATG4B-207ENST00000415107 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa19.83■□□□□ 0.77
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