Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLD2P49005 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLD2P49005 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLD2P49005 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLD2P49005 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLD2P49005 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLD2P49005 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLD2P49005 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLD2P49005 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLD2P49005 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLD2P49005 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLD2P49005 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
POLD2P49005 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
POLD2P49005 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLD2P49005 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLD2P49005 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLD2P49005 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLD2P49005 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLD2P49005 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLD2P49005 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLD2P49005 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD2P49005 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD2P49005 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLD2P49005 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLD2P49005 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLD2P49005 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
POLD2P49005 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLD2P49005 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
POLD2P49005 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLD2P49005 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLD2P49005 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLD2P49005 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLD2P49005 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLD2P49005 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLD2P49005 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLD2P49005 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLD2P49005 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLD2P49005 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
POLD2P49005 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLD2P49005 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLD2P49005 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLD2P49005 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLD2P49005 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLD2P49005 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
POLD2P49005 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLD2P49005 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLD2P49005 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLD2P49005 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLD2P49005 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLD2P49005 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLD2P49005 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLD2P49005 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLD2P49005 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLD2P49005 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLD2P49005 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLD2P49005 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLD2P49005 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLD2P49005 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLD2P49005 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLD2P49005 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLD2P49005 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLD2P49005 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLD2P49005 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLD2P49005 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLD2P49005 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
POLD2P49005 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLD2P49005 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLD2P49005 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLD2P49005 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLD2P49005 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLD2P49005 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLD2P49005 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLD2P49005 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLD2P49005 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLD2P49005 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLD2P49005 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLD2P49005 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLD2P49005 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLD2P49005 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLD2P49005 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLD2P49005 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLD2P49005 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLD2P49005 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLD2P49005 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLD2P49005 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLD2P49005 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
POLD2P49005 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
POLD2P49005 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLD2P49005 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLD2P49005 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLD2P49005 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLD2P49005 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLD2P49005 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLD2P49005 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLD2P49005 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
POLD2P49005 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLD2P49005 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLD2P49005 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLD2P49005 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLD2P49005 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms