RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524349.5

RPS20-211, Transcript of ribosomal protein S20, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS20, Length 752 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS20-211ENST00000524349 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62■■■■■ 7.52
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RPS20-211ENST00000524349 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.26■■■■■ 5.96
RPS20-211ENST00000524349 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.22■■■■■ 5.95
RPS20-211ENST00000524349 NACADO15069 1562 aa52.03■■■■■ 5.92
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RPS20-211ENST00000524349 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.48■■■■■ 5.83
RPS20-211ENST00000524349 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.14■■■■■ 5.78
RPS20-211ENST00000524349 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.11■■■■■ 5.77
RPS20-211ENST00000524349 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51■■■■■ 5.75
RPS20-211ENST00000524349 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.7■■■■■ 5.71
RPS20-211ENST00000524349 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.61■■■■■ 5.69
RPS20-211ENST00000524349 SCRIBQ14160 1630 aa50.54■■■■■ 5.68
RPS20-211ENST00000524349 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.95■■■■■ 5.59
RPS20-211ENST00000524349 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.41■■■■■ 5.5
RPS20-211ENST00000524349 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.33■■■■■ 5.49
RPS20-211ENST00000524349 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.12■■■■■ 5.45
RPS20-211ENST00000524349 SMARCA4P51532 1647 aa48.2■■■■■ 5.31
RPS20-211ENST00000524349 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.08■■■■■ 5.29
RPS20-211ENST00000524349 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.05■■■■■ 5.28
RPS20-211ENST00000524349 NCAPD3P42695 1498 aa48.05■■■■■ 5.28
RPS20-211ENST00000524349 SMARCA2P51531 1590 aa47.92■■■■■ 5.26
RPS20-211ENST00000524349 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.86■■■■■ 5.25
RPS20-211ENST00000524349 HMGXB3Q12766 1538 aa47.74■■■■■ 5.23
RPS20-211ENST00000524349 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.68■■■■■ 5.22
RPS20-211ENST00000524349 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.63■■■■■ 5.22
RPS20-211ENST00000524349 WIZO95785 1651 aa47.3■■■■■ 5.16
RPS20-211ENST00000524349 NESP48681 1621 aa47.19■■■■■ 5.15
RPS20-211ENST00000524349 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.14■■■■■ 5.14
RPS20-211ENST00000524349 ERCC6Q03468 1493 aa47.14■■■■■ 5.14
RPS20-211ENST00000524349 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.82■■■■■ 5.09
RPS20-211ENST00000524349 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.72■■■■■ 5.07
RPS20-211ENST00000524349 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.69■■■■■ 5.06
RPS20-211ENST00000524349 CUX2O14529 1486 aa46.64■■■■■ 5.06
RPS20-211ENST00000524349 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.59■■■■■ 5.05
RPS20-211ENST00000524349 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.49■■■■■ 5.03
RPS20-211ENST00000524349 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.43■■■■■ 5.02
RPS20-211ENST00000524349 CFTRP13569 1480 aa46.29■■■■■ 5
RPS20-211ENST00000524349 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.24■■■■■ 4.99
RPS20-211ENST00000524349 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.19■■■■■ 4.98
RPS20-211ENST00000524349 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.16■■■■■ 4.98
RPS20-211ENST00000524349 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.15■■■■■ 4.98
RPS20-211ENST00000524349 WDR62O43379 1518 aa45.98■■■■■ 4.95
RPS20-211ENST00000524349 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.83■■■■■ 4.93
RPS20-211ENST00000524349 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.8■■■■■ 4.92
RPS20-211ENST00000524349 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.76■■■■■ 4.92
RPS20-211ENST00000524349 PRDM2Q13029 1718 aa45.74■■■■■ 4.91
RPS20-211ENST00000524349 TOPBP1Q92547 1522 aa45.38■■■■■ 4.86
RPS20-211ENST00000524349 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.24■■■■■ 4.83
RPS20-211ENST00000524349 ABCC8Q09428 1581 aa45.23■■■■■ 4.83
RPS20-211ENST00000524349 IFT140Q96RY7 1462 aa45.17■■■■■ 4.82
RPS20-211ENST00000524349 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.11■■■■■ 4.81
RPS20-211ENST00000524349 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.98■■■■■ 4.79
RPS20-211ENST00000524349 CUX1P39880 1505 aa44.91■■■■■ 4.78
RPS20-211ENST00000524349 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.87■■■■■ 4.77
RPS20-211ENST00000524349 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.86■■■■■ 4.77
RPS20-211ENST00000524349 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.83■■■■■ 4.77
RPS20-211ENST00000524349 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.82■■■■■ 4.77
RPS20-211ENST00000524349 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.81■■■■■ 4.762e-9■■■■□ 21.3
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RPS20-211ENST00000524349 OSCARQ8IYS5 282 aa44.74■■■■■ 4.75
RPS20-211ENST00000524349 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.69■■■■■ 4.74
RPS20-211ENST00000524349 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.47■■■■■ 4.71
RPS20-211ENST00000524349 FBLN2P98095 1184 aa44.45■■■■■ 4.71
RPS20-211ENST00000524349 SYNJ1O43426 1573 aa44.39■■■■■ 4.7
RPS20-211ENST00000524349 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.36■■■■■ 4.69
RPS20-211ENST00000524349 WDR97A6NE52 1622 aa44.35■■■■■ 4.69
RPS20-211ENST00000524349 TOP2BQ02880 1626 aa44.33■■■■■ 4.69
RPS20-211ENST00000524349 CHD1O14646 1710 aa44.31■■■■■ 4.68
RPS20-211ENST00000524349 TRIM41Q8WV44 630 aa44.31■■■■■ 4.68
RPS20-211ENST00000524349 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.3■■■■■ 4.68
RPS20-211ENST00000524349 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.3■■■■■ 4.68
RPS20-211ENST00000524349 GRIN2BQ13224 1484 aa44.29■■■■■ 4.68
RPS20-211ENST00000524349 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.26■■■■■ 4.68
RPS20-211ENST00000524349 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.17■■■■■ 4.66
RPS20-211ENST00000524349 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.16■■■■■ 4.66
RPS20-211ENST00000524349 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.15■■■■■ 4.66
RPS20-211ENST00000524349 PBRM1Q86U86 1689 aa44.12■■■■■ 4.65
RPS20-211ENST00000524349 SYNJ2O15056 1496 aa44.04■■■■■ 4.64
RPS20-211ENST00000524349 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.04■■■■■ 4.64
RPS20-211ENST00000524349 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.04■■■■■ 4.64
RPS20-211ENST00000524349 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.04■■■■■ 4.64
RPS20-211ENST00000524349 ARHGEF11O15085 1522 aa44■■■■■ 4.63
RPS20-211ENST00000524349 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.83■■■■■ 4.61
RPS20-211ENST00000524349 ADAMTS12P58397 1594 aa43.8■■■■■ 4.6
RPS20-211ENST00000524349 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.74■■■■■ 4.59
RPS20-211ENST00000524349 GRIN2AQ12879 1464 aa43.73■■■■■ 4.59
RPS20-211ENST00000524349 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.73■■■■■ 4.59
RPS20-211ENST00000524349 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.72■■■■■ 4.59
RPS20-211ENST00000524349 ARAP1Q96P48 1450 aa43.64■■■■■ 4.58
RPS20-211ENST00000524349 CEP170Q5SW79 1584 aa43.55■■■■■ 4.56
RPS20-211ENST00000524349 KIF27Q86VH2 1401 aa43.55■■■■■ 4.56
RPS20-211ENST00000524349 NUP160Q12769 1436 aa43.53■■■■■ 4.56
RPS20-211ENST00000524349 IGF1RP08069 1367 aa43.44■■■■■ 4.54
RPS20-211ENST00000524349 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.31■■■■■ 4.52
RPS20-211ENST00000524349 CUL7Q14999 1698 aa43.23■■■■■ 4.51
RPS20-211ENST00000524349 SHROOM2Q13796 1616 aa43.19■■■■■ 4.5
RPS20-211ENST00000524349 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.18■■■■■ 4.5
RPS20-211ENST00000524349 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.16■■■■■ 4.5
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