RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378546.8

FAAP20-202, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAAP20, Length 729 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-202ENST00000378546 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.98■■■■■ 7.67
FAAP20-202ENST00000378546 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.4■■■■■ 6.62
FAAP20-202ENST00000378546 ABCC9O60706 1549 aa55.94■■■■■ 6.55
FAAP20-202ENST00000378546 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.47■■■■■ 6.15
FAAP20-202ENST00000378546 NACADO15069 1562 aa53.16■■■■■ 6.1
FAAP20-202ENST00000378546 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.07■■■■■ 6.09
FAAP20-202ENST00000378546 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.5■■■■■ 6
FAAP20-202ENST00000378546 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.31■■■■■ 5.97
FAAP20-202ENST00000378546 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.25■■■■■ 5.95
FAAP20-202ENST00000378546 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.11■■■■■ 5.93
FAAP20-202ENST00000378546 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.02■■■■■ 5.92
FAAP20-202ENST00000378546 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.87■■■■■ 5.89
FAAP20-202ENST00000378546 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.78■■■■■ 5.88
FAAP20-202ENST00000378546 SCRIBQ14160 1630 aa51.47■■■■■ 5.83
FAAP20-202ENST00000378546 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.19■■■■■ 5.79
FAAP20-202ENST00000378546 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.55■■■■■ 5.68
FAAP20-202ENST00000378546 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.55■■■■■ 5.68
FAAP20-202ENST00000378546 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.33■■■■■ 5.65
FAAP20-202ENST00000378546 SMARCA4P51532 1647 aa49.09■■■■■ 5.45
FAAP20-202ENST00000378546 NCAPD3P42695 1498 aa48.99■■■■■ 5.43
FAAP20-202ENST00000378546 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.95■■■■■ 5.43
FAAP20-202ENST00000378546 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.92■■■■■ 5.42
FAAP20-202ENST00000378546 SMARCA2P51531 1590 aa48.91■■■■■ 5.42
FAAP20-202ENST00000378546 HMGXB3Q12766 1538 aa48.76■■■■■ 5.4
FAAP20-202ENST00000378546 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.6■■■■■ 5.37
FAAP20-202ENST00000378546 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.54■■■■■ 5.36
FAAP20-202ENST00000378546 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.53■■■■■ 5.36
FAAP20-202ENST00000378546 ERCC6Q03468 1493 aa48.35■■■■■ 5.33
FAAP20-202ENST00000378546 NESP48681 1621 aa48.14■■■■■ 5.3
FAAP20-202ENST00000378546 WIZO95785 1651 aa48.03■■■■■ 5.28
FAAP20-202ENST00000378546 CUX2O14529 1486 aa47.99■■■■■ 5.27
FAAP20-202ENST00000378546 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.92■■■■■ 5.26
FAAP20-202ENST00000378546 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.67■■■■■ 5.22
FAAP20-202ENST00000378546 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.62■■■■■ 5.21
FAAP20-202ENST00000378546 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.62■■■■■ 5.21
FAAP20-202ENST00000378546 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.6■■■■■ 5.21
FAAP20-202ENST00000378546 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.56■■■■■ 5.2
FAAP20-202ENST00000378546 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.46■■■■■ 5.19
FAAP20-202ENST00000378546 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.34■■■■■ 5.17
FAAP20-202ENST00000378546 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.2■■■■■ 5.15
FAAP20-202ENST00000378546 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.14■■■■■ 5.14
FAAP20-202ENST00000378546 CFTRP13569 1480 aa47.12■■■■■ 5.13
FAAP20-202ENST00000378546 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.08■■■■■ 5.13
FAAP20-202ENST00000378546 WDR62O43379 1518 aa47.05■■■■■ 5.12
FAAP20-202ENST00000378546 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.86■■■■■ 5.09
FAAP20-202ENST00000378546 PRDM2Q13029 1718 aa46.83■■■■■ 5.09
FAAP20-202ENST00000378546 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.64■■■■■ 5.06
FAAP20-202ENST00000378546 TOPBP1Q92547 1522 aa46.23■■■■■ 4.99
FAAP20-202ENST00000378546 ABCC8Q09428 1581 aa46.18■■■■■ 4.98
FAAP20-202ENST00000378546 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.13■■■■■ 4.98
FAAP20-202ENST00000378546 IFT140Q96RY7 1462 aa46.13■■■■■ 4.98
FAAP20-202ENST00000378546 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.03■■■■■ 4.96
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.98■■■■■ 4.95
FAAP20-202ENST00000378546 OSCARQ8IYS5 282 aa45.86■■■■■ 4.93
FAAP20-202ENST00000378546 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.84■■■■■ 4.93
FAAP20-202ENST00000378546 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.79■■■■■ 4.92
FAAP20-202ENST00000378546 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.77■■■■■ 4.92
FAAP20-202ENST00000378546 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.63■■■■■ 4.92e-6■■□□□ 13.2
FAAP20-202ENST00000378546 TRIM41Q8WV44 630 aa45.63■■■■■ 4.9
FAAP20-202ENST00000378546 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.61■■■■■ 4.89
FAAP20-202ENST00000378546 CUX1P39880 1505 aa45.6■■■■■ 4.89
FAAP20-202ENST00000378546 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.6■■■■■ 4.89
FAAP20-202ENST00000378546 SOGA1O94964 1423 aa45.58■■■■■ 4.89
FAAP20-202ENST00000378546 CHD1O14646 1710 aa45.43■■■■■ 4.86
FAAP20-202ENST00000378546 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.43■■■■■ 4.86
FAAP20-202ENST00000378546 WDR97A6NE52 1622 aa45.38■■■■■ 4.86
FAAP20-202ENST00000378546 FBLN2P98095 1184 aa45.34■■■■■ 4.85
FAAP20-202ENST00000378546 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.27■■■■■ 4.84
FAAP20-202ENST00000378546 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.27■■■■■ 4.84
FAAP20-202ENST00000378546 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.27■■■■■ 4.84
FAAP20-202ENST00000378546 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.24■■■■■ 4.83
FAAP20-202ENST00000378546 GRIN2BQ13224 1484 aa45.16■■■■■ 4.82
FAAP20-202ENST00000378546 ARHGEF11O15085 1522 aa45.16■■■■■ 4.82
FAAP20-202ENST00000378546 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.12■■■■■ 4.81
FAAP20-202ENST00000378546 PBRM1Q86U86 1689 aa45.09■■■■■ 4.81
FAAP20-202ENST00000378546 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.06■■■■■ 4.8
FAAP20-202ENST00000378546 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.06■■■■■ 4.8
FAAP20-202ENST00000378546 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.04■■■■■ 4.8
FAAP20-202ENST00000378546 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.03■■■■■ 4.8
FAAP20-202ENST00000378546 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.03■■■■■ 4.8
FAAP20-202ENST00000378546 TOP2BQ02880 1626 aa45.01■■■■■ 4.8
FAAP20-202ENST00000378546 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45■■■■■ 4.79
FAAP20-202ENST00000378546 SYNJ1O43426 1573 aa44.99■■■■■ 4.79
FAAP20-202ENST00000378546 SYNJ2O15056 1496 aa44.95■■■■■ 4.79
FAAP20-202ENST00000378546 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.83■■■■■ 4.77
FAAP20-202ENST00000378546 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.78■■■■■ 4.76
FAAP20-202ENST00000378546 ARAP1Q96P48 1450 aa44.72■■■■■ 4.75
FAAP20-202ENST00000378546 ADAMTS12P58397 1594 aa44.65■■■■■ 4.74
FAAP20-202ENST00000378546 GRIN2AQ12879 1464 aa44.58■■■■■ 4.73
FAAP20-202ENST00000378546 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.54■■■■■ 4.72
FAAP20-202ENST00000378546 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.5■■■■■ 4.71
FAAP20-202ENST00000378546 CEP170Q5SW79 1584 aa44.4■■■■■ 4.7
FAAP20-202ENST00000378546 NUP160Q12769 1436 aa44.36■■■■■ 4.69
FAAP20-202ENST00000378546 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.22■■■■■ 4.67
FAAP20-202ENST00000378546 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.17■■■■■ 4.66
FAAP20-202ENST00000378546 KIF27Q86VH2 1401 aa44.16■■■■■ 4.66
FAAP20-202ENST00000378546 SHROOM2Q13796 1616 aa44.14■■■■■ 4.66
FAAP20-202ENST00000378546 CUL7Q14999 1698 aa44.05■■■■■ 4.64
FAAP20-202ENST00000378546 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.02■■■■■ 4.64
FAAP20-202ENST00000378546 IGF1RP08069 1367 aa43.98■■■■■ 4.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms