Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 AL133352.1-204ENST00000528174 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 311.45□□□□□ -0.583e-7■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 RPS6KB2-208ENST00000526268 787 ntTSL 322.69■■□□□ 1.226e-8■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 RPL35-203ENST00000487431 785 ntTSL 1 (best)26.18■■□□□ 1.786e-37■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.366e-37■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 RPL35-204ENST00000493018 692 ntTSL 315.56■□□□□ 0.086e-37■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 RPL35-202ENST00000373570 493 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.66e-37■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.827e-10■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.667e-10■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.363e-9■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.137e-10■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 RNF121-207ENST00000526549 2375 ntTSL 215.6■□□□□ 0.097e-10■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.592e-7■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.258e-10■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 TNNT1-214ENST00000589745 529 ntTSL 218.19■□□□□ 0.55e-8■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 USF2-208ENST00000596380 550 ntTSL 319.94■□□□□ 0.782e-7■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 USF2-209ENST00000597671 464 ntTSL 57.91□□□□□ -1.142e-7■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 PUM1-202ENST00000373741 4242 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.353e-15■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.163e-15■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 PUM1-211ENST00000498419 3068 ntTSL 57.44□□□□□ -1.223e-15■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.283e-15■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 COPE-210ENST00000600528 261 ntTSL 311.61□□□□□ -0.554e-11■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 RPL9-205ENST00000503277 769 ntTSL 29.74□□□□□ -0.853e-31■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.172e-7■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 EMC2-204ENST00000519450 2736 ntTSL 23.8□□□□□ -1.82e-7■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.621e-38■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 SSBP1-204ENST00000465167 517 ntTSL 57.07□□□□□ -1.281e-38■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 C1orf123-202ENST00000470385 1009 ntTSL 1 (best)27.13■■□□□ 1.932e-6■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.492e-6■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 C1orf123-205ENST00000483739 1912 ntTSL 29.76□□□□□ -0.852e-6■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.923e-7■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 SNRPD3-204ENST00000439775 640 ntTSL 319.77■□□□□ 0.761e-10■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.51e-10■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 SNRPD3-203ENST00000404603 715 ntTSL 59.87□□□□□ -0.831e-10■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 SNRPD3-202ENST00000402849 567 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.041e-10■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 RPL14-206ENST00000465280 616 ntTSL 218.41■□□□□ 0.543e-77■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.233e-8■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.975e-7■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.95e-7■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.465e-7■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 CD55-211ENST00000635614 1145 ntTSL 512.61□□□□□ -0.395e-7■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 CD55-208ENST00000476590 2163 ntTSL 1 (best)4.71□□□□□ -1.665e-7■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.271e-9■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.171e-9■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.151e-9■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.833e-15■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 RPL21-207ENST00000473558 551 ntTSL 215.91■□□□□ 0.147e-22■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.811e-6■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.487e-15■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 SNRNP25-206ENST00000481947 1260 ntTSL 513.68□□□□□ -0.227e-8■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 SNRNP25-205ENST00000466183 1130 ntTSL 210.16□□□□□ -0.787e-8■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 CHTF8-206ENST00000519534 723 ntTSL 212.66□□□□□ -0.383e-9■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 COX6A1-202ENST00000549525 767 nt7.6□□□□□ -1.193e-14■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 BUD31-206ENST00000466798 820 ntTSL 211.81□□□□□ -0.524e-10■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 BUD31-209ENST00000496696 585 ntTSL 24.96□□□□□ -1.624e-10■■■□□ 18.4
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PABPC4Q13310 RPL17-222ENST00000617346 795 ntTSL 512.73□□□□□ -0.374e-7■■■□□ 18.4
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PABPC4Q13310 RPL17-208ENST00000580261 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.084e-7■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 RPL17-217ENST00000583036 576 ntTSL 37.23□□□□□ -1.254e-7■■■□□ 18.4
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PABPC4Q13310 ATP6V1G2-DDX39B-201ENST00000376185 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.354e-35■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 DDX39B-214ENST00000458640 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.414e-35■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 DDX39B-202ENST00000396172 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.574e-35■■■□□ 18.4
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PABPC4Q13310 DDX39B-217ENST00000474961 974 ntTSL 210.97□□□□□ -0.654e-35■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 DDX39B-216ENST00000462421 618 ntTSL 310.82□□□□□ -0.684e-35■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 DDX39B-221ENST00000484566 857 ntTSL 510.62□□□□□ -0.714e-35■■■□□ 18.4
PABPC4Q13310 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.546e-11■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.516e-11■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.346e-11■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.286e-11■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 TNFRSF1A-205ENST00000534885 2069 ntTSL 1 (best)22.91■■□□□ 1.261e-20■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.126e-11■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11e-20■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.16e-11■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.076e-11■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 CAPN15-203ENST00000565010 1952 ntTSL 1 (best)20.84■□□□□ 0.936e-9■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 SBF1-205ENST00000470434 2139 ntTSL 520.7■□□□□ 0.96e-11■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.766e-9■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.736e-11■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 SNX12-203ENST00000465030 946 ntTSL 219.56■□□□□ 0.726e-11■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.626e-11■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 C19orf47-201ENST00000357884 1774 ntTSL 518.73■□□□□ 0.594e-7■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.536e-11■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.526e-11■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 SBF1-204ENST00000418590 1578 ntTSL 1 (best)18.09■□□□□ 0.496e-11■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 CAPN15-204ENST00000566977 279 ntTSL 517.31■□□□□ 0.366e-9■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.276e-11■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.096e-11■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.056e-11■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 SNX12-205ENST00000490561 862 ntTSL 1 (best)15.38■□□□□ 0.056e-11■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.021e-6■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.146e-11■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 SNX12-207ENST00000622277 2422 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.156e-11■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 RAC1-205ENST00000495499 615 ntTSL 214.11□□□□□ -0.156e-11■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 IWS1-203ENST00000412979 441 ntTSL 312.99□□□□□ -0.331e-6■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 PDXDC1-217ENST00000570001 4828 ntTSL 212.94□□□□□ -0.346e-11■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 PDXDC1-202ENST00000396410 4521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.366e-11■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 MAP1A-201ENST00000300231 10258 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.366e-11■■■□□ 18.3
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