RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503800.1

GSX2-202, Transcript of GS homeobox 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GSX2, Length 1,181 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSX2-202ENST00000503800 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.28■■■■■ 7.4
GSX2-202ENST00000503800 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.22■■■■■ 6.27
GSX2-202ENST00000503800 ABCC9O60706 1549 aa52.43■■■■■ 5.98
GSX2-202ENST00000503800 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.21■■■■■ 5.79
GSX2-202ENST00000503800 NACADO15069 1562 aa50.81■■■■■ 5.72
GSX2-202ENST00000503800 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.76■■■■■ 5.72
GSX2-202ENST00000503800 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.76■■■■■ 5.72
GSX2-202ENST00000503800 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.75■■■■■ 5.71
GSX2-202ENST00000503800 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.7■■■■■ 5.71
GSX2-202ENST00000503800 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.6■■■■■ 5.53
GSX2-202ENST00000503800 SCRIBQ14160 1630 aa49.5■■■■■ 5.51
GSX2-202ENST00000503800 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.23■■■■■ 5.47
GSX2-202ENST00000503800 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.06■■■■■ 5.44
GSX2-202ENST00000503800 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.74■■■■■ 5.39
GSX2-202ENST00000503800 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.83■■■■■ 5.25
GSX2-202ENST00000503800 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.68■■■■■ 5.22
GSX2-202ENST00000503800 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.59■■■■■ 5.21
GSX2-202ENST00000503800 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.47■■■■■ 5.19
GSX2-202ENST00000503800 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.44■■■■■ 5.18
GSX2-202ENST00000503800 SMARCA4P51532 1647 aa47.42■■■■■ 5.18
GSX2-202ENST00000503800 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.25■■■■■ 5.15
GSX2-202ENST00000503800 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.01■■■■■ 5.12
GSX2-202ENST00000503800 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.98■■■■■ 5.11
GSX2-202ENST00000503800 SMARCA2P51531 1590 aa46.95■■■■■ 5.11
GSX2-202ENST00000503800 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.92■■■■■ 5.1
GSX2-202ENST00000503800 NCAPD3P42695 1498 aa46.89■■■■■ 5.1
GSX2-202ENST00000503800 WIZO95785 1651 aa46.75■■■■■ 5.07
GSX2-202ENST00000503800 HMGXB3Q12766 1538 aa46.73■■■■■ 5.07
GSX2-202ENST00000503800 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.62■■■■■ 5.05
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GSX2-202ENST00000503800 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.06■■■■■ 4.96
GSX2-202ENST00000503800 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.74■■■■■ 4.91
GSX2-202ENST00000503800 NESP48681 1621 aa45.58■■■■■ 4.89
GSX2-202ENST00000503800 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.54■■■■■ 4.88
GSX2-202ENST00000503800 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.53■■■■■ 4.88
GSX2-202ENST00000503800 CFTRP13569 1480 aa45.42■■■■■ 4.86
GSX2-202ENST00000503800 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.18■■■■■ 4.82
GSX2-202ENST00000503800 PRDM2Q13029 1718 aa45.11■■■■■ 4.81
GSX2-202ENST00000503800 ERCC6Q03468 1493 aa45.09■■■■■ 4.81
GSX2-202ENST00000503800 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.05■■■■■ 4.8
GSX2-202ENST00000503800 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.01■■■■■ 4.8
GSX2-202ENST00000503800 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.89■■■■■ 4.78
GSX2-202ENST00000503800 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.8■■■■■ 4.76
GSX2-202ENST00000503800 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.72■■■■■ 4.75
GSX2-202ENST00000503800 WDR62O43379 1518 aa44.58■■■■■ 4.73
GSX2-202ENST00000503800 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.56■■■■■ 4.72
GSX2-202ENST00000503800 CUX2O14529 1486 aa44.46■■■■■ 4.71
GSX2-202ENST00000503800 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.39■■■■■ 4.7
GSX2-202ENST00000503800 TOPBP1Q92547 1522 aa44.38■■■■■ 4.69
GSX2-202ENST00000503800 ABCC8Q09428 1581 aa44.36■■■■■ 4.69
GSX2-202ENST00000503800 CUX1P39880 1505 aa44.29■■■■■ 4.68
GSX2-202ENST00000503800 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.19■■■■■ 4.66
GSX2-202ENST00000503800 SYNJ1O43426 1573 aa44.1■■■■■ 4.65
GSX2-202ENST00000503800 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.06■■■■■ 4.64
GSX2-202ENST00000503800 TOP2BQ02880 1626 aa44.06■■■■■ 4.64
GSX2-202ENST00000503800 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.05■■■■■ 4.64
GSX2-202ENST00000503800 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.02■■■■■ 4.64
GSX2-202ENST00000503800 IFT140Q96RY7 1462 aa43.93■■■■■ 4.62
GSX2-202ENST00000503800 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.88■■■■■ 4.61
GSX2-202ENST00000503800 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.83■■■■■ 4.61
GSX2-202ENST00000503800 SOGA1O94964 1423 aa43.82■■■■■ 4.61
GSX2-202ENST00000503800 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.71■■■■■ 4.59
GSX2-202ENST00000503800 WDR97A6NE52 1622 aa43.68■■■■■ 4.58
GSX2-202ENST00000503800 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.63■■■■■ 4.58
GSX2-202ENST00000503800 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.57■■■■■ 4.57
GSX2-202ENST00000503800 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.51■■■■■ 4.56
GSX2-202ENST00000503800 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.51■■■■■ 4.56
GSX2-202ENST00000503800 TRIM41Q8WV44 630 aa43.47■■■■■ 4.55
GSX2-202ENST00000503800 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.44■■■■■ 4.54
GSX2-202ENST00000503800 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.41■■■■■ 4.54
GSX2-202ENST00000503800 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.35■■■■■ 4.53
GSX2-202ENST00000503800 GRIN2BQ13224 1484 aa43.26■■■■■ 4.52
GSX2-202ENST00000503800 PBRM1Q86U86 1689 aa43.24■■■■■ 4.51
GSX2-202ENST00000503800 KIF27Q86VH2 1401 aa43.2■■■■■ 4.51
GSX2-202ENST00000503800 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.14■■■■■ 4.5
GSX2-202ENST00000503800 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.12■■■■■ 4.49
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GSX2-202ENST00000503800 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.05■■■■■ 4.48
GSX2-202ENST00000503800 ADAMTS12P58397 1594 aa42.98■■■■■ 4.47
GSX2-202ENST00000503800 IGF1RP08069 1367 aa42.97■■■■■ 4.47
GSX2-202ENST00000503800 SYNJ2O15056 1496 aa42.92■■■■■ 4.46
GSX2-202ENST00000503800 CHD1O14646 1710 aa42.88■■■■■ 4.45
GSX2-202ENST00000503800 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.88■■■■■ 4.45
GSX2-202ENST00000503800 CUL7Q14999 1698 aa42.84■■■■■ 4.45
GSX2-202ENST00000503800 EEA1Q15075 1411 aa42.79■■■■■ 4.44
GSX2-202ENST00000503800 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.76■■■■■ 4.44
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GSX2-202ENST00000503800 GRIN2AQ12879 1464 aa42.73■■■■■ 4.43
GSX2-202ENST00000503800 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.7■■■■■ 4.43
GSX2-202ENST00000503800 OSCARQ8IYS5 282 aa42.64■■■■■ 4.42
GSX2-202ENST00000503800 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.6■■■■■ 4.41
GSX2-202ENST00000503800 PRXQ9BXM0 1461 aa42.59■■■■■ 4.41
GSX2-202ENST00000503800 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.56■■■■■ 4.4
GSX2-202ENST00000503800 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.54■■■■■ 4.4
GSX2-202ENST00000503800 NUP160Q12769 1436 aa42.54■■■■■ 4.4
GSX2-202ENST00000503800 CEP170Q5SW79 1584 aa42.52■■■■■ 4.4
GSX2-202ENST00000503800 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.48■■■■■ 4.39
GSX2-202ENST00000503800 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.34■■■■■ 4.37
GSX2-202ENST00000503800 KIF21BO75037 1637 aa42.34■■■■■ 4.37
GSX2-202ENST00000503800 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.25■■■■■ 4.35
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