RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343262.8

RPS2-201, Transcript of ribosomal protein S2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS2, Length 985 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS2-201ENST00000343262 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.14■■■■■ 7.86
RPS2-201ENST00000343262 ABCC9O60706 1549 aa57.86■■■■■ 6.85
RPS2-201ENST00000343262 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.67■■■■■ 6.82
RPS2-201ENST00000343262 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.98■■■■■ 6.39
RPS2-201ENST00000343262 NACADO15069 1562 aa54.55■■■■■ 6.32
RPS2-201ENST00000343262 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.44■■■■■ 6.31
RPS2-201ENST00000343262 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.19■■■■■ 6.27
RPS2-201ENST00000343262 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.81■■■■■ 6.2
RPS2-201ENST00000343262 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.76■■■■■ 6.2
RPS2-201ENST00000343262 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.74■■■■■ 6.19
RPS2-201ENST00000343262 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.4■■■■■ 6.14
RPS2-201ENST00000343262 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.12■■■■■ 6.09
RPS2-201ENST00000343262 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.97■■■■■ 6.07
RPS2-201ENST00000343262 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.66■■■■■ 6.02
RPS2-201ENST00000343262 SCRIBQ14160 1630 aa52.52■■■■■ 6
RPS2-201ENST00000343262 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.26■■■■■ 5.96
RPS2-201ENST00000343262 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.13■■■■■ 5.94
RPS2-201ENST00000343262 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.1■■■■■ 5.93
RPS2-201ENST00000343262 NCAPD3P42695 1498 aa50.37■■■■■ 5.65
RPS2-201ENST00000343262 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.18■■■■■ 5.62
RPS2-201ENST00000343262 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.15■■■■■ 5.62
RPS2-201ENST00000343262 SMARCA4P51532 1647 aa50.09■■■■■ 5.61
RPS2-201ENST00000343262 SMARCA2P51531 1590 aa50.04■■■■■ 5.6
RPS2-201ENST00000343262 HMGXB3Q12766 1538 aa49.98■■■■■ 5.59
RPS2-201ENST00000343262 ERCC6Q03468 1493 aa49.96■■■■■ 5.59
RPS2-201ENST00000343262 CUX2O14529 1486 aa49.95■■■■■ 5.59
RPS2-201ENST00000343262 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.8■■■■■ 5.56
RPS2-201ENST00000343262 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.69■■■■■ 5.54
RPS2-201ENST00000343262 NESP48681 1621 aa49.64■■■■■ 5.54
RPS2-201ENST00000343262 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.61■■■■■ 5.53
RPS2-201ENST00000343262 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.43■■■■■ 5.5
RPS2-201ENST00000343262 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.28■■■■■ 5.48
RPS2-201ENST00000343262 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.2■■■■■ 5.47
RPS2-201ENST00000343262 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.02■■■■■ 5.44
RPS2-201ENST00000343262 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.98■■■■■ 5.43
RPS2-201ENST00000343262 WIZO95785 1651 aa48.82■■■■■ 5.41
RPS2-201ENST00000343262 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.81■■■■■ 5.4
RPS2-201ENST00000343262 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.58■■■■■ 5.37
RPS2-201ENST00000343262 WDR62O43379 1518 aa48.48■■■■■ 5.35
RPS2-201ENST00000343262 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.35■■■■■ 5.33
RPS2-201ENST00000343262 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.32■■■■■ 5.33
RPS2-201ENST00000343262 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.28■■■■■ 5.32
RPS2-201ENST00000343262 CFTRP13569 1480 aa48.23■■■■■ 5.31
RPS2-201ENST00000343262 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.19■■■■■ 5.31
RPS2-201ENST00000343262 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.9■■■■■ 5.26
RPS2-201ENST00000343262 TRIM41Q8WV44 630 aa47.86■■■■■ 5.25
RPS2-201ENST00000343262 PRDM2Q13029 1718 aa47.75■■■■■ 5.23
RPS2-201ENST00000343262 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.64■■■■■ 5.22
RPS2-201ENST00000343262 OSCARQ8IYS5 282 aa47.62■■■■■ 5.21
RPS2-201ENST00000343262 IFT140Q96RY7 1462 aa47.39■■■■■ 5.18
RPS2-201ENST00000343262 TOPBP1Q92547 1522 aa47.34■■■■■ 5.17
RPS2-201ENST00000343262 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.34■■■■■ 5.17
RPS2-201ENST00000343262 ABCC8Q09428 1581 aa47.21■■■■■ 5.15
RPS2-201ENST00000343262 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.15■■■■■ 5.14
RPS2-201ENST00000343262 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.08■■■■■ 5.13
RPS2-201ENST00000343262 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.05■■■■■ 5.12
RPS2-201ENST00000343262 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.05■■■■■ 5.12
RPS2-201ENST00000343262 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.05■■■■■ 5.12
RPS2-201ENST00000343262 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.95■■■■■ 5.11
RPS2-201ENST00000343262 ARHGEF11O15085 1522 aa46.88■■■■■ 5.09
RPS2-201ENST00000343262 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.88■■■■■ 5.09not detected■■■■■ 54.3
RPS2-201ENST00000343262 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.85■■■■■ 5.09
RPS2-201ENST00000343262 CHD1O14646 1710 aa46.76■■■■■ 5.08
RPS2-201ENST00000343262 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.67■■■■■ 5.06
RPS2-201ENST00000343262 SOGA1O94964 1423 aa46.62■■■■■ 5.05
RPS2-201ENST00000343262 FBLN2P98095 1184 aa46.59■■■■■ 5.05
RPS2-201ENST00000343262 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.55■■■■■ 5.04
RPS2-201ENST00000343262 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.52■■■■■ 5.04
RPS2-201ENST00000343262 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.52■■■■■ 5.04
RPS2-201ENST00000343262 CUX1P39880 1505 aa46.45■■■■■ 5.03
RPS2-201ENST00000343262 WDR97A6NE52 1622 aa46.45■■■■■ 5.03
RPS2-201ENST00000343262 ARAP1Q96P48 1450 aa46.4■■■■■ 5.02
RPS2-201ENST00000343262 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.39■■■■■ 5.02
RPS2-201ENST00000343262 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.27■■■■■ 5
RPS2-201ENST00000343262 GRIN2BQ13224 1484 aa46.25■■■■■ 4.99
RPS2-201ENST00000343262 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.23■■■■■ 4.99
RPS2-201ENST00000343262 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.22■■■■■ 4.99
RPS2-201ENST00000343262 SYNJ1O43426 1573 aa46.17■■■■■ 4.98
RPS2-201ENST00000343262 SYNJ2O15056 1496 aa46.12■■■■■ 4.97
RPS2-201ENST00000343262 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.07■■■■■ 4.97
RPS2-201ENST00000343262 PBRM1Q86U86 1689 aa46.06■■■■■ 4.96
RPS2-201ENST00000343262 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.06■■■■■ 4.96
RPS2-201ENST00000343262 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46■■■■■ 4.95
RPS2-201ENST00000343262 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.98■■■■■ 4.95
RPS2-201ENST00000343262 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.95■■■■■ 4.95
RPS2-201ENST00000343262 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.75■■■■■ 4.91not detected■■■■□ 25.1
RPS2-201ENST00000343262 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.66■■■■■ 4.9
RPS2-201ENST00000343262 TOP2BQ02880 1626 aa45.66■■■■■ 4.9
RPS2-201ENST00000343262 GRIN2AQ12879 1464 aa45.65■■■■■ 4.9
RPS2-201ENST00000343262 ADAMTS12P58397 1594 aa45.61■■■■■ 4.89
RPS2-201ENST00000343262 NUP160Q12769 1436 aa45.51■■■■■ 4.88
RPS2-201ENST00000343262 CEP170Q5SW79 1584 aa45.5■■■■■ 4.87
RPS2-201ENST00000343262 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.49■■■■■ 4.87
RPS2-201ENST00000343262 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.45■■■■■ 4.87
RPS2-201ENST00000343262 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.41■■■■■ 4.86
RPS2-201ENST00000343262 SHROOM2Q13796 1616 aa45.34■■■■■ 4.85
RPS2-201ENST00000343262 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.08■■■■■ 4.81
RPS2-201ENST00000343262 JPH4Q96JJ6 628 aa45.02■■■■■ 4.8
RPS2-201ENST00000343262 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.98■■■■■ 4.79
RPS2-201ENST00000343262 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP44.87■■■■■ 4.77
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