Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 LINC00843-201ENST00000429104 562 ntTSL 56.85□□□□□ -1.316e-7■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 IFNGR1-202ENST00000414770 748 ntTSL 323.11■■□□□ 1.294e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CASC3-207ENST00000581849 580 ntTSL 222.56■■□□□ 1.24e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.114e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 TRA2A-204ENST00000474586 868 ntTSL 321.51■■□□□ 1.034e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 TRIM8-202ENST00000462202 891 ntTSL 521.48■■□□□ 1.034e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 EXOC3L4-205ENST00000560102 563 ntTSL 321.3■■□□□ 14e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 IFNGR1-204ENST00000478333 643 ntTSL 221.1■□□□□ 0.974e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 SIN3B-205ENST00000595049 904 ntTSL 220.94■□□□□ 0.944e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.934e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.84e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 TBC1D22A-204ENST00000394449 2048 ntTSL 520.03■□□□□ 0.84e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 BRAF-202ENST00000469930 1058 ntTSL 219.77■□□□□ 0.764e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.754e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.734e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.684e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CASC3-203ENST00000418132 1986 ntTSL 1 (best)19.16■□□□□ 0.664e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 HIBADH-203ENST00000428288 1669 ntTSL 319.08■□□□□ 0.644e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.624e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.534e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.534e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.54e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 TRAPPC9-211ENST00000521700 548 ntTSL 317.86■□□□□ 0.454e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.434e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.44e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.354e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.354e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 PTPRVP-203ENST00000638692 1189 ntTSL 1 (best)17.12■□□□□ 0.334e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.334e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.294e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CTDP1-205ENST00000590599 1762 ntTSL 216.68■□□□□ 0.264e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 BABAM1-215ENST00000601232 690 ntTSL 516.53■□□□□ 0.244e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.244e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 ZNF780A-207ENST00000595773 546 ntTSL 516.44■□□□□ 0.224e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.214e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 EXOC3L4-202ENST00000559116 460 ntTSL 516.38■□□□□ 0.214e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.24e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 IFNGR1-203ENST00000458076 753 ntTSL 316.06■□□□□ 0.164e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.164e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 SEL1L-206ENST00000557372 594 ntTSL 316.02■□□□□ 0.164e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 TRA2A-203ENST00000448549 582 ntTSL 415.95■□□□□ 0.144e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CTDP1-207ENST00000591598 3228 ntTSL 1 (best)15.92■□□□□ 0.144e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.094e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 BABAM1-210ENST00000598567 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 315.49■□□□□ 0.074e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.064e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 TRA2A-208ENST00000490942 862 ntTSL 1 (best)15.31■□□□□ 0.044e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.034e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CEP57L1-211ENST00000520610 1120 ntTSL 515.26■□□□□ 0.034e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.034e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 ZNF780A-209ENST00000599972 498 ntTSL 215.1■□□□□ 0.014e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.014e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.024e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.064e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 RNF4-210ENST00000508235 603 ntTSL 314.67□□□□□ -0.064e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.074e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CEP57L1-218ENST00000522461 575 ntTSL 414.14□□□□□ -0.154e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 RTFDC1-204ENST00000449062 852 ntTSL 514.04□□□□□ -0.164e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 HIBADH-202ENST00000425715 618 ntTSL 214□□□□□ -0.174e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CEP57L1-206ENST00000518329 812 ntTSL 213.85□□□□□ -0.194e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CEP57L1-217ENST00000521737 559 ntTSL 513.84□□□□□ -0.194e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 ESYT2-203ENST00000435514 2090 ntTSL 213.77□□□□□ -0.214e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.214e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.234e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.244e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 ACSS2-221ENST00000493250 693 ntTSL 213.42□□□□□ -0.264e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.274e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.284e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.314e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.314e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CEP57L1-224ENST00000524064 819 ntTSL 513.02□□□□□ -0.334e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 TBC1D22A-207ENST00000441162 2636 ntTSL 213□□□□□ -0.334e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CEP57L1-210ENST00000519407 598 ntTSL 312.91□□□□□ -0.344e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CEP57L1-215ENST00000521503 446 ntTSL 412.91□□□□□ -0.344e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.354e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CEP57L1-220ENST00000522608 769 ntTSL 512.83□□□□□ -0.364e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.374e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 BABAM1-204ENST00000594247 1004 ntTSL 512.76□□□□□ -0.374e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.394e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 MCM4-215ENST00000523944 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.434e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.434e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CCDC88A-214ENST00000621814 3089 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.444e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 TRA2A-209ENST00000494255 1653 ntTSL 1 (best)12.16□□□□□ -0.464e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CEP57L1-209ENST00000519286 965 ntTSL 512□□□□□ -0.494e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CTNNA1-237ENST00000523275 536 ntTSL 511.98□□□□□ -0.494e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 RTFDC1-202ENST00000357348 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.514e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 MICU1-202ENST00000398761 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.514e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CCDC88A-207ENST00000436346 9811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.524e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 CEP57L1-204ENST00000407272 1947 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.574e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 ELP2-202ENST00000351393 2453 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.594e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 SPTBN1-202ENST00000356805 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.64e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 SPTBN1-203ENST00000389980 2164 ntTSL 1 (best)11.22□□□□□ -0.614e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 MICU1-212ENST00000642044 2221 ntBASIC11.21□□□□□ -0.614e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 AL513165.2-201ENST00000544475 2999 ntTSL 1 (best)11.19□□□□□ -0.624e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 DOCK2-201ENST00000256935 6097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.624e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 ELP2-201ENST00000350494 2487 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.624e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 TPTE-205ENST00000622113 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.634e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 MCM4-209ENST00000520637 839 ntTSL 211.13□□□□□ -0.634e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 MICU1-211ENST00000635239 2215 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.634e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 MICU1-201ENST00000361114 2383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.684e-6■■■■□ 19.5
TARDBPQ13148 ELP2-204ENST00000423854 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.684e-6■■■■□ 19.5
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