RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424443.7

TSPAN3-203, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

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Gene TSPAN3, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-203ENST00000424443 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.79■■■■■ 7.32
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TSPAN3-203ENST00000424443 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.13■■■■■ 4.82
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TSPAN3-203ENST00000424443 CUX2O14529 1486 aa44.53■■■■■ 4.72
TSPAN3-203ENST00000424443 WDR62O43379 1518 aa44.41■■■■■ 4.7
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TSPAN3-203ENST00000424443 TOPBP1Q92547 1522 aa44.15■■■■■ 4.66
TSPAN3-203ENST00000424443 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.14■■■■■ 4.66
TSPAN3-203ENST00000424443 CUX1P39880 1505 aa43.93■■■■■ 4.62
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TSPAN3-203ENST00000424443 IFT140Q96RY7 1462 aa43.8■■■■■ 4.6
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TSPAN3-203ENST00000424443 SYNJ1O43426 1573 aa43.66■■■■■ 4.58
TSPAN3-203ENST00000424443 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.65■■■■■ 4.58
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TSPAN3-203ENST00000424443 WDR97A6NE52 1622 aa43.32■■■■■ 4.53
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TSPAN3-203ENST00000424443 TRIM41Q8WV44 630 aa43.15■■■■■ 4.5
TSPAN3-203ENST00000424443 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.11■■■■■ 4.49
TSPAN3-203ENST00000424443 GRIN2BQ13224 1484 aa43.1■■■■■ 4.49
TSPAN3-203ENST00000424443 PBRM1Q86U86 1689 aa43.03■■■■■ 4.48
TSPAN3-203ENST00000424443 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.98■■■■■ 4.47
TSPAN3-203ENST00000424443 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.94■■■■■ 4.46
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TSPAN3-203ENST00000424443 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.78■■■■■ 4.44
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TSPAN3-203ENST00000424443 PRXQ9BXM0 1461 aa42.11■■■■■ 4.33
TSPAN3-203ENST00000424443 ARHGEF11O15085 1522 aa42.06■■■■■ 4.32
TSPAN3-203ENST00000424443 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.02■■■■■ 4.32
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